土壤自净过程中细菌群落与 PAH 降解基因对 PAHs 的响应:解锁土壤修复新密码

【字体: 时间:2025年04月30日 来源:Applied Soil Ecology 4.8

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  多环芳烃(PAHs)污染土壤问题严峻。研究人员通过 32 天微宇宙实验,探究 PAH 污染土壤自净能力。结果显示 PAH 有较高消散率,还发现细菌群落结构变化及降解基因的底物特异性响应。该研究为优化 PAH 污染土壤生物修复提供依据。

  在环境的大舞台上,多环芳烃(PAHs)这个 “麻烦分子” 一直困扰着我们。PAHs 凭借着自身的疏水性和难降解性,在土壤中肆意 “扎根”,浓度范围从几 μg kg?1到数百 mg kg?1不等。它们不仅严重干扰陆地生态系统,威胁土壤生物和人类健康,还大大限制了土壤的正常使用。尽管各国已经将 PAHs 列为重点管控污染物,但土壤 PAH 污染问题依旧在全球范围内备受关注。
以往的研究大多聚焦于长期、多种 PAH 污染的情况,对比污染土壤和原始土壤。然而,不同结构的 PAHs 理化性质差异很大,土壤细菌群落对它们的反应也各不相同,而且细菌群落结构的变化还会影响细菌间的协作,改变细菌网络的关键节点。同时,携带 PAH 降解基因(PDGs)的细菌是土壤中 PAH 微生物降解的主力军,可之前的研究却很少区分不同的 PAH 降解基因对 PAHs 的响应。

为了揭开这些谜团,来自国内的研究人员开展了一项极具意义的研究。他们选择用微宇宙实验的方法,排除野外复杂变量的干扰,精确探究土壤在自净过程中,本土细菌及其携带基因对 PAH 胁迫的响应。研究人员选用了萘(NAP)、菲(PHE)和芘(PYR)这三种典型的 PAHs,将它们添加到农业土壤中,模拟 “新鲜” 的 PAH 污染土壤环境。

研究人员在这项研究中运用了多种关键技术方法。首先,构建土壤微宇宙模型,设置不同 PAH 类型和浓度梯度。其次,利用 Illumina MiSeq 高通量测序技术,全面分析微生物群落结构和功能的变化。最后,通过定量 PCR 技术,精准检测特定的 PAH 降解基因(nidA、nahAC 和 phe)的表达情况。

PAH 降解动态和 16S rRNA 基因丰度


研究结果显示,不同类型的 PAH 在土壤中的生物降解潜力差异巨大。在实验初期,污染物刚进入土壤时,微生物需要努力适应非生物胁迫。随着胁迫时间的延长,微生物逐渐适应并发挥降解作用。实验数据表明,萘(NAP)、菲(PHE)和芘(PYR)的消散率分别达到了 94.36%、72.60% 和 47.70%,这充分证明了土壤对 PAHs 具有一定的自净能力。

细菌群落结构的变化


通过高通量测序发现,PAH 暴露(10 - 100 mg kg?1)显著改变了细菌群落结构。其中,放线菌门(Actinobacterial)的一些类群,如分枝杆菌属(Mycobacterium)、红球菌属(Rhodococcus)、诺卡氏菌属(Nocardioides)等得到了富集,这些菌属都与 PAH 降解密切相关。同时,PAH 的存在还增强了细菌之间的相互作用,使得细菌群落的生态网络更加复杂。

PAH 降解基因的响应


定量 PCR 结果进一步揭示了底物特异性的基因响应。携带 nahAC 基因的放线菌优先降解萘(NAP);而在菲(PHE)和芘(PYR)的胁迫下,nidA 和 phe 基因的表达显著上调。这表明不同的 PAH 降解基因对不同的 PAHs 有着特定的响应机制。

研究结论表明,添加萘(NAP)、菲(PHE)和芘(PYR)对土壤细菌群落及其相关功能基因有着明显不同的影响。携带 nahAC 和 nidA 基因的细菌表现出底物特异性,这为理解微生物应对环境胁迫的策略提供了新的视角。该研究还强调了放线菌在 PAH 降解过程中的关键作用,为通过设计和应用微生物群落组装策略来优化 PAH 污染土壤的生物修复提供了重要的理论依据。这一研究成果发表在《Applied Soil Ecology》上,为土壤污染治理领域注入了新的活力,有望推动相关技术的进一步发展,让受 PAH 污染的土壤重焕生机。

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