利用微卫星标记(SSR)对番石榴(Psidium guajava)基因型进行分子鉴定与遗传多样性分析

本研究针对番石榴种质资源遗传背景不清、品种鉴别困难的问题，采用20个SSR标记对24份番石榴基因型（含外来品种）进行分子表征。结果显示15个高多态性标记可区分本地与外来种质，其中mPgCIR352和mPgCIR175多态性最高，mPgCIR321与果实产量相关。AMOVA表明92%变异存在于群体内，为杂交育种亲本选择提供了分子依据。

　　

番石榴作为热带美洲起源的"热带苹果"，因其丰富的营养价值和药用特性成为全球重要的经济作物。然而，其异花授粉特性导致种质高度异质化，传统形态学鉴定易受环境干扰，而种子繁殖又难以保持亲本性状一致性。更棘手的是，印度等主产区的商业化品种多源于实生苗选育，遗传背景混杂，严重制约了定向育种效率。针对这一难题，印度斯瓦米·维韦卡南达大学与希腊农业组织的联合团队在《Vegetos》发表研究，通过微卫星标记技术揭示了番石榴核心种质的遗传架构。

研究采用20个覆盖11条染色体的SSR标记，对24份包含本地品种、主栽品种和外来种质的番石榴叶片样本进行基因组DNA分析。通过PCR扩增、电泳分型和生物信息学分析，结合PowerMarker计算多态性信息含量(PIC)，利用DARwin构建系统发育树，并采用GenAlEx进行AMOVA和主坐标分析(PCoA)。

分子标记多态性分析
15个多态性SSR共检测到44个等位基因，平均每个位点2.93个等位基因。标记mPgCIR352表现最优，含6个等位基因且PIC值达0.732，而位于连锁群11的mPgCIR321(PIC=0.778)与果实产量显著相关。值得注意的是，mPgCIR175等4个标记能有效区分粉红果肉与白肉品种，为品质育种提供分子工具。

遗传结构解析
UPGMA聚类将种质分为4大分支：Clade I聚集6个粉红果肉品种（如台湾深红与Arka Kiran），遗传距离仅0.138；Clade II包含5个本地品种（Baruipur等），显示极低分化（0.004）；Clade III以Hissar Surkha等主栽品种为主；Clade IV则包含Allahabad Safeda等传统品种。PCoA前三维解释53.32%变异，明确分离本地种质（坐标轴交汇区）与主栽品种（第一象限）。

群体遗传学特征
AMOVA揭示92%遗传变异存在于群体内部，仅8%存在于群体间。结构分析（K=3）显示12个基因型纯度＞80%，其中群体II以主栽品种为核心，群体III则整合本地与外来种质，反映人工选择对遗传结构的塑造。

该研究首次系统鉴定了印度东部番石榴种质的分子特征，发现mPgCIR352等标记可作为核心标记用于品种权保护。研究证实Allahabad Safeda等主栽品种与本地种质存在显著分化，为利用野生资源拓宽遗传基础提供依据。特别值得注意的是，团队开发的SSR标记体系可准确区分表型近似的粉红果肉品种，解决了DUS测试中的鉴定难题。这些发现不仅为印度番石榴育种计划建立了分子标记辅助选择体系，其开发的跨物种通用SSR标记更为整个Myrtaceae科的遗传研究提供了新工具。