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为探究濒危物种意大利报春花（Primula palinuri Petagna）的遗传组成，研究人员运用双酶切限制性内切酶相关 DNA 测序（ddRAD-seq）技术对其进行研究。结果发现该物种种群杂合度低、种群内变异性低但种群间变异性高。这为制定保育策略提供了关键依据。
在美丽的地中海盆地，这里是生物多样性的热点地区，众多珍稀物种在此繁衍生息。然而，如同全球许多地方一样，它正遭受着严峻的挑战。栖息地退化、气候变化以及人类活动带来的巨大压力，使得当地的生物多样性急剧减少，众多物种面临着灭绝的危机。意大利报春花（Primula palinuri Petagna）便是其中之一，它是意大利南部特有的易危物种，仅分布在有限的沿海区域，生存现状岌岌可危。
此前，针对意大利报春花的研究相对较少，尤其是在其遗传多样性方面，人们知之甚少。而遗传多样性对于物种的生存和繁衍至关重要，它影响着物种的适应性和抗逆性。在制定有效的保护策略时，深入了解物种的遗传信息必不可少。为了填补这一知识空白，来自意大利多所大学的研究人员联合开展了一项深入研究，相关成果发表在《Scientific Reports》上。
研究人员运用了双酶切限制性内切酶相关 DNA 测序（ddRAD-seq）技术，对来自意大利坎帕尼亚、巴斯利卡塔和卡拉布里亚地区七个种群的 91 株意大利报春花进行了研究。该技术能够高效地获取大量的基因数据，为后续分析提供有力支持。
在样本收集阶段，研究人员精心挑选了 96 个个体，从随机选择的植株上采集新鲜叶片，并确保样本的非克隆性。采集后，样本被妥善保存并运输至实验室进行后续处理。在实验过程中，研究人员先提取样本 DNA，然后制备测序文库，再进行测序。之后，对测序数据进行严格的质量控制和分析，以获取可靠的基因信息。
研究结果令人关注。在样本测序及 SNP 发现方面，96 个样本中有 91 个通过质量控制进入分析环节，共获得 172,831,301 个读对，平均每个个体约 190 万读对，平均覆盖度为 27.78x，最终确定了 99,014 个多态性位点。
从基因组多样性和种群结构来看，各研究种群呈现出低杂合度（0.08 - 0.12）、高亲缘关系（0.20 - 0.30）和高近交系数（0.34 - 0.49）的特征。主成分分析（PCA）、混合分析（Admixture analysis）和系统发育树分析表明，这些种群可分为三个主要聚类，且聚类结果与地理采样位置大致相符，这意味着地理因素对种群的遗传结构有着显著影响。
在鉴定对遗传分化贡献最大的 SNP 时，研究人员发现 40 个 SNP 可成功区分三个种群聚类。通过 Blastx 分析，这些 SNP 与转座子相关蛋白、致病效应因子等多种蛋白相关。此外，Fst异常值分析显示，部分 SNP 与逆转录病毒相关的 Pol 多聚蛋白密切相关，且该序列在相关区域的出现频率远高于随机水平。
研究还发现，遗传距离和地理距离之间存在显著相关性（r = 0.83，p 值 = 0.001），这进一步证明了地理隔离和距离对种群遗传分化的重要作用。
综合研究结论与讨论，意大利报春花种群呈现出低杂合度、低种群内变异性和高种群间变异性的特点。这表明种群间存在明显的遗传分化，可能是由于地理隔离、栖息地碎片化以及有限的基因流导致的。尽管该研究未明确制定具体的保护策略，但为后续工作提供了关键的理论依据。在进行物种迁移规划时，必须充分考虑种群的遗传结构和适应性，避免出现远交衰退现象。同时，研究结果也凸显了保护该物种遗传多样性的紧迫性，为进一步研究物种迁移结果和混合效应提供了重要的参考，有助于制定更为科学合理的保护策略，促进意大利报春花种群的长期生存和繁衍。
