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过敏性鼻炎(AR)患病率不断攀升,其发病机制不明。研究人员开展 AR 与细胞焦亡相关研究,通过生物信息学分析等,发现 GZMA 基因与 AR 和细胞焦亡相关,或可作为治疗 AR 的新靶点,为 AR 防治提供新思路。
过敏性鼻炎(Allergic Rhinitis,AR)就像一个难缠的 “小恶魔”,在全球范围内肆意扩张,越来越多的人深受其扰。它不仅让患者频繁出现鼻塞、流涕、打喷嚏等不适症状,严重影响生活质量,还带来了沉重的经济负担。然而,尽管人们一直在努力探索,AR 的具体发病机制却如同隐藏在迷雾中,始终未被完全揭开。与此同时,细胞焦亡(Pyroptosis)作为一种新发现的程序性细胞死亡方式,逐渐进入人们的视野,研究发现它与 AR 的发病有着千丝万缕的联系,但其中的具体分子机制和潜在治疗靶点仍有待挖掘。在这样的背景下,为了深入了解 AR 的发病机制,寻找新的治疗靶点,贵州医科大学附属医院的研究人员开展了一项极具意义的研究。
研究人员从公共功能基因组学数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中筛选出与 AR 相关的数据集,包括 GSE51392、GSE43523 和 GSE44037,同时从 GeneCards 数据库获取细胞焦亡相关基因(Pyroptosis - related genes,PRGs)。随后,运用加权基因共表达网络分析(Weighted gene co - expression network analysis,WGCNA)、最小绝对收缩和选择算子(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator,LASSO)以及随机森林(Random Forest,RF)分析等生物信息学方法,对数据进行深入挖掘。此外,还构建了 AR 小鼠模型,并通过蛋白质免疫印迹(Western blot,WB)实验进行验证。
研究结果令人瞩目。在数据处理环节,成功整合并消除了数据的批次效应,使后续分析更可靠。WGCNA 分析筛选出 5 个与 AR 表型显著相关的基因模块,进一步确定了 24 个与 AR 和细胞焦亡都相关的基因。富集分析表明,这些基因主要参与细胞焦亡、先天免疫反应调节等生物学过程,涉及 NOD 样受体信号通路等关键通路。利用 ML 算法,最终确定 GZMA 基因为关键特征基因。ROC 曲线分析显示,GZMA 对 AR 具有一定的诊断价值。免疫细胞浸润分析发现,AR 患者体内多种免疫细胞比例发生变化,且 GZMA 表达与部分免疫细胞存在相关性。ssGSEA 结果显示,GZMA 功能富集于核糖体相关生物过程和信号通路。药物预测发现,注射用甲泼尼龙琥珀酸钠与 GZMA 基因表达高度相关。在 AR 小鼠模型实验中,成功诱导出 AR 症状,WB 分析证实 AR 模型组小鼠鼻黏膜组织中 NLRP3、GSDMD 和 GZMA 表达显著增加。
研究结论表明,GZMA 是与 AR 和 PRGs 相关的关键基因,它通过调节 CD8+T 细胞和调节性 T 细胞(Tregs)介导的细胞焦亡,促进 AR 的炎症进展。这一发现为 AR 的预防和治疗提供了全新的潜在靶点,意义重大。它就像在黑暗中为 AR 的研究点亮了一盏明灯,为后续开发精准治疗策略指明了方向。不过,该研究也存在一定局限性,比如共享通路未通过基础实验验证,部分疾病相关基因可能因筛选标准被排除等。但这并不影响其为 AR 研究开辟新道路,未来研究可在此基础上进一步深入探索,为攻克 AR 这一难题带来更多希望。该研究成果发表在《Scientific Reports》上,为相关领域的研究提供了重要参考。
研究中用到的主要关键技术方法包括:从 GEO 数据库获取 AR 相关数据集,从 GeneCards 数据库获取 PRGs;运用 WGCNA、LASSO 和 RF 等生物信息学算法进行数据分析;构建 AR 小鼠模型;采用 WB 实验检测相关蛋白表达水平。