自然遗传变异定量调控心率与心脏尺寸的机制研究及其在心血管疾病诊疗中的意义

【字体: 时间:2025年05月01日 来源:Nature Communications 14.7

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  研究人员针对心脏发育与功能的复杂多基因调控机制尚未解析的难题,利用近交系青鳉鱼模型开展心脏表型定量研究。通过全基因组关联分析(GWAS)定位59个心率相关位点,CRISPR-Cas9基因编辑验证12个候选基因对心率、心室发育和心律失常的因果影响,发现RRAD等新靶点与Brugada综合征等人类心脏传导障碍相关,为心血管疾病诊疗提供新思路。

  

心脏作为生命活动的核心器官,其发育与功能的精细调控一直是生命科学研究的重点领域。然而,心脏表型从健康到疾病的连续变化过程中,多基因遗传贡献的定量解析始终是未解难题。特别是在先天性心脏病(CHD)中,左心室发育不全(HLHS)等表型呈现连续变化谱系,其遗传基础复杂且受环境因素调控。传统单基因研究难以揭示这种复杂性状的遗传架构,而人类群体研究又面临个体基因组变异背景异质性的限制。

为突破这一研究瓶颈,由欧洲分子生物学实验室(EMBL)等机构组成的国际团队选择具有高度近交特性的青鳉鱼(Oryzias latipes和O. sakaizumii)作为模型系统。这些近交系代表了自然遗传变异的固定状态,能有效控制遗传背景和环境变量,为解析心脏表型的定量遗传基础提供了理想平台。研究人员聚焦心率这一核心表型指标——它综合反映了心脏电生理、形态结构和功能的整合状态,且与人类心血管疾病风险显著相关。相关研究成果发表在《Nature Communications》期刊。

研究采用四大关键技术方法:(1)建立HO5和HdrR极端表型近交系及其F2分离群体(n=1192);(2)自动化高通量心率检测系统定量胚胎心率表型;(3)全基因组测序(WGS)结合线性混合模型进行QTL定位;(4)CRISPR-Cas9和碱基编辑(evoBE4max)进行候选基因功能验证。此外还整合了心脏组织RNA测序、超声心动图和游泳隧道实验等表型分析手段。

【Heart phenotype contrasts】部分揭示,近交系HO5表现出胚胎期心率增快伴随心室发育不全,成年期出现心脏功能减退和运动耐力下降。温度梯度实验(21℃/28℃/35℃)显示HO5与HdrR菌株间存在最大表型差异,为后续遗传定位奠定基础。

【Segregation analysis】通过两代杂交策略,F1代呈现中间表型,F2代表型分布覆盖亲本范围并出现超亲分离,表明多基因累加效应。基于979,713个SNP标记的三态隐马尔可夫模型(HMM)分析,成功构建重组区块基因型矩阵。

【Genome-wide QTL mapping】鉴定出59个显著关联位点,中值分辨率达115kb。其中8-10个位点不含注释基因,提示可能存在非编码调控元件。差异表达分析发现心脏组织中1161个差异基因,为候选基因优先排序提供依据。

【Gene enrichments】功能富集分析揭示半乳糖苷结合(galactoside binding)通路显著富集,涉及6个半乳糖凝集素(Galectin)家族基因。该家族在人类心血管疾病(CVD)中参与动脉粥样硬化进程,提示潜在转化价值。

【In vivo validation】部分通过基因编辑验证12个候选基因的功能影响:ADP-核糖基水解酶样蛋白1(adprhl1)缺陷导致肌原纤维组装异常和小心室表型;Ras相关RRAD基因编辑重现Brugada综合征相关的房室传导阻滞;BTB结构域蛋白1(btbd1)和碱性亮氨酸拉链因子1(blzf1)影响心脏环化和电生理。碱基编辑独立验证实验证实表型特异性。

讨论部分强调,该研究首次在脊椎动物模型中系统解析了心率变异的定量遗传基础,发现多基因协同调控心脏发育与功能的分子机制。特别重要的是:(1)发现RRAD等已知关联位点的功能机制,为Brugada综合征等心律失常提供治疗靶点;(2)揭示adprhl1通过调控肌原纤维组装影响心室发育的新功能;(3)建立从胚胎心率到成年心脏功能的表型预测模型;(4)开发可扩展的近交系分析范式,为复杂性状遗传研究提供新思路。这些发现不仅深化了对心脏发育疾病的理解,也为心血管疾病的早期诊断和精准治疗开辟了新途径。

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