揭秘胃食管反流病与年龄相关表型的共同遗传密码:开启衰老相关疾病研究新篇

【字体: 时间:2025年05月02日 来源:Scientific Reports 3.8

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  胃食管反流病(GERD)与年龄增长关系密切,但遗传机制不明。研究人员开展 GERD 与年龄相关表型的全基因组多效性关联研究,发现二者存在遗传相关性,鉴定出多效性位点和基因。为深入了解其遗传机制及疾病防治提供依据。

  在人体这个复杂的 “小宇宙” 里,衰老就像一场无法阻挡的 “时光洪流”,伴随着各种年龄相关疾病的悄然登场。胃食管反流病(GERD)便是其中之一,它就像一个不速之客,给人们的生活带来诸多困扰。据统计,全球约 13.3% 的人饱受 GERD 之苦,在北美,这个比例更是高达 15.4%,每年美国用于治疗 GERD 的费用估计高达 100 亿美元。大家都知道,年龄增长是 GERD 的一个重要风险因素,就像岁月的车轮会慢慢磨损身体的 “零部件”,让 GERD 更容易找上门来。然而,长期以来,年龄增长究竟是如何在基因层面影响 GERD 的,这一直是医学领域的一个未解之谜,仿佛一层神秘的面纱,笼罩在科研人员的心头。
为了揭开这层面纱,来自中南大学湘雅医院等机构的研究人员勇敢地踏上了探索之旅。他们开展了一项关于胃食管反流病(GERD)和年龄相关表型的全基因组多效性关联研究,旨在挖掘二者背后共同的遗传奥秘。这项研究意义非凡,一旦成功破解,将为我们理解 GERD 的发病机制打开新的大门,也可能为预防和治疗这种疾病提供全新的思路,就像找到了一把通往宝藏的钥匙。最终,该研究成果发表在《Scientific Reports》杂志上。

研究人员在这场探索之旅中,运用了多种强大的 “科研武器”。首先,他们从公开数据库获取了 GERD 和年龄相关表型(包括脆弱指数(FI)、面部衰老(FA)、端粒长度(TL)、寿命、父母寿命(PL))的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据,并进行了严格的质量控制,排除了 MHC 区域可能干扰结果的单核苷酸多态性(SNP)。接着,利用连锁不平衡分数回归(LDSC)和高清似然推断遗传相关性(HDL)分析来探究基因组范围内的遗传相关性。然后,通过复合零假设下的多效性分析(PLACO)、功能映射和注释工具(FUMA)、贝叶斯共定位分析以及基因组注释多标记分析(MAGMA)等方法,鉴定多效性位点和基因,探索其生物学功能和组织特异性。这些数据和样本均来自具有欧洲血统的公开数据集。

下面让我们一同看看研究人员都发现了什么:

  • 遗传相关性分析:研究人员使用 LDSC 和 HDL 方法评估 GERD 与 5 种年龄相关表型之间的遗传相关性,结果发现两种方法高度一致。脆弱指数(FI)与 GERD 呈正相关,意味着 FI 越高,GERD 的发病风险可能越高;而端粒长度(TL)、父母寿命(PL)和寿命与 GERD 呈负相关。有趣的是,面部衰老(FA)与 GERD 之间未发现显著的遗传相关性。经过错误发现率(FDR)校正后,FI、TL、PL 和寿命与 GERD 的相关性仍然显著,这表明这些相关性是可靠的,并非偶然。
  • 多效性和基因组风险位点的鉴定:基于前面发现的遗传相关性,研究人员运用 PLACO 方法寻找 GERD 与 4 种年龄相关表型(FI、TL、PL 和寿命)之间潜在的多效性位点。结果发现,由于 GERD 与 FI 呈正相关,有 73 个 SNP 被确定为二者之间的多效性变异;而 GERD 与 TL 呈负相关,有 148 个多效性 SNP 被鉴定出来;在 GERD 与 PL 之间仅发现 1 个多效性 SNP,与寿命之间则未找到多效性 SNP。随后,通过 FUMA 注释确定了 23 个基因组风险位点,贝叶斯共定位分析进一步发现其中 4 个位点具有较高的共定位后验概率(PP.H4>0.7)。
  • 多效性基因和组织特异性分析:利用 PLACO 和 FUMA 确定的多效性位点,研究人员借助 MAGMA 方法总共映射出 220 个多效性基因。其中,GERD - FI 性状对有 66 个,GERD - PL 有 3 个,GERD - TL 有 151 个。功能富集分析显示,这些多效性基因参与了一些典型的衰老相关生物学通路,比如从 G1期到 S 期的细胞周期控制。组织特异性分析发现,GERD 与 FI 之间的多效性基因在大脑的一些结构中富集,如大脑皮层、前扣带回皮层和额叶皮层,但 GERD 与 TL(以及 PL)之间未发现特异性富集的组织。

在研究结论和讨论部分,研究人员发现,衰老过程复杂,年龄增长确实是 GERD 的重要风险因素。他们首次揭示了 GERD 与年龄相关表型之间存在显著的遗传相关性,尤其是脆弱指数(FI)和端粒长度(TL)。这一发现为理解 GERD 的发病机制提供了新视角,暗示 GERD 的形成可能与中枢神经系统的衰老有关。例如,研究中确定的 SCAI 和 OLFM4 基因,可能通过脑 - 肠轴在 GERD 和脆弱性之间发挥关键作用。然而,研究也存在一些局限性,比如依赖汇总数据,无法进行更细致的年龄和性别分层分析;MAGMA 基因集分析的准确性可能受多效性基因数量不足的影响;研究对象局限于欧洲血统人群,对其他人群的适用性有待进一步验证。尽管如此,这项研究仍然为未来的研究指明了方向,为开发针对衰老背景下 GERD 的靶向干预措施或治疗策略奠定了基础,就像在黑暗中点亮了一盏明灯,照亮了后续科研人员继续探索的道路。

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