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为探究巴西 HTLV-1 日本亚群（HTLV-1aJpn）的历史和传播情况，研究人员分析 381 条 HTLV-1 长末端重复（LTR）区域序列。结果发现其形成两个主要分支，估算日本分支大约在 18748 年前出现分化，证实近期移民是其引入巴西的潜在机制。
在神秘的病毒世界里，有一种名为人类 T 淋巴细胞白血病病毒 1 型（HTLV-1）的病毒，它可谓是隐藏在人体健康背后的 “暗箭”。HTLV-1 与两种严重的临床疾病紧密相关，即 HTLV-1 相关脊髓病（HAM）和成人 T 细胞白血病 / 淋巴瘤（ATL）。这种病毒在全球不少地方 “安营扎寨”，在日本南部、澳大利亚原住民地区、非洲中部和南部、加勒比群岛、美拉尼西亚以及美洲中部和南部等地，都有较高的流行水平。
HTLV-1 的基因组相当稳定，不过其长末端重复（LTR）区域却充满了多样性，就像病毒的 “个性标签”，凭借这一特点，科学家们能将它分为不同的亚型（1-a 到 1-g）和亚群。其中，世界性基因型（HTLV-1a）又可细分为六个与地理相关的亚群，在全球广泛分布。在日本，就存在跨大陆亚群（HTLV1aTC）和日本亚群（HTLV-1aJpn）。
在巴西，由于历史上的奴隶贸易和日本移民潮，这两个亚群也都出现了踪迹。日本移民自 1908 年开始大规模涌入巴西，到 20 世纪末，巴西的日裔人口多达 122 万。然而，在这庞大的日裔群体中，HTLV-1 感染问题逐渐凸显。尽管 HTLV-1 在南美洲呈地方性流行，且 HTLV-1aJpn 在巴西日裔移民及其后代中频繁出现，但关于它在巴西的引入历史却知之甚少。为了填补这一知识空白，来自巴西联邦南马托格罗索大学等机构的研究人员开启了此次研究，该研究成果发表在《Retrovirology》上。
研究人员为了深入探究 HTLV-1aJpn 在巴西的情况，采用了多种关键技术方法。首先，他们从 GenBank 数据库中检索了 381 条 HTLV-1 LTR 区域序列，其中部分来自之前研究的 111 名 HTLV 阳性的巴西日裔移民及其后代。接着，运用最大似然法（ML）和贝叶斯推断法（BA）进行系统发育和分子钟分析，还构建了中位数连接网络来评估日本亚群单倍型之间的关系。
通过系统发育分析，研究人员重建的系统发育树显示出两个主要分支，分别对应跨大陆亚群（HTLV-1aTC）和日本亚群（HTLV-1aJpn）。跨大陆亚群的序列来自多个国家的个体，不过此次研究对该亚群的采样并不完全，主要聚焦于巴西的日本亚群。而日本亚群的 220 条序列主要来自巴西和日本，还有部分来自其他国家，其中 67 条来自生活在巴西的日本人或其后代。
分子钟分析方面，利用贝叶斯评估和放松的分子钟模型，研究人员估算出日本亚群最近共同祖先（MRCA）的分化时间大约在 18000 年前（95% 最高后验密度区间：13348 - 24767 年）。这一结果表明，该亚群有着较为悠久的历史。
单倍型网络分析构建的网络显示，日本亚群有 74 个单倍型，呈现出浅分化的特征。其中一个中心单倍型（h04）频率高且地理分布广泛，很可能是祖先单倍型，其他多数单倍型从它分支而来，并且这些单倍型之间缺乏地理上的细分。
综合研究结果，研究人员得出结论：近期的移民活动很可能是 HTLV-1aJpn 引入巴西的主要机制。由于 HTLV-1 的进化速率较低，从日本带到巴西的病毒序列在短时间内还未发生明显分化。而且，日本亚群的单倍型变化模式呈现出典型的星状网络，这与近期日本向巴西的移民历史相契合，进一步支持了上述结论。
这项研究意义重大，它是巴西首次对境外最大日本人群体中 HTLV-1aJpn 的进化进行的广泛分析。研究结果不仅揭示了病毒的传播历史，也为公共卫生政策的制定提供了重要依据。鉴于 HTLV-1 在特定人群中的高流行率，加强流行病学监测、实施综合筛查策略，如系统的 HTLV-1 筛查，同时结合文化适宜的咨询和教育项目以预防性传播和家庭内传播，对于控制 HTLV-1 在不同社区的传播至关重要，有望为改善公共卫生状况发挥关键作用。
