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蜜蜂女王的长寿机制一直是科研热点,为探究肠道微生物群和年龄对其的影响,研究人员结合 16S rRNA 基因测序和转录组学展开研究。结果发现Commensalibacter melissae相对丰度与女王基因表达模式有关。该研究有助于理解宿主 - 微生物相互作用。
在神奇的蜜蜂世界里,蜜蜂女王(Apis mellifera)可谓是 “核心人物”。它不仅拥有超长的寿命,还掌控着整个蜂群的繁衍。然而,长久以来,科学家们对蜜蜂女王寿命差异背后的生物学机制困惑不已。在已知影响女王质量的诸多因素中,肠道微生物组一直未得到充分研究。但近年来,越来越多的研究表明,肠道微生物组在调节蜜蜂生理、代谢和免疫功能方面发挥着重要作用,这也引发了人们对其与女王质量和寿命关系的好奇。同时,在美国,女王相关问题已成为商业养蜂可持续发展的重大阻碍,了解肠道微生物组的作用迫在眉睫。
为了揭开这些谜团,美国农业部农业研究服务局(USDA - ARS)Carl Hayden 蜜蜂研究中心等机构的研究人员踏上了探索之旅。他们的研究成果发表在《Animal Microbiome》上,为我们带来了全新的认知。
研究人员主要运用了 16S rRNA 基因测序和转录组学技术。样本来自美国亚利桑那州的 USDA - ARS Carl Hayden 蜜蜂研究中心(13 只)和伊利诺伊州的一家商业养蜂场(27 只)的蜜蜂女王。
研究结果如下:
- 微生物群落分析:通过对 40 只女王后肠样本的 16S rRNA 基因测序分析,发现Commensalibacter melissae(此前称为 Alpha 2.1)和Lactobacillus panisapium是女王微生物组的主要组成部分,约占后肠微生物群总量的 73%。年轻女王的Commensalibacter melissae相对丰度显著高于年老女王,但绝对丰度并无明显差异,且年轻女王和年老女王的后肠总细菌载量相似127。
- RNA 测序和差异表达基因分析:利用 RNA 测序,研究人员根据脂肪体组织中蛋白质羰基氧化水平将 39 只女王分为 “年轻” 和 “年老” 两组,发现 680 个差异表达基因(DEGs);进一步筛选出 12 只最年轻和 12 只最年老的女王进行分析,得到 719 个 DEGs。同时,依据Commensalibacter melissae相对丰度选择 24 只女王(9 只高丰度,15 只低丰度),发现 1451 个 DEGs。通过主成分分析(PCA)发现,基因表达谱基于年龄和Commensalibacter melissae丰度呈现明显聚类,且Commensalibacter melissae丰度对女王生理的影响可能比年龄更大3411。
- 基因本体术语和 KEGG 通路分析:对年龄和Commensalibacter melissae相对丰度相关的 DEGs 进行功能注释。与年龄相关的 DEGs 主要与细胞外区域、膜和神经元保护有关;与Commensalibacter melissae丰度相关的 DEGs 功能更广泛,包括蛋白质重折叠、应激反应和长寿调节途径等。其中,KEGG 长寿调节途径中的 13 个基因与Commensalibacter melissae丰度显著相关568。
- qRT - PCR 验证:对部分基因进行 qRT - PCR 验证,发现Commensalibacter melissae的一些基因(如 TonB 依赖受体、NarK 家族硝酸盐 / 亚硝酸盐 MFS 转运蛋白和硝酸盐还原酶亚基 α)与Commensalibacter melissae相对丰度呈正相关;蜜蜂(Apis mellifera)的一些基因(如过氧化氢酶、Cu - Zn 超氧化物歧化酶、防御素 1、膜翅菌素、双氧化酶和一氧化氮合酶)与Commensalibacter melissae丰度呈不同的相关性,反映出女王生理状态与肠道微生物组组成变化的关系910。
研究结论和讨论部分指出,本研究揭示了Commensalibacter melissae在调节蜜蜂女王生理方面的重要作用,其相对丰度与女王的基因表达模式密切相关,且这种关系比年龄对基因表达的影响更为显著。不过,研究也存在局限性,如无法确定Commensalibacter melissae丰度与女王生理之间的因果关系,未充分探究其他微生物成员的作用,采样时间点单一等。但总体而言,该研究为我们理解蜜蜂女王的衰老机制和宿主 - 微生物相互作用提供了重要依据,未来研究可在此基础上进一步深入探索,有望为蜜蜂健康管理和养蜂业发展提供新的策略。