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系统性红斑狼疮中长链非编码RNA SNHG15与OTUD6B-AS1的失调:生物信息学分析与实验验证揭示其生物标志物潜力
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月03日 来源:Biochemical Genetics 2.1
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为解决系统性红斑狼疮(SLE)缺乏高效诊断标志物的问题,研究人员通过生物信息学分析结合qPCR验证,发现lncRNAs SNHG15(上调2.01倍,p=0.0011)和OTUD6B-AS1(下调0.26倍,p<0.0001)与SLE免疫紊乱及器官损伤显著相关。ROC曲线证实OTUD6B-AS1具高诊断效能,为SLE精准诊疗提供新靶点。
这项研究深入探索了系统性红斑狼疮(SLE)这种复杂自身免疫病的分子机制。科研团队通过分析患者外周血单核细胞(PBMCs)的RNA测序数据,运用DAVID工具进行功能富集分析,结合STRING数据库构建蛋白质互作网络,首次揭示了两个关键长链非编码RNA(lncRNA)的异常表达模式:SNHG15如同"分子加速器"般显著上调(变化倍数=2.01,p=0.0011),而OTUD6B-AS1则像"刹车失灵"般急剧下调(变化倍数=0.26,p<0.0001)。
研究团队巧妙运用竞争性内源RNA(ceRNA)网络分析,在Cytoscape可视化平台上描绘出这些lncRNA与微小RNA(miRNA)、信使RNA(mRNA)之间错综复杂的调控关系。qPCR验证实验如同"分子测谎仪",在更大样本队列中确认了这两个lncRNA的诊断价值。特别引人注目的是,OTUD6B-AS1与血液炎症指标"共舞",而SNHG15则与肝功能指标"暗通款曲"。
受试者工作特征(ROC)曲线分析显示,这两个lncRNA尤其是OTUD6B-AS1展现出令人惊艳的诊断准确性,其曲线下面积(AUC)堪比"分子雷达"。这些发现不仅为SLE诊疗提供了新型液体活检标志物,更揭示了lncRNA调控网络在自身免疫病中的关键作用,为开发精准医疗策略开辟了新途径。
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