泰国北部仔猪A型轮状病毒（PoRVA）的分子流行病学调查：2016-2023年G5P[23]和G4P[23]基因型的崛起与罕见G2P[27]的重现

本研究针对泰国北部仔猪急性腹泻中A型轮状病毒（PoRVA）的流行与演化问题，通过7年纵向监测（2016-2023年）分析了1260份粪便样本。研究人员采用实时RT-PCR和基因分型技术，发现PoRVA感染率为24.0%，其中G5P[23]和G4P[23]成为主导基因型（合计占比57.1%），并首次报道了时隔22年重现的罕见G2P[27]毒株。该研究揭示了PoRVA基因型的动态变迁，为猪群疫苗设计和跨种传播风险预警提供了关键数据，论文发表于《BMC Veterinary Research》。

　　

在东南亚养猪业中，仔猪腹泻一直是困扰养殖户的难题，而A型轮状病毒（Rotavirus A, RVA）正是幕后黑手之一。这种病毒不仅导致仔猪生长迟缓、死亡率上升，更因其高度变异性让疫苗防控效果大打折扣。过去二十年间，泰国北部地区相继报道过G3P[19]、G4P[6]等多种PoRVA基因型，但缺乏系统性监测数据。尤其令人担忧的是，猪源RVA可能通过基因重组跨越物种屏障感染人类——2000年发现的奇特G2P[27]毒株就暗示了这种风险，但它随后神秘消失。为了揭开当代PoRVA的演化谜题，清迈大学医学院联合日本大分大学的研究团队展开了一项长达七年的追踪研究。

研究人员收集了泰国北部三省份（清迈、南奔、程逸）41个养猪场的1260份腹泻仔猪粪便样本，跨越2016-2023年（因2018年非洲猪瘟疫情中断）。通过实时荧光定量RT-PCR（RT-qPCR）检测病毒核酸，对阳性样本进行VP7（G型）和VP4（P型）基因的扩增测序，结合系统发育分析明确基因型特征。

PoRVA感染率动态变化
监测数据显示，PoRVA感染率从2016年的4.6%逐年攀升至2023年的39.6%，整体阳性率达24.0%。统计检验证实2020-2023年的感染率显著高于早期（p<0.05），暗示病毒传播力增强。

基因型分布格局重塑
在303株阳性毒株中，G5P[23]（28.7%）与G4P[23]（28.4%）共同占据主导地位，彻底颠覆了2000-2016年以G9P[23]、G4P[6]为主的旧格局。值得注意的是，G5P[23]在2017-2021年间完全消失后突然于2022年暴发（占当年50.0%），而G4P[23]也在2021年后出现激增。其他基因型如G5P[13]（9.9%）、G3P[23]（9.6%）等呈现零星分布，曾经流行的G4P[6]仅占1.7%。

跨时空重现的"幽灵毒株"
最惊人的发现来自一株G2P[27]毒株CMP200-22——它与2000年清迈分离的始祖毒株CMP034具有94.7%的VP4基因相似度。系统发育树显示，该毒株与加拿大猪源G2毒株OH365-055聚为一支，但更接近泰国历史毒株，提示其可能长期隐匿在猪群中低频传播。

这项研究首次绘制了泰国PoRVA基因型演变的完整图谱。G5P[23]/G4P[23]的崛起可能源于群体免疫压力下的抗原漂移，而P[23]（75.2%）和P[13]（22.8%）作为优势P型，暗示这些毒株已完美适应猪肠道环境。G2P[27]的重现则敲响警钟：这类罕见重组毒株可能通过"动物-人类"传播链引发公共卫生事件。论文建议将G5/G4-P[23]纳入当地疫苗候选株，并建立跨物种监测网络以防范新型重组毒株的出现。这些发现不仅为猪腹泻防控提供精准靶点，也为理解RVA跨种传播机制提供了活体模型。