PD-1阻断疗法诱导的B细胞受体多样性预测免疫治疗响应机制及临床预后研究

【字体: 时间:2025年05月03日 来源:Proceedings of the National Academy of Sciences 9.4

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  这篇研究通过单细胞转录组测序(scRNA-seq)和高清空间转录组技术,揭示了抗PD-1(aPD-1)治疗诱导的B细胞受体(BCR)克隆多样性在T细胞活化、迁移及肿瘤清除中的核心作用。研究发现,BCR多样性增强与患者总体生存率显著相关,并通过机器学习模型从基线肿瘤RNA测序数据预测治疗响应,为癌症免疫治疗提供了新型生物标志物和干预靶点。

  

Significance

免疫检查点抑制剂(如抗PD-1抗体)虽革新了癌症治疗,但患者响应率差异显著。该研究通过纵向分析局部晚期皮肤癌患者队列,结合单细胞和空间免疫受体测序,首次揭示aPD-1诱导的BCR克隆多样性是T细胞扩增、活化和患者生存率提升的关键驱动因素。这一发现为理解免疫治疗响应机制提供了全新视角。

Abstract

研究团队对接受aPD-1治疗的基底细胞癌(BCC)患者进行多组学分析,发现治疗响应者呈现BCR克隆多样性显著增加。这些BCR克隆与T细胞克隆空间共定位,促进其活化,并通过肿瘤-引流淋巴结(dLN)迁移协同增强肿瘤清除。跨癌种验证(胶质母细胞瘤、黑色素瘤等)表明BCR多样性是普适性预后标志物。此外,基线肿瘤的基因特征可预测BCR多样性诱导潜力,机器学习模型为此提供了临床转化工具。

Results

Patient Survival after PD-1 Inhibition in BCC Is Associated with Intratumoral BCR Diversification

延长随访显示,生存患者的肿瘤内BCR克隆数量显著增加(log-rank P=0.0083),而T细胞受体(TCR)多样性无此关联。BCR多样性动态变化(非静态数量)是生存率的独立预测因子。

Targeted Spatial Transcriptomics Captures Microenvironment Evolution

采用Xenium平台对35例FFPE样本进行空间转录组分析,设计480基因定制panel(含BCR/TCR V基因探针)。数据整合工具ENVI证实,BCR多样性高的样本中,CD8+ T细胞激活表型(CD69+、IFNG+)富集,且与B细胞空间共定位。

PD-1-Induced B Cell Diversity Supports CD8+ T Cell Activation

扩散映射分析显示,BCR多样性高的样本中:

  1. 恶性角质形成细胞向终末分化偏移;
  2. B细胞呈现抗原呈递表型(非浆细胞);
  3. 激活态CD8+ T细胞与BCR多样性正相关(R=0.42,FDR<0.001),且通过MHC-I通路交互。

Spatial Clonotype Tracking Reveals T-B Cell Triads

IG重链V基因匹配证实空间共定位克隆对在aPD-1治疗后同步扩增。引流淋巴结中,共定位克隆对高表达增殖标志物MKI67,且仅在缓解患者肿瘤中高表达CD39(ENTPD1)。三细胞簇分析(Triad Occurrence metric)发现淋巴结中B细胞/滤泡辅助T细胞(Tfh)/CD8+ T细胞簇富集,提示淋巴结为关键互作场所。

Induced BCR Diversity Predicts Survival Across Cancers

跨癌种荟萃分析(n=93)显示,BCR多样性诱导与生存率改善显著相关(HR=0.46,P=0.0093),静态BCR数量仅呈趋势。基线肿瘤中凝血通路基因(如F3)与BCR多样性诱导潜力相关,机器学习模型预测准确率达92.3%,且在独立黑色素瘤队列中验证其PD-1特异性预后价值(PFS P=0.00038)。

Discussion

研究阐明BCR多样性通过抗原呈递- T细胞活化轴增强免疫治疗响应,突破传统“TLS依赖”范式。引流淋巴结中B-T细胞克隆协同迁移的发现,为联合靶向治疗(如CD40/OX40激动剂)提供理论依据。基线基因特征预测模型的临床转化潜力,有望解决重复活检的实践难题。

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