低温胁迫下桃 WRKY 家族转录组研究:揭示 PpWRKY58 在抗寒机制中的关键作用

【字体: 时间:2025年05月03日 来源:Cryobiology 2.3

编辑推荐:

  低温影响桃树生长,研究人员开展桃树 WRKY 家族转录组研究。分析低温处理的耐寒桃品种转录组,发现 7029 个差异表达基因,PpWRKY58 在低温下显著上调。该研究为桃树抗寒育种提供新靶点。

  在植物的生长历程中,低温就像一个不速之客,时常给它们带来严峻的挑战。对于桃树而言,低温的影响尤为显著。在我国北方,寒冷的冬季常常让桃树饱受低温之苦,不仅生长受到抑制,果实的产量和质量也大打折扣,严重时甚至会导致桃树死亡。
WRKY 转录因子家族在植物应对低温胁迫时扮演着关键角色。然而,在桃树领域,尽管已经知晓 WRKY 家族参与其中,但具体每个成员的功能,尤其是像 PpWRKY58 这样与桃树抗寒紧密相关基因的作用机制,仍如同迷雾一般,亟待揭开。为了深入探索桃树应对低温胁迫的分子机制,培育出更耐寒的桃树品种,来自国内的研究人员开展了这项极具意义的研究。

研究人员选取了一年生的山桃(Prunus davidiana)幼苗,这些幼苗来自青州的商业果园,在温室中精心培育,确保生长状况良好。随后,对幼苗进行不同程度的低温处理,包括 5℃、-5℃、-15℃和 - 25℃,其中 5℃作为对照组。研究主要采用了转录组测序技术,通过对测序数据的深入分析,挖掘与低温胁迫相关的基因。同时,运用生物信息学和定量实时 PCR 技术,对 WRKY 家族成员的结构、功能和表达特征进行系统研究。

转录组测序结果


通过转录组测序,研究人员发现了大量的基因信息。共鉴定出 24961 个基因,其中包括 2074 个新基因;还识别出 45715 个转录本,涵盖 21861 个已知转录本和 23854 个新转录本。更重要的是,在低温处理后,发现了 7029 个差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)。这些差异表达基因显著富集在多个基因本体(Gene Ontology,GO)术语和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路中,这表明桃树应对低温胁迫的机制是多种多样的。

WRKY 家族对低温胁迫的响应


在众多转录因子家族中,ERF、MYB、bHLH、NAC 和 WRKY 家族对低温胁迫表现出显著响应。研究人员进一步聚焦于 WRKY 家族,详细分析了 38 个响应低温胁迫的 WRKY 转录因子。经过生物信息学分析,初步揭示了这些转录因子的理化性质、亚细胞定位和顺式作用元件等特征。

PpWRKY58 的功能研究


在对 WRKY 家族深入研究时,发现 PpWRKY58 在低温胁迫下表现出强烈且特异性的上调。为了进一步探究其功能,研究人员进行了酵母转化实验。结果令人惊喜,表达 PpWRKY58 的酵母在低温条件下活性增强。这一结果有力地表明,PpWRKY58 在桃树的抗寒过程中具有重要作用。

研究结论表明,低温处理后,桃树体内存在大量差异表达基因,AP2/ERF、WRKY、NAC 和 MYB 基因家族是参与桃树低温响应的关键转录因子家族。对 38 个 WRKY 家族成员的分析显示,PpWRKY58 在低温胁迫响应中发挥着重要作用。

这项研究意义重大,它揭示了桃树应对低温胁迫的分子机制,尤其是 PpWRKY58 的功能,为后续桃树抗寒育种提供了潜在的关键靶点。通过对 PpWRKY58 的深入研究,有望培育出更耐寒的桃树品种,减少低温对桃树生长和果实产量的影响,推动我国桃树种植产业的发展。该研究成果发表在《Cryobiology》上,为该领域的研究提供了重要的参考依据,也为其他植物抗寒研究提供了新思路。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号