血浆循环肿瘤 DNA 基因组特征:揭示套细胞淋巴瘤治疗反应与预后的新视角

【字体: 时间:2025年05月04日 来源:Cancer Cell International 5.3

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  套细胞淋巴瘤(MCL)治疗面临挑战,为探究循环肿瘤 DNA(ctDNA)对其治疗反应和预后的预测价值,研究人员分析 34 例 MCL 患者样本。结果显示 ctDNA 可有效检测肿瘤相关基因变异,与治疗反应和生存结局相关。该研究为 MCL 诊疗提供新方向。

  在血液肿瘤的世界里,套细胞淋巴瘤(Mantle cell lymphoma,MCL)是一种少见却极具侵袭性的 B 细胞非霍奇金淋巴瘤。它如同隐藏在身体里的 “捣乱分子”,给患者的健康带来极大威胁。目前,MCL 的治疗虽有多种手段,像基于利妥昔单抗的化疗、自体干细胞移植(Autologous stem cell transplantation,ASCT),以及针对复发或难治疾病的布鲁顿酪氨酸激酶(Bruton’s tyrosine kinase,BTK)抑制剂、Bcl-2 拮抗剂和抗 CD19 嵌合抗原受体疗法(Chimeric antigen receptor therapy,CAR-T)等 ,但耐药和频繁复发仍是亟待攻克的难题。
同时,现有的诊断和监测方法也存在诸多不足。传统的影像学检查,如计算机断层扫描(Computed tomography,CT)和 18 氟 - 2 - 脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描(18fluoro - 2 - deoxyglucose positron emission tomography,PET),在检测微小残留肿瘤时敏感度欠佳;而组织活检虽为诊断金标准,却具有侵入性,且难以捕捉肿瘤的时空异质性。在这样的困境下,液体活检技术应运而生,其中循环肿瘤 DNA(Circulating tumor DNA,ctDNA)备受关注。不过,ctDNA 在 MCL 中的临床应用,如预测治疗反应和预后等方面,还缺乏深入研究。

为了打破这些困境,中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院(湖南省肿瘤医院)等机构的研究人员开展了一项重要研究。他们对 34 例接受一线化疗免疫治疗的 MCL 患者进行了深入探究,分析了患者的基线组织和血浆样本,旨在挖掘 ctDNA 在 MCL 诊疗中的潜在价值。最终,研究取得了一系列重要成果,相关论文发表在《Cancer Cell International》上。

研究人员在开展这项研究时,运用了多个关键技术方法。首先,收集了 2020 年 1 月至 2022 年 12 月在参与医院确诊为 MCL 的患者样本,这些患者需满足一系列严格的纳入和排除标准。接着,对样本进行处理,提取基因组 DNA 和血浆中的 ctDNA,并构建文库用于测序。采用下一代测序(Next - generation sequencing,NGS)技术对样本进行基因检测,通过多种软件对测序数据进行处理和分析,以确定基因变异情况。同时,运用多种统计分析方法,评估 ctDNA 与治疗反应和预后的相关性。

下面来详细看看研究结果:

  • 患者特征:研究纳入的 34 例 MCL 患者,中位年龄 59 岁,多数患者处于疾病晚期(IV 期占 94.1%),且多为经典亚型(79.4%)。根据治疗反应分为完全缓解(Complete response,CR)组和非 CR 组,非 CR 组患者的 MIPI 评分、血清乳酸脱氢酶(Lactate dehydrogenase,LDH)和 β2- 微球蛋白水平更高。
  • MCL 的基因组特征:通过对 31 例患者的组织样本进行基因组分析,发现 MCL 中常见的突变基因有 CCND1(93.5%)、ATM(48.4%)、KMT2D(25.8%)等。亚型分析显示,CDKN2A 突变、BCR 和 TCR 信号通路及 PI3K 通路改变在母细胞样亚型中更常见;ATM 突变在 MIPI 低评分患者中更普遍,而表观遗传染色质重塑通路改变在 MIPI 高评分患者中更常见 。此外,TP53、TRAF2 等基因突变与较短的无进展生存期(Progression - free survival,PFS)和总生存期(Overall survival,OS)相关,ATM 突变则与较长的 PFS 和 OS 相关。
  • ctDNA 对肿瘤特异性遗传异常的捕获能力:血浆 ctDNA 能有效捕获肿瘤特异性遗传变异,如 CCND1 融合和 ATM、KMT2D、TP53 突变等。对比配对样本,ctDNA 检测体细胞变异的敏感度较高,对结构变异(Structural variant,SV)的敏感度达 96.6%,且在检测复发突变和临床可操作基因方面表现出色,多数患者血浆和组织样本在检测基因变异上有 “中等” 及以上的一致性 。
  • 血浆 ctDNA 与 MCL 治疗反应的相关性:血浆 ctDNA 水平与多种临床特征相关,CR 患者的 ctDNA 水平显著低于非 CR 患者。TP53 突变和 BCR/TLR 信号通路改变在非 CR 患者中更常见,ctDNA 水平在区分 CR 和非 CR 患者时特异性达 100% 。
  • 预处理 ctDNA 在 MCL 中的预后价值:通过 Cox 回归分析发现,多种基于血浆 ctDNA 的特征与 PFS 和 OS 相关,如 ctDNA 水平、TP53 突变等。在外部数据集中也验证了部分基因变异与预后的关系,但由于样本差异等因素,部分结果存在差异。
  • 动态 ctDNA 变化预测分子复发:对部分患者进行纵向 ctDNA 监测发现,ctDNA 动态变化与临床结果密切相关。如患者 Pt_48 在疾病进展时 ctDNA 持续阳性且变异等位基因频率(Variant allele frequency,VAF)增加;患者 Pt_03 在维持治疗后 ctDNA 转阴且无疾病进展 。

综合来看,研究结论表明血浆 ctDNA 是一种极具潜力的生物标志物,能无创地捕获与 MCL 治疗反应和生存结局相关的肿瘤源性遗传变异。它为 MCL 的诊断、复发预测和监测提供了有力支持,有助于制定更有效的个性化治疗策略。不过,该研究也存在一些局限性,如样本量小、单中心设计、ctDNA 检测拷贝数变异(Copy number variant,CNV)能力有限等。未来还需开展更大规模、多中心的研究,开发更敏感的检测方法,以进一步验证和拓展这些发现,为 MCL 患者带来更多的希望和更好的治疗效果。

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