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乳腺癌(BC)预后差,现有治疗存在局限。研究人员开展 “凝血相关长链非编码 RNA(lncRNA)特征预测乳腺癌预后和免疫特征” 的研究。构建的模型能区分高低风险患者,高风险患者免疫治疗反应可能更好,该研究为 BC 个性化免疫治疗提供新工具。
在当今社会,乳腺癌严重威胁女性健康,如同隐藏在黑暗中的 “健康杀手”。尽管医学不断进步,诊断和治疗手段日益丰富,但乳腺癌患者的预后情况依旧不容乐观。目前,主要治疗方式如手术、化疗、内分泌治疗和靶向治疗,虽有一定效果,却难以彻底攻克这一难题。例如,三阴乳腺癌(TNBC)对传统术后辅助放化疗反应不佳,残留的转移性病灶常常导致肿瘤复发。而且,部分患者对分子靶向治疗也没有明显效果,其中的耐药机制更是谜团重重。与此同时,静脉血栓栓塞(VTE)作为癌症相关发病和死亡的主要原因之一,与癌症关系密切,凝血系统功能障碍影响着疾病进程和预后。在癌症研究领域,非编码 RNA 的作用逐渐受到关注,尤其是长链非编码 RNA(lncRNA),其在癌症的发生、发展过程中扮演着重要角色,但在乳腺癌中,与凝血相关的 lncRNA 研究却极为匮乏。在这样的背景下,浙江大学医学院附属邵逸夫医院的研究人员开展了一项意义重大的研究,该研究成果发表在《Discover Oncology》上。
研究人员为了深入探究凝血相关基因(CRGs)及其关联的 lncRNA 在乳腺癌中的作用,分析了来自癌症基因组图谱(TCGA)数据库中 1045 名乳腺癌患者的转录组数据。他们运用了多种关键技术方法,首先从 TCGA 数据库获取 RNA 表达谱和临床记录,通过严格的纳入和排除标准筛选样本。接着利用 Pearson 相关性分析筛选 CRGs 相关 lncRNA ,运用单变量 Cox 分析、LASSO 回归和多变量 Cox 分析构建预后风险模型 ,并通过多种数据集进行内部和外部验证。此外,还借助 GO 分析、单样本基因集富集分析(ssGSEA)等对模型进行功能分析,探究其与肿瘤免疫微环境(TME)和免疫治疗反应的关系。
研究结果主要如下:
- CRGs 相关 lncRNA 的识别:通过分析发现,CRGs 在乳腺癌组织和正常组织中的表达存在显著差异,多数在乳腺癌组织中高表达。研究人员成功识别出 427 个 CRGs 相关 lncRNAs,并通过 Sankey 图展示了它们的共表达网络1。
- 预后风险模型的构建与验证:经一系列分析,构建出包含 8 个 CRGs 相关 lncRNAs 的预后风险模型。该模型可将患者分为高、低风险组,高风险组总生存期更低。在训练集、测试集和合并队列中都显示出良好的预测准确性和稳定性,1 年 AUC 值超过 0.7923。
- 模型与临床特征评估:风险评分的 AUC 大于其他临床病理特征,是影响乳腺癌患者预后的独立风险因素,在预测乳腺癌预后方面比其他指标更具优势4。
- 肿瘤免疫微环境和免疫治疗反应评估:差异表达基因(DEG)分析显示,相关基因富集在免疫调节和凝血 - TME 串扰相关通路。高风险组 PD-L1 和 CTLA4 上调,TIDE 评分更低,TMB 评分更高,提示对免疫治疗反应可能更好。同时,不同风险组的免疫细胞浸润和免疫功能存在差异5。
- 潜在靶向药物的识别:药物敏感性分析发现,高风险肿瘤对 EGFR 抑制剂(如 BIBW2992)更敏感,低风险肿瘤对 PI3K/mTOR 抑制剂(如 GSK2126458)反应更好,且 BIBW2992 敏感性与 TP53 突变频率相关6。
在研究结论与讨论部分,该研究成功识别出 CRGs 相关 lncRNAs 并构建了预后模型,即使调整重要混杂因素后,这些 lncRNAs 仍能预测预后和免疫治疗反应,有望成为个性化治疗的生物标志物。研究还揭示了高风险肿瘤中 M2 巨噬细胞极化和 CD8+T 细胞耗竭的免疫抑制机制,进一步加深了对 CRGs 在癌症发展和抗肿瘤免疫反应中作用的理解,为改进免疫治疗技术提供了重要依据。然而,研究也存在一定局限性,如凝血相关 lncRNAs 与肿瘤免疫微环境相互作用的分子机制尚未完全阐明,风险模型需多中心前瞻性验证,缺乏多组学整合等。但总体而言,该研究为乳腺癌的研究和治疗开辟了新方向,为未来乳腺癌的个性化免疫治疗提供了极具价值的线索和理论基础,有望推动乳腺癌治疗领域取得新的突破,让更多患者受益。