基于 CSLN 与分子动力学（MD）挖掘中药靶点：释放中药潜能

为探究中药（TCM）作用机制，研究人员整合余弦相关和局部网络相似性比较（CSLN）及分子动力学（MD）模拟展开研究。发现 11-β- 羟基类固醇脱氢酶 - 1（HSD11B1）是雷公藤甲素（TP）和甘草酸（GA）协同作用的靶点，二者组合结合常数更低。该研究助力理解药物相互作用机制。

　　中药（TCM）多样的化学成分蕴含巨大治疗潜力，但这些化合物的作用机制常不明确。药物 - 靶点预测有助于确定中药的特定靶点，揭示其生物活性和作用机制。人工智能算法凭借高效、经济和强大的预测能力，成为加速药物 - 靶点相互作用分析的有效工具。为系统研究中药的相互作用机制，研究人员整合了余弦相关和局部网络相似性比较（CSLN）以及分子动力学（MD）模拟技术。CSLN 算法预测 11-β- 羟基类固醇脱氢酶 - 1（HSD11B₁）是雷公藤甲素（TP）和甘草酸（GA）协同作用的共同靶点。MD 模拟显示，TP 和 GA 都能与 HSD11B₁保持稳定相互作用，并形成一个共同的结合热点区域。表面等离子共振（SPR）实验表明，TP 和 GA 都能有效结合 HSD11B₁，结合常数分别为 29.21 μM 和 31.75 μM。二者联合使用时，结合常数为 5.74 μM。CSLN 和 MD 模拟相结合，是在计算层面初步分析和模拟中药与其靶点相互作用模式的有效工具。这些研究结果增进了人们对药物相互作用机制的理解。