新发现!红树林土壤中分离出含羊毛硫肽生物合成基因的Exiguobacterium abrahamii新菌株,开启生物技术探索新征程

【字体: 时间:2025年05月06日 来源:Antonie van Leeuwenhoek 1.8

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  为明确从印度泰米尔纳德邦皮查瓦拉姆河口分离出的Exiguobacterium新菌株 TBG - PICH - 001T的分类地位,研究人员采用多相分类法研究。结果表明其为新物种,命名为Exiguobacterium abrahamii sp. nov.,该研究有助于探索生物技术应用。

  Exiguobacterium属的细菌以能适应极端环境而闻名,是生物技术应用的宝贵候选对象。在本研究中,研究人员从印度泰米尔纳德邦皮查瓦拉姆河口分离出一种名为 TBG - PICH - 001TExiguobacterium新菌株,并对其展开研究。研究人员运用表型、基因型和化学分类学相结合的多相分类法(polyphasic approach)对该菌株进行表征。形态学和生化特征显示,这是一种革兰氏阳性(Gram - positive)、能运动、杆状且不形成芽孢的细菌,还呈现出特征性的黄色色素沉着。通过全基因组测序和注释发现,其鸟嘌呤和胞嘧啶(G + C)含量为 47%。基于 16S 核糖体 RNA(rRNA)基因的系统发育分析表明,TBG - PICH - 001T菌株与E. acetylicum菌株 DSM 20416(NR_043479.1:1–1550)、E. indicum菌株 HHS31(NR_042347.1:1–1502)以及E. enclense菌株 NIO - 1109(NR_178487.1:1–1415)亲缘关系较近。数字 DNA - DNA 杂交(dDDH)证实该菌株属于Exiguobacterium属。脂肪酸分析显示,其主要脂肪酸为 C16.0(30.95%),其次是异 C15.0(12.87%)、异 C13.0(11.91%)、C18.0(11.06%)、反异 C13.0(10.39%)、异 C17.0(8.55%)、反异 C15.0(3.22%)和 C14.0(2.49%) 。该菌株对低温和高盐浓度具有抗性。基因组分析发现其中存在应激反应基因和转运蛋白,这表明该菌株能很好地适应恶劣环境。通过抗微生物次级代谢产物生物合成基因簇分析工具(AntiSMASH)对基因组进行分析,发现存在羊毛硫肽(lantipeptide)生物合成基因,意味着该菌株有产生抗菌化合物的潜力。综合生化、基因型和化学分类学特征,有力地支持了 TBG - PICH - 001T菌株是Exiguobacterium属的一个新物种,并将其命名为Exiguobacterium abrahamii sp. nov.。这项研究增进了人们对Exiguobacterium属多样性及其对不同环境适应性的理解,为生物技术探索开辟了新途径。
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