揭秘 DNA 甲基化调控肝癌关键癌基因,苍术内酯 I 抗癌新发现
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时间:2025年05月06日
来源:Human Cell 3.4
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为解决肝癌关键癌基因及治疗新药问题,研究人员利用 UCSC 数据库数据,经多种分析筛选相关基因。发现 12 个与肝癌预后相关基因,其中 6 个甲基化状态有差异。苍术内酯 I(AT-I)可抑制 TET1,抑制肝癌细胞生长,为肝癌治疗提供新思路。
本研究旨在识别 DNA 甲基化调控的肝细胞癌(HCC)关键癌基因,并寻找治疗 HCC 的新药。研究人员从 UCSC 数据库获取 TCGA-LIHC 队列数据,运用加权基因共表达网络分析和多种机器学习算法筛选 HCC 关键预后相关基因,再依据 DNA 甲基化状态进一步筛选。发现 12 个与 HCC 预后相关的关键基因,其中 6 个在 HCC 组织中存在甲基化状态差异,分别是 AKR1B10、ALPK3、NQO1、NT5DC2、SFN 和 SPP1。去甲基化关键介质 Ten-eleven translocation 1(TET1)在 HCC 细胞系中过表达,通过 qPCR、甲基化特异性聚合酶链反应、细胞活力测定、蛋白质免疫印迹(Western blot)等实验,探究其生物学功能及对癌基因的调控作用。研究发现,TET1 正调控 ALPK3 和 NT5DC2 的表达水平,TET1 过表达会增强 HCC 细胞的活力和干性。利用分子对接评估苍术内酯 I(AT-I)与 TET1 的结合亲和力,通过体内外模型检测 AT-I 的抑癌功能。结果显示,AT-I 与 TET1 结合亲和力良好,能抑制 TET1 活性,促进 ALPK3 和 NT5DC2 启动子区域甲基化,降低其表达,进而抑制 HCC 细胞生长。总之,DNA 甲基化促进 HCC 进展,而 AT-I 通过抑制 TET1 介导的异常 DNA 去甲基化,抑制 HCC 细胞的恶性行为。
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