空间组学FiNi-seq技术发现抗衰精准靶点

【字体: 时间:2025年05月06日 来源:Nature Aging 17

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  衰老过程中,衰老细胞的特性、多样性及其对组织微环境的影响尚不明确,且易在常规分析中被忽视。研究人员开展基于组织物理特性富集衰老相关纤维化微环境的研究,利用纤维化微环境富集测序(FiNi-seq)发现衰老表型细胞群等。该研究为预防衰老提供潜在靶点。

衰老与衰老细胞(senescent cells)的积累有关,这些细胞由组织损伤反应触发,还常能逃避免疫系统的清除。在衰老组织中,这些细胞的具体特征、多样性,以及它们对组织微环境的影响,在很大程度上还未被探索。尽管单细胞和空间组学技术取得了进展,有助于理解复杂的组织结构,但由于衰老细胞数量稀少,以及当前组学工具存在技术偏差,在一般分析流程中,衰老细胞群体常被忽视。

在此,研究人员利用组织的物理特性来富集与衰老相关的纤维化微环境(fibrotic niche),并对其进行单细胞 RNA 测序(single-cell RNA sequencing)和单细胞核 ATAC 测序(single-nuclei ATAC sequencing,ATAC-seq)分析,将这种方法命名为纤维化微环境富集测序(fibrotic niche enrichment sequencing,FiNi-seq)。该方法基于组织纤维化微环境对酶消化的抗性,选择性地富集纤维化微环境,实现准空间分析。


研究人员运用 FiNi-seq 技术,对雄性小鼠的年轻和年老肝脏进行分析,发现了产生 Wif1 和 Smoc1 的间充质细胞群体呈现出衰老表型,并对该纤维化微环境内的早期免疫反应展开研究。最后,FiNi-ATAC-seq 揭示了纤维化微环境细胞中富集的与衰老相关的表观遗传变化。


因此,这种准空间单细胞分析方法能够详细剖析早期衰老微环境,为预防衰老提供了潜在的治疗靶点。


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