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为探究新冠疫情期间埃及重症急性呼吸感染（SARI）患者呼吸道病原体的共感染情况，研究人员从 2020 年 10 月至 2022 年 6 月招募患者进行研究。结果显示共感染率较高，细菌和病毒共感染分别以肺炎克雷伯菌和人冠状病毒 HKU1 最常见。这对患者管理和应对未来大流行意义重大。
在新冠疫情的阴霾下，全球的医疗卫生体系都面临着巨大的挑战。重症急性呼吸感染（SARI）本就是全球范围内导致死亡的重要原因之一，在低收入和中等收入国家，它更是严重威胁着人们的健康，带来了极高的发病率和死亡率。新冠病毒（SARS-CoV-2）的出现，让情况变得更加复杂。在疫情期间，人们对于发展中国家呼吸道病原体的共同传播情况了解十分有限，而且在对有呼吸道症状的患者进行检测时，往往过度关注 SARS-CoV-2 的筛查，却忽视了其他可能引发 SARI 的病原体检测。但这些病原体的检测对于患者的有效管理至关重要，早期发现可以降低患者的死亡率和发病率。于是，为了填补这一研究空白，埃及开罗的埃及研究与再生医学中心（Egypt Center for Research and Regenerative Medicine，ECRRM）等机构的研究人员开展了一项重要研究 。
研究人员采用了多种关键技术方法。首先，从 2020 年 10 月到 2022 年 6 月，他们按照世界卫生组织（WHO）的 SARI 病例定义，从埃及开罗艾因夏姆斯大学医院的多个科室，招募了符合标准的患者，构建了样本队列。接着，采集这些患者的鼻咽拭子样本。之后，运用核酸纯化技术提取样本中的核酸，并通过实时聚合酶链反应（RT-PCR），先检测样本中是否存在 SARS-CoV-2，再使用特定的多重试剂盒检测 33 种呼吸道病原体。最后，利用统计学方法对检测结果以及患者的临床和放射学特征进行分析。
下面来看具体的研究结果：
- 患者基本信息：研究共纳入 599 名患者，其中女性 313 名（52.3%），男性 286 名（47.7%）。患者年龄跨度较大，平均年龄为 36.29 岁。多数患者（58.2%）出现发热、咳嗽等多种症状，46.4% 的患者存在如高血压、糖尿病等合并症1。
- 病原体检测情况：在 599 份检测样本中，158 份（26.4%）SARS-CoV-2 检测呈阳性。进一步检测发现，共识别出 31 种病原体，总体感染阳性率为 81.5%（488/599），共感染率为 75%（450/599）。细菌共感染率为 39%，其中肺炎克雷伯菌（K. pneumoniae）最为常见（5.3%）；病毒共感染率为 61%，人冠状病毒 HKU1（HCOV HKU1）最为常见（6.2%）23。
- 共感染情况分析：158 例 COVID-19 阳性患者中，120 例存在其他呼吸道病原体共感染；441 例 COVID-19 阴性患者中，330 例存在其他呼吸道病原体共感染。而且，共感染情况与患者年龄、合并症等因素存在关联。例如，年龄较大、患有高血压和糖尿病的患者，共感染的发生率较高45。
- 病原体分布特征：研究还发现，不同病原体的感染情况有所差异。像人类 rhinovirus 和呼吸道合胞病毒（RSV）的检测率相对较低，分别为 8.3% 和 6.8%。此外，研究中还发现了较高比例的真菌共感染，主要是耶氏肺孢子菌（P. jirovecii），这可能与 SARS-CoV-2 感染导致的免疫缺陷有关6。
研究结论和讨论部分意义重大。研究结果表明，在埃及新冠疫情期间，SARI 患者中呼吸道病原体的共感染情况较为普遍。这一发现提示医生在临床诊断和治疗过程中，不能仅仅关注 SARS-CoV-2，还需要对其他呼吸道病原体进行检测，以便更准确地诊断病情、及时治疗患者，并采取合适的隔离措施。同时，研究中发现的共感染与患者病情严重程度、入住重症监护病房（ICU）以及死亡率之间的关联，也为临床医生评估患者预后提供了重要参考。此外，该研究还强调了多重 PCR 技术在呼吸道感染病因诊断中的重要性，虽然其成本较高，但从整体医疗成本和患者管理的角度来看，它能够减少住院时间、降低抗生素使用，对未来应对类似疫情也具有重要的意义。这项研究成果发表在《Scientific Reports》上，为全球范围内对呼吸道感染的研究提供了有价值的数据和参考，有助于推动相关领域的进一步研究和发展。
