2024年摩洛哥拉巴特麻疹病毒B3基因型分离株的编码完整基因组测序及溯源分析

来自摩洛哥的研究团队针对2024年该国麻疹疫情暴发，成功分离并完成一株麻疹病毒(MV)B3基因型毒株(MVi/Rabat.MAR/29.24)的编码完整基因组测序。该毒株与美国分离株高度同源(99.50%)，为麻疹病毒传播溯源及B3基因型分子特征研究提供了关键数据。

　　

2024年3月，摩洛哥拉巴特军事训练医院收治一名32岁女性麻疹患者，表现为发热、咳嗽及红斑疹。研究人员从鼻咽拭子样本中分离出麻疹病毒(Measles Virus, MV)，通过Vero.DogSLAM细胞培养扩增病毒后，采用NucleoSpin RNA病毒提取试剂盒获取RNA，经逆转录和分段PCR扩增（使用21对特异性引物，包括UTR5-F/MVR-1R等），最终组装获得15,896 nt的编码完整基因组。

系统发育分析显示，该毒株命名为MVi/Rabat.MAR/29.24，属于WHO定义的B3基因型，与美国弗吉尼亚州分离株MVs/Virginia.USA/40.21/3[B3]基因组相似度达99.50%。基因组编码6个结构蛋白（核衣壳蛋白N、磷蛋白P、基质蛋白M、融合蛋白F、血凝素蛋白H、大聚合酶蛋白L）和2个非结构蛋白（V、C），其进化树通过邻接法构建，自展值500次重复验证。

该研究采用Illumina测序平台和Ugene软件进行序列组装，为理解麻疹病毒B3基因型的跨洲传播及分子流行病学研究提供了重要参考。研究获得穆罕默德六世健康与科学基金会支持，并采用英国皮尔布赖特研究所提供的Vero.DogSLAM细胞系完成病毒分离。