探秘贵州附地菜(Trigonotis cavaleriei)叶绿体基因组:解锁紫草科植物进化密码
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时间:2025年05月07日
来源:Russian Journal of Plant Physiology 1.1
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附地菜(Trigonotis cavaleriei)具食用和药用价值,但其叶绿体基因组特征不明。研究人员利用 Illumina NovaSeq 6000 平台测序、组装、注释其叶绿体基因组。结果显示该基因组长度 148554bp,GC 含量 37.60% ,含 112 个基因。此研究有助于明晰紫草科进化关系。
附地菜(Trigonotis cavaleriei)是紫草科(Boraginaceae)的代表物种,因其食用和药用特性而闻名。然而,附地菜的叶绿体基因组(chloroplast genome)特征尚不明确。在这项研究中,研究人员使用 Illumina NovaSeq 6000 平台对附地菜完整的叶绿体基因组进行测序。随后,对该基因组进行组装、注释,并开展比较分析。结果表明,附地菜叶绿体基因组长度为 148554 碱基对(base pairs,bp),GC 含量为 37.60%。该环状基因组呈现典型的四分体结构,包含 112 个基因,其中有 4 个核糖体 RNA(ribosomal RNA,rRNA)基因、30 个转运 RNA(transfer RNA,tRNA)基因和 85 个蛋白质编码基因。系统发育树显示,附地菜属(Trigonotis)物种分为两个分支。附地菜与宽叶附地菜(T. laxa)亲缘关系较近,且与紫草科的狼紫草(Lappula myosotis)分属不同分支。对附地菜叶绿体基因组的分析,有助于更全面地理解紫草科植物间的进化关系。
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