揭示家禽与人类中未充分研究的沙门氏菌血清型基因组景观及其对食品安全的影响

来自巴西的研究人员针对沙门氏菌(Salmonella)血清型遗传多样性机制不明的问题，通过分析301株人源与动物源S. enterica基因组及10株蛋鸡粪便分离株，系统解析了耐药基因(如gyrA/parC突变)、毒力因子(SPI-10/SGI-1/CS54)和质粒分布特征。研究发现48%的52种耐药基因为人禽共患，首次报道了S. Braenderup携带SPI-10，揭示了161/271核心毒力基因的保守性与血清型特异性分布规律，为防控耐多药沙门氏菌提供了关键基因组学证据。

　　

沙门氏菌属(Salmonella)作为重要人畜共患病原体，其部分血清型的遗传进化机制仍存在知识空白。一项基于311株肠炎沙门氏菌(S. enterica)的全基因组研究（包含巴西蛋鸡粪便分离的10株新测序菌）揭示了令人警觉的耐药基因图谱：在52种检测到的抗菌素耐药基因(ARGs)中，48%呈现人禽交叉传播特征，而禽源特有基因仅占21.1%，人类临床分离株则独占30.7%的独特耐药基因。值得注意的是，喹诺酮类耐药相关基因gyrA和parC的染色体突变也被预测存在。

研究首次报道了布伦登鲁普血清型(S. Braenderup)携带沙门氏菌致病岛SPI-10的罕见现象，同时在禽源施瓦岑格伦德血清型(S. Schwarzengrund)中检测到基因组岛SGI-1。CS54毒力岛则展现出严格的血清型偏好性，仅存在于圣保罗血清型(S. Saintpaul)和布伦登鲁普血清型中。质粒分析显示，圣保罗血清型的质粒多样性显著低于其他血清型。

毒力基因谱分析发现161个核心毒力基因在所有血清型中高度保守，占检测总数(271个)的59.4%，其余基因则呈现血清型特异性分布模式。这些发现凸显了家禽产业链中长期被忽视的沙门氏菌血清型所蕴含的基因组风险，尤其是其对临床常用抗菌药物的多重耐药特性，为食源性感染防控策略提供了新的分子流行病学依据。