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生菜黑根腐病由鲁氏伯克利霉菌（B. rouxiae）引起，在日本突然出现。研究人员为明确其流行病学特征，对比了生菜黑根腐病菌与其他非生菜来源菌株的遗传特性和毒力，结果发现两者存在明显差异，这有助于深入了解该病害的发生机制。
在植物的世界里，病害总是悄然而至，给农业生产带来巨大挑战。生菜，这种常见的蔬菜，近年来也遭遇了一种可怕的病害 —— 黑根腐病。自 2016 年起，由土壤传播的真菌鲁氏伯克利霉菌（Berkeleyomyces rouxiae）引起的生菜黑根腐病在日本突然爆发 。患病的生菜植株生长受到抑制，根部出现棕色至黑色的病变。此前，鲁氏伯克利霉菌曾被归为 Thielaviopsis basicola（syn. Chalara elegans），后来才被重新分类。虽然在澳大利亚、美国、巴西等国家也有类似由 T. basicola 引起的生菜病害报道，但这些国家的致病菌具体属于伯克利霉菌属的哪个物种并不明确，在日本，该病菌已被确定为 B. rouxiae 。而且，在日本，B. rouxiae 此前还被报道为多种植物的病原体，如三色堇（Viola ×wittrockiana）、瓜叶菊（Pericallis ×hybrida）、烟草（Nicotiana tabacum）等。这些非生菜植物上的 B. rouxiae 菌株，是否就是导致生菜黑根腐病突然爆发的 “罪魁祸首” 呢？这成为了科研人员亟待解决的问题。
为了揭开这个谜团，日本千叶大学园艺研究生院（Graduate School of Horticulture, Chiba University）的研究人员赤里绪矢（Akari Oya）和宇佐美敏之（Toshiyuki Usami）开展了相关研究 。他们的研究成果发表在《Journal of General Plant Pathology》上，这一研究对于了解生菜黑根腐病的发病机制、制定有效的防治策略具有重要意义。
研究人员采用了多种关键技术方法。首先，运用微卫星标记技术，从不同基因组位置选取了 8 个微卫星标记（BR2、BR4、BR8、BR13、BR14、BR17、BR19 和 BR22） ，对日本不同来源的 B. rouxiae 菌株进行遗传关系分析。同时，利用 PCR 技术扩增相关基因片段，对 PCR 产物进行核苷酸测序，通过分析核苷酸序列中微卫星重复基序的重复次数，构建系统发育网络图 。此外，进行了致病性实验，用不同来源的 B. rouxiae 菌株接种生菜和秋葵（Abelmoschus esculentus），观察植株发病情况并计算病情指数 。
研究结果主要分为以下几个方面：
- 遗传关系分析：通过微卫星标记构建的系统发育图显示，日本生菜黑根腐病菌株之间遗传关系密切，与地理来源无关 。而非生菜来源的菌株在遗传上存在差异，且未发现遗传特征与分离源或地理来源之间的关系 。生菜黑根腐病菌株与任何非生菜来源的菌株都不相似。这表明，生菜黑根腐病菌株在遗传上具有独特性，与其他非生菜来源的 B. rouxiae 菌株存在明显差异。
- 致病性实验：用非生菜来源的 B. rouxiae 菌株接种生菜后，发现其引起的病害严重程度较低，显著低于生菜来源的菌株 。尽管部分非生菜来源菌株在生菜上毒力较弱，但在秋葵上却表现出较强的毒力，说明这些菌株具有致病性，只是对生菜的毒力较低 。而且，即使对非生菜来源菌株进行多次接种和再分离，其在生菜上的毒力也未增加 。这进一步证明，B. rouxiae 菌株对生菜的毒力是由遗传决定的，非生菜来源的菌株难以引发生菜黑根腐病。
研究结论表明，生菜黑根腐病菌株在遗传特征和对生菜的毒力方面，与日本其他非生菜来源的 B. rouxiae 菌株有明显区别 。这意味着之前在日本报道的非生菜来源的 B. rouxiae 菌株不太可能是生菜黑根腐病突然爆发的原因。该研究首次清晰地评估了 B. rouxiae 种内的分化情况，揭示了 B. rouxiae 对不同宿主的致病性存在差异，其对宿主的毒力并不总是一致的 。然而，目前仍不清楚导致日本生菜黑根腐病突然爆发的接种源来自何处，未来需要分析更多包括澳大利亚、美国和巴西等国的 B. rouxiae 菌株，以确定接种源，进一步深入研究 B. rouxiae 种内毒力的变化及其与不同宿主的相互作用机制。这一研究为后续深入了解生菜黑根腐病的发生发展规律、制定精准的防控措施奠定了坚实基础，对保障生菜的安全生产具有重要的实践指导意义。
