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在临床研究中,虚拟队列和计算机模拟试验(in-silico trials)面临诸多挑战,如缺乏适用统计工具。研究人员开展开发相关统计网络应用的研究。结果开发出 R 统计环境,可验证虚拟队列等。其有助于推动相关研究发展,提高临床研究效率。
在医疗领域,传统的医疗产品和设备研发流程复杂且昂贵,需历经临床前体外研究、体内动物实验和人体临床试验等多个阶段。而计算机模拟试验(in-silico trials)和虚拟队列作为新兴手段,有望解决临床研究面临的时间长、成本高以及伦理等问题,提高研究效率。比如,在药物研发中,计算机模拟试验能预测药物毒性和安全性,比动物试验更高效;在医疗器械研究中,能减少资源消耗,如 VICTRE 研究仅用约三分之一资源完成对比试验 。
然而,这一领域的发展并非一帆风顺。目前存在技术局限、模型评估不明确、监管指导缺失以及利益相关者沟通不畅等问题。其中,用于虚拟队列和计算机模拟试验分析的统计工具尤为匮乏。现有的工具,如商业的 InSilico trial 平台和开源的 QSP 工具包等,虽各有优势,但都无法完全满足研究需求。在这样的背景下,欧洲临床研究基础设施网络(ECRIN)等机构的研究人员开展了一项重要研究。
研究人员旨在开发一个通用、开放的统计环境,以支持虚拟队列的验证和计算机模拟试验的分析。为此,他们采取了一系列技术方法。首先,对现有 R 工具进行全面调研,筛选出与计算建模相关的应用。然后,组织虚拟研讨会,明确统计分析环境的需求。基于这些需求,利用 R 语言结合 R Markdown 和 Shiny 包开发出 R 统计环境,并在开发过程中采用敏捷方法,不断迭代完善。
在研究结果方面:
- 环境搭建与功能实现:成功开发出交互式网络应用 R 统计环境(版本 0.1.0),其具备多种功能。在虚拟队列验证模块,能进行单变量、双变量和多变量比较以及变异性评估。例如单变量比较时,可计算并展示虚拟和真实数据集的均值、标准差等统计信息;双变量比较通过计算变量间相关性并以热图展示。在应用验证队列模块,可进行单组评估、两组比较和样本量计算。
- 测试与验证:对 R 统计环境进行严格测试,包括代码检查、模块测试和集成测试。通过具体实例验证其有效性,如利用 Verstraeten 等人开发的虚拟队列生成器产生的数据,R 统计环境不仅重现了原始结果,还拓展了研究分析。同时,对比较两种设备的模拟数据验证表明,该环境分析结果可靠。
- 应用与实践:R 统计环境可部署在本地或通过虚拟研究环境(VRE)以软件即服务(SaaS)模式访问。在 SIMCor 项目中,虽因时间原因部分分析未在该环境进行,但评估发现其能涵盖部分基本统计分析技术。
研究结论表明,该研究开发出的开源、通用且菜单驱动的网络应用,可支持特定心血管医疗器械相关用例中虚拟队列的验证和应用,也适用于其他领域。不过,R 统计环境仍需进一步改进,如增加更多统计技术,扩大应用范围,加强与计算模型的耦合等。在讨论部分,研究人员指出,该研究成果对解决计算建模和模拟领域的可重复性危机有重要意义,通过集成报告功能,能系统完整记录研究步骤。未来应扩展该环境的标准化元数据,加强与临床数据交换标准协会(CDISC)标准的联系。总之,这项研究为虚拟队列和计算机模拟试验的发展奠定了基础,虽有不足,但为后续研究指明了方向,有望推动医疗领域研发效率的提升,在医学研究和医疗器械开发等方面具有广阔的应用前景。