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为探究能量消耗和发酵过程对酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)分泌的细胞外囊泡(EVs)特性及生理功能的影响,研究人员分析不同培养时长的 EVs。结果发现培养时长影响 EVs 特性和功能,该研究为调控 EVs 组成及应用提供策略。
在生命科学和健康医学领域,细胞外囊泡(Extracellular Vesicles,EVs)作为一种脂质双层纳米囊泡,正逐渐成为研究的焦点。EVs 能够携带核酸、蛋白质等生物活性分子,在细胞间通讯中发挥着重要作用,对多种生理过程产生影响。目前,基于 EVs 的研究在多个方面展现出巨大潜力,比如作为药物递送载体和治疗剂。然而,利用哺乳动物细胞生产 EVs 面临产量低、成本高的问题,限制了其商业化应用。同时,微生物来源的 EVs 研究尚处于起步阶段,存在诸多未知。就拿真菌来说,其细胞壁的存在使得 EVs 的分泌机制以及成分分析面临挑战,甚至连 EVs 的通用标记都尚未确立。在此背景下,开展对微生物来源 EVs 的深入研究显得尤为迫切。
为了解决上述问题,来自未知研究机构的研究人员开展了一项针对酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)分泌的 EVs 的研究。研究人员假设酿酒酵母的 EVs 能够被人类细胞内化并促进胶原蛋白合成,为验证这一假设,他们进行了一系列实验,最终发表在《BIOMATERIALS RESEARCH》上。
在研究中,研究人员主要运用了以下关键技术方法:首先,通过超速离心等方法从不同培养时长的酿酒酵母培养基中分离 EVs;利用纳米颗粒跟踪分析和生物透射电子显微镜对 EVs 的粒径、浓度等特性进行表征;运用蛋白质免疫印迹(Western blotting)分析特定蛋白质的表达;借助液相色谱 - 串联质谱(LC - MS/MS)和转录组测序分别进行蛋白质组和转录组分析;采用细胞摄取实验评估 EVs 进入细胞的效率;利用酶联免疫吸附测定(ELISA)、实时聚合酶链反应(RT - PCR)和 Western blotting 检测胶原蛋白合成相关指标。
研究结果如下:
- 酿酒酵母源 EVs 的特性表征:研究人员从不同培养时长的酿酒酵母培养基中成功分离出 EVs,分别为培养 24 小时的 EV@Y24和 72 小时的 EV@Y72。通过分析发现,在 24 小时时,培养基中的葡萄糖耗尽,标志着细胞进入稳定期;72 小时则代表长期培养,此时能量源耗尽,发酵过程延长。纳米颗粒跟踪分析显示,EV@Y72的颗粒数量约为 EV@Y24的 3 倍,但平均粒径更小。进一步研究发现,酵母培养 72 小时释放的 EVs 更多,且其 zeta 电位更高。
- EV@Y24富含晚期内体蛋白 Pep12:通过蛋白质免疫印迹分析不同培养时期酵母细胞和 EVs 的特定蛋白质表达,发现随着培养时间延长,自噬相关蛋白 Atg8 表达增加,而线粒体、内体、内质网和液泡相关蛋白表达下调。在 EVs 中,Pep12 表达随培养时间增加而降低,VMA2 和 GAPDH 表达增加,表明 EV@Y24富含内体相关的 EVs,而 EV@Y72含有更多来自各种细胞器的蛋白质。
- EV@Y24比 EV@Y72更有效地内化进入细胞:利用荧光标记和流式细胞术等方法比较不同 EVs 样品对成纤维细胞的内吞效率,结果显示 EV@Y24和 EV@Y72均能被 Hs27 细胞成功内化,但 EV@Y24的摄取效率比 EV@Y72高 71%,荧光显微镜分析也证实了这一结果。
- EV@Y24和 EV@Y72的蛋白质组分析:蛋白质组分析表明,EV@Y24和 EV@Y72分别鉴定出 223 种和 358 种蛋白质,其中 194 种蛋白质是两者共有的。GO 分析发现,EV@Y24特有的蛋白质中包含与线粒体电子传递和囊泡运输相关的蛋白;EV@Y72含有许多来自各种细胞器的蛋白质。此外,EV@Y24包含大量将乙醛还原为乙醇的酶,而 EV@Y72含有许多将乙醇转化为乙醛的酶,表明酵母 EVs 维持了宿主细胞的代谢状态。
- EV@Y24和 EV@Y72的转录组分析:转录组分析检测到 EV@Y24和 EV@Y72中分别有 1,146 种和 1,158 种 miRNA 序列,大部分序列长度为 18 - 24 nt。通过筛选差异表达的小 RNA 并进行功能分析,发现 EV@Y72可能在抑制肥胖方面更有效,且两者都可能通过靶向表皮生长因子相关过程影响胶原蛋白合成。
- EV@Y24和 EV@Y72促进 Hs27 成纤维细胞的胶原蛋白合成:研究人员用 EV@Y24和 EV@Y72处理 Hs27 成纤维细胞,通过 ELISA、RT - PCR 和 Western blotting 评估其对胶原蛋白合成的影响。结果显示,酵母源 EVs 能促进胶原蛋白 I 和 III 的合成,在浓度为 108 particles/ml 时效果最佳,且 EV@Y24的促进效果比 EV@Y72更显著。
研究结论和讨论部分指出,培养时长对酵母源 EVs 的特性和组成有显著影响。EV@Y72颗粒数量多但粒径小,可能是由于长时间培养导致 EVs 分泌增加和颗粒降解。研究首次提出 Pep12 可作为内体来源 EVs 的特异性标记,EV@Y24更具内体来源外泌体的代表性,而 EV@Y72包含更广泛的 EV 亚群。EV@Y24内吞效率更高,可能与 Pep12 以及 GPI - 锚定蛋白有关。酵母源 EVs 能上调胶原蛋白 I、III 和 MMP1 的表达,在再生医学领域具有巨大潜力。此外,转录组分析发现 EVs 中的 miRNA 可能通过调节 AKT、ERK 和 Wnt 信号通路影响胶原蛋白合成,但具体机制仍需进一步研究。
总的来说,该研究揭示了培养时长对酵母源 EVs 的重要影响,为调控 EVs 的特性和功能提供了新的策略。然而,研究存在一定局限性,如仅控制培养时长,未深入研究培养基成分等其他因素的影响,且缺乏对单个 EV 成分的机制和功能分析。未来研究可从这些方面入手,进一步深入探索酵母源 EVs 的奥秘,为其在再生医学等领域的应用提供更坚实的理论基础。