揭秘大 B 细胞淋巴瘤治疗新突破:CD8+ CAR-T 细胞的两阶段分化之旅

【字体: 时间:2025年05月07日 来源:Nature Communications 14.7

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  弥漫大 B 细胞淋巴瘤(DLBCL)治疗中,CAR-T 细胞疗法效果受其分化机制不明影响。研究人员对接受 axicabtagene ciloleucel 治疗的 DLBCL 患者的 CD8+ CAR-T 细胞展开研究,发现其存在两阶段分化,这为优化 CAR-T 细胞疗法提供依据。

  在淋巴瘤的治疗领域,弥漫大 B 细胞淋巴瘤(Diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)是美国最常见的非霍奇金淋巴瘤。对于初治难治或缓解后复发(r/r DLBCL)的患者而言,治疗选择极为有限,预后也不容乐观 。直到 2017 年,美国食品药品监督管理局批准了针对 r/r DLBCL 的自体 CD19 导向的嵌合抗原受体(Chimeric antigen receptor,CAR)T 细胞疗法,这才为患者带来了新的希望。然而,这种疗法也面临着诸多挑战,比如非缓解率较高、治疗毒性较大等问题。而且,目前人们对 CAR - T 细胞在患者体内的分化过程了解并不充分,这严重限制了 CAR - T 细胞疗法的进一步发展。因此,深入探究 CAR - T 细胞在患者体内的分化机制,对于开发更高效、低毒的 CAR - T 细胞疗法至关重要。
为了解决这些问题,来自美国芝加哥大学(University of Chicago)的研究人员 Guoshuai Cao、Yifei Hu 等开展了一项研究。他们通过对接受 axicabtagene ciloleucel 治疗且完全缓解的 7 例 r/r DLBCL 患者进行研究,发现 CD8+ CAR - T 细胞在体内会经历两个不同的克隆扩增阶段,这一发现为 CAR - T 细胞疗法的优化提供了重要依据。该研究成果发表在《Nature Communications》上。

研究人员在此次研究中运用了多种关键技术方法。他们收集了患者的外周血和输注产品样本,采用单细胞多模态分析技术,包括配对 RNA 测序(RNA-seq)、细胞索引测序(CITE-seq)和 T 细胞受体测序(TCR-seq),对样本中的 CAR - T 细胞进行分析。同时,通过构建 CD19 四聚体来分选 CAR - T 细胞,并运用流式细胞术对细胞表型进行验证。此外,还利用基因集富集分析(GSEA)、差异基因表达分析(DGEA)和调节网络分析等手段,深入探究 CAR - T 细胞的转录特征和调控机制。

下面来具体看看研究结果:

  • 研究设计和临床发现:研究人员对 7 例接受 axicabtagene ciloleucel 治疗并达到完全缓解的患者进行纵向研究。在治疗过程中的 3 个时间点,即峰值扩增(Texp,第 8 - 14 天)、早期峰值后持续期(Tperi,第 21 天)和晚期峰值后持续期(Tper2,第 28 天),采集患者的输注产品和外周血样本进行单细胞多模态分析。通过 CD19 抗原四聚体分选 CAR - T 细胞,验证了分选策略的有效性。
  • CD8+ CAR - T 细胞在 Texp和 Tper之间发生克隆型转变:分析发现,CAR - T 细胞在峰值扩增时,其丰度在 11% - 73% 之间,且大多数时间点和患者中,CAR - T 细胞以 CD8+为主。通过单细胞 TCR - seq 追踪克隆型动态变化,发现 Texp的克隆型与 Tperi或 Tper2的克隆型存在显著差异,且这种差异由 CD8+ T 细胞驱动,是 CAR 特异性的。
  • CD8+ CAR - T 细胞从耗尽样效应记忆向终末效应表型转变:对 CD8+ CAR - T 细胞进行聚类分析,发现 6 个 T 细胞簇。在 Texp时,CAR - T 细胞主要为耗尽样效应记忆(EM)表型(占 64%);而在 Tper时,主要为终末效应(TE)表型(Tperi时占 63%,Tper2时占 77%)。这表明 CD8+ CAR - T 细胞在 Texp和 Tper之间发生了表型转变。
  • CD4+ CAR - T 细胞维持记忆表型并伴有 CAR Treg 持续存在:对 CD4+ CAR - T 细胞进行聚类和注释分析,鉴定出 5 个 T 细胞簇。CD4+ CAR - T 细胞在所有时间点主要表现为记忆(Mem)表型(占 49% - 82%)。在治疗过程中,Mem 比例逐渐下降,Th1 比例逐渐增加,同时 CAR Tregs 比例稳步上升,表明其在峰值扩增后仍持续存在于外周血中。
  • 整合 CD8+ CAR - T 细胞的克隆型和表型转变支持两阶段分化模型:将 CD8+ CAR - T 细胞的克隆型和表型通过细胞条形码进行关联分析,发现存在两个不同的体内克隆扩增波。第一波由具有耗尽样 EM 表型的 CAR - T 细胞主导,在 Texp时达到高峰;第二波由具有 TE 表型的 CAR - T 细胞主导,在 Tper时占优势。这一结果支持了 CD8+ CAR - T 细胞的两阶段分化模型。
  • Texp和 Tper特异性的转录特征和调节网络:通过 GSEA、DGEA 和调节网络分析,发现 Texp的 CAR - T 细胞上调细胞周期和凋亡相关基因集,以及 T 细胞激活和耗尽相关基因;Tper的 CAR - T 细胞则上调细胞毒性和免疫调节相关基因集。同时,还鉴定出了与 Texp和 Tper相关的关键调节因子和调节网络。
  • CD8+ CAR - T 细胞在 Texp和 Tper起源于输注产品中的不同前体:通过 TCR 谱系追踪分析,研究人员发现 CD8+ CAR - T 细胞在 Texp和 Tper分别起源于输注产品中具有不同特征的前体。Texp的前体具有更多效应样特征,而 Tper的前体具有更多干细胞样特征。
  • Texp时 CD8+耗尽样 EM CAR - T 细胞表现出早期耗尽的特征:对耗尽样 EM 簇进行深入分析,发现其高表达耗尽相关转录因子和抑制性受体,同时具有记忆和效应基因的中间表达水平。通过与参考数据集的比较,证实该簇表现出早期耗尽的特征。

研究结论和讨论部分指出,该研究揭示了 CD28 共刺激的 CD8+ CAR - T 细胞在体内的两阶段分化模型。这一模型表明,CAR - T 细胞的扩增和持久性由不同的细胞群体介导,它们在生物学上是不相关的。这一发现对于理解 CAR - T 细胞的扩增和持久性具有重要意义,为开发更有效的个性化 CAR - T 细胞疗法提供了理论基础。通过操纵输注产品的表型组成,有望更精确地控制体内 CAR - T 细胞的分化,从而调节治疗效果。然而,该研究也存在一定的局限性,如样本仅来自外周血和输注产品,未涉及其他部位;未充分考虑 CAR - T 细胞与体内复杂环境的相互作用;无法排除在输注后短期内或长期内存在其他克隆扩增波的可能性;且两阶段分化模型在其他情况下的适用性尚待研究。未来的研究可以针对这些局限性展开,进一步深入探究 CAR - T 细胞的分化机制和治疗效果。

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