揭开中华绒螯蟹 BCO2的神秘面纱:序列、进化与表达的深度解析

【字体: 时间:2025年05月07日 来源:Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics 2.2

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  为填补中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)中 β - 胡萝卜素 9’,10’ - 加氧酶(BCO2)的研究空白,研究人员对其基因展开研究。结果显示 ESIN_BCO2有独特结构,在进化上有特点,且在雌蟹后肠高表达。该研究为甲壳类 BCO2进化和功能研究提供思路。

  在奇妙的生物世界里,类胡萝卜素扮演着重要角色。它是一类具有异戊二烯结构的天然碳水化合物,广泛存在于各种生物中。对于多数动物,包括甲壳类动物来说,它们自身无法合成类胡萝卜素,只能从食物中获取。在中华绒螯蟹身上,类胡萝卜素不仅影响着蟹壳的颜色,还在其生长、繁殖、免疫以及应对环境压力等方面发挥着关键作用。比如,它能增强中华绒螯蟹的抗氧化能力,帮助它们在充满氨和缺氧等不良环境的集约化养殖中生存。
然而,类胡萝卜素的代谢过程十分复杂,其中类胡萝卜素裂解加氧酶(CCOs)起着关键的催化作用。在脊椎动物中,β - 胡萝卜素 15,15’ - 单加氧酶(BCO1)和 β - 胡萝卜素 9’,10’ - 加氧酶(BCO2)是两种主要的 CCOs。BCO2对类胡萝卜素代谢至关重要,它的缺乏会导致多种动物出现异常表型,像小鼠线粒体类胡萝卜素积累、鸡和爬行动物皮肤变黄、牛羊兔等出现黄色脂肪表型等。

尽管 BCO2如此重要,但在甲壳类动物中,对它的研究却少之又少。就拿中华绒螯蟹来说,虽然其经济价值高且富含类胡萝卜素,可关于中华绒螯蟹中 BCO2基因的鉴定、进化历程以及表达模式等方面都还没有得到充分研究。为了填补这些知识空白,来自上海相关单位以及安徽等地的研究人员开展了深入研究,相关成果发表在《Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics》上。

研究人员采用了多种关键技术方法。他们从国家生物技术信息中心(NCBI)数据库下载了 14 个物种的基因组,这些物种涵盖了 2 种脊椎动物和 12 种甲壳类动物。通过对这些基因组数据的分析,研究人员克隆了中华绒螯蟹的 BCO2基因,并对其进行了全面研究。

下面来看具体的研究结果:

  • ESIN_BCO2的调查和理化性质:研究发现,BCO2几乎存在于所有被研究的甲壳类动物中,除了大型溞(Daphnia magna)和蚤状溞(Daphnia pulex)。在脊椎动物中只有 1 个 BCO2基因,而在颚足纲动物中,BCO2基因出现了扩张,有 2 - 3 个拷贝。在十足目动物(如中华绒螯蟹)中,每个物种仅有 1 个 BCO2拷贝。从中华绒螯蟹基因组数据库克隆得到的 BCO2基因命名为 ESIN_BCO2,其开放阅读框(ORF)全长 1572bp,编码 523 个氨基酸,并且具有 10 个保守基序和 1 个 RPE65 结构域,属于类胡萝卜素裂解加氧酶(CCO)家族。
  • 进化分析:通过系统发育分析,研究人员发现 BCO1 是祖先基因,在进化过程中,BCO2和 NinaB 从 BCO1 分化而来。值得注意的是,十足目动物中 BCO2的 Ka/Ks 比值(0.014 - 0.045)明显低于其他甲壳类动物(0.112 - 0.185),这表明十足目动物的 BCO2在进化过程中受到了更强的纯化选择。
  • 表达模式分析:研究发现 ESIN_BCO2主要在后肠表达,且雌性的表达水平显著高于雄性。原位杂交结果进一步证实,ESIN_BCO2主要定位在后肠上皮细胞(epi)和基底细胞(bc)的细胞核(N)附近。此外,饲料中添加 β - 胡萝卜素能够显著上调雌性后肠中 BCO2的表达。

综合研究结论和讨论部分,这项研究首次全面地对中华绒螯蟹中的 BCO2基因进行了探究。研究结果不仅让我们对中华绒螯蟹 BCO2的序列特征、进化历史和表达模式有了深入了解,还为其他甲壳类动物中 BCO2的研究提供了重要参考,有助于揭示不同甲壳类动物类胡萝卜素代谢机制的保守性和差异性,为甲壳类动物的养殖、遗传育种以及相关疾病的研究奠定了理论基础,对推动甲壳类动物生命科学领域的发展具有重要意义。

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