编辑推荐:
为探究大黄鱼(Larimichthys crocea)头肾(HK)、躯干肾(TK)和脾脏在造血与免疫中的作用,研究人员开展组织学和转录组分析。结果发现三者均有造血和免疫功能,且各有特点。该研究为鱼类疾病防治提供依据,助力水产养殖发展。
在神秘的鱼类世界里,大黄鱼作为亚洲重要的海洋养殖鱼类,其健康成长关乎着水产养殖业的发展。然而,鱼类独特的免疫系统一直是困扰科学家们的谜题。与高等脊椎动物不同,硬骨鱼类没有骨髓和淋巴结,它们的造血和免疫功能分散在多个器官中。在大黄鱼身上,头肾、躯干肾和脾脏承担起了这些关键职责,但它们具体是如何运作的,却鲜为人知。为了揭开这一奥秘,浙江海洋大学的研究人员踏上了探索之旅,他们的研究成果发表在《Comparative Immunology Reports》上,为我们深入了解鱼类的生理机制打开了一扇新的大门。
研究人员采用了多种关键技术方法。首先,从浙江海洋大学附近养殖基地选取大黄鱼样本,采集其头肾、躯干肾和脾脏组织。接着,通过组织学检查,在显微镜下观察组织切片和细胞涂片,识别各种细胞类型。同时,进行 RNA 提取、cDNA 文库构建和测序,获取基因数据。利用生物信息学方法,对测序数据进行处理和分析,包括基因功能注释、差异表达基因(DEGs)分析等,还通过荧光定量实时 PCR 对部分基因表达进行验证。
研究结果
- 组织学结构:头肾由造血组织、淋巴组织和黑色素巨噬细胞中心(MMCs)构成,无肾小管和肾包膜,难以区分皮质和髓质。躯干肾皮质有造血组织、MMCs 和淋巴组织,髓质含排泄成分及部分造血、淋巴组织和 MMCs,皮质与髓质结构差异明显。脾脏有清晰的白髓和红髓结构,白髓富含造血细胞和免疫细胞,红髓主要是红细胞和少量巨噬细胞,脾脏的 MMCs 数量多于头肾和躯干肾 。
- 基因表达分析:测序得到大量高质量数据并成功组装转录本。基因功能注释发现众多基因被注释到多个数据库。基因表达谱显示,躯干肾表达基因数量最多,部分基因具有组织特异性。差异表达基因分析表明,不同器官间差异表达基因数量不同,且各器官有独特的差异表达基因。
- 功能特征分析:通过 KEGG 和 GO 富集分析,头肾的差异表达基因与类固醇激素合成等途径相关;脾脏的差异表达基因与免疫相关途径,如造血细胞谱系、血小板激活等有关;躯干肾的差异表达基因涉及代谢过程、微管运动等相关途径 。
- 免疫与造血相关基因表达:免疫相关基因在不同器官的表达存在差异,如 tlr3、tlr7 和 tlr8 在脾脏高表达,补体基因 c6、c7 在头肾和躯干肾高表达,c8γ 仅在躯干肾表达。造血相关基因中,runx1、cmyb 等在三个器官均有表达,部分基因在头肾和躯干肾高表达,部分在脾脏高表达 。
- 转录因子分析:鉴定出多个转录因子(TF),分属不同家族。参与造血的关键转录因子在三个器官均有表达,部分在头肾和躯干肾高表达。
- 造血分化模型:观察不同血细胞形态,建立造血树,明确成熟造血干细胞分化为各类血细胞的过程。
- 免疫相关基因验证:通过 qPCR 验证,部分免疫相关基因的表达趋势与 RNA - Seq 数据一致。
研究结论与讨论
研究表明,大黄鱼的头肾和躯干肾是主要的造血器官,两者在造血相关基因表达和组织学特征上相似,含有较多的造血干细胞祖细胞(HSPCs)和髓系细胞。脾脏也具有造血功能,发现了未成熟血细胞和相关基因表达,但这些细胞能否在脾脏中分化成熟还需进一步研究。在免疫功能方面,三个器官都存在 MMCs,且有类似哺乳动物生发中心的结构,说明它们都是重要的免疫器官。脾脏在抗病毒免疫中作用突出,高表达 tlr3、tlr7 和 tlr8 等抗病毒相关基因。躯干肾存在特殊的 C8γ 合成细胞,这一发现为深入了解鱼类免疫机制提供了新线索。此外,大黄鱼的造血和免疫功能紧密相连,形成了一个相互调节的生理系统,这可能是鱼类在水生环境中进化出的高效生存策略。该研究为理解硬骨鱼类的造血和免疫分子机制提供了重要依据,有助于制定更有效的水产养殖疾病管理策略,推动水产养殖业的健康发展。