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为解决脑卒中病变分割模型检测治疗效果能力未充分探索的问题,研究人员开展 GMM 和 nnU-Net 在识别治疗相关脑卒中体积变化方面有效性的研究。结果发现 nnU-Net 单用手动分割训练有局限,用 GMM 衍生标签训练更准确。这强调治疗检测评估的重要性。
在医学影像领域,脑卒中(stroke)作为一种严重的脑血管疾病,每年都给大量患者及其家庭带来沉重的负担。它是全球范围内导致死亡和残疾的重要原因之一,准确评估脑卒中病变对于临床治疗和预后判断至关重要。目前,体内磁共振成像(MRI)技术虽然强大,但精确评估脑卒中病变的复杂性却困难重重。传统的手动分割方法不仅耗时耗力,而且不同观察者之间的差异较大,容易出现人为误差。
与此同时,基于机器学习的分割模型逐渐兴起。其中,高斯混合模型(Gaussian Mixture Models,GMM)凭借其在发现数据潜在分布方面的优势,在生物医学成像的多个领域广泛应用,在脑卒中病变分割中也有不错的表现。然而,GMM 在处理大规模数据集时,由于大协方差矩阵的计算要求和期望最大化算法的复杂计算,存在一定的局限性。nnU-Net(“no - new - Net” U - Net)作为新一代深度学习分割方法,能自动确定最佳网络架构、训练策略和数据预处理方法,在医学图像分割领域备受青睐。但它高度依赖大量数据和精确的体素级真实标签(ground truth,GT),而获取大规模手动标注的 GT 标签困难重重,这可能导致在评估治疗效果时出现偏差。
在这样的背景下,来自国外的研究人员为了解决上述问题,开展了一项极具意义的研究。他们聚焦于评估 GMM 和 nnU-Net 在分割脑卒中病变时的性能,尤其是检测治疗后脑卒中体积减少的能力。研究成果发表在《Computers in Biology and Medicine》上,为该领域的发展提供了重要参考。
研究人员主要采用了以下关键技术方法:利用大鼠脑卒中的临床前 MRI 数据集,该数据集包含了表观扩散系数(Apparent diffusion coefficient,ADC)和 T2 加权(T2W)图像。实验选用 53 只通过可逆大脑中动脉闭塞(MCAO)模型诱导缺血性脑卒中(IS)的大鼠。在研究过程中,分别运用 GMM 和 nnU-Net 对控制组和治疗组动物发病 24 小时后的 MRI 数据进行处理。GMM 按照之前描述的方法进行脑卒中区域分割,nnU-Net 则使用手动标注的 GT 进行训练,之后在剩余动物数据上进行测试。
分割性能评估
研究人员分别将 GMM 和 nnU-Net 应用于相同的 ADC 和 T2W MRI 数据集。结果显示,两种方法在分割性能上都表现出色。然而,仅用手动分割进行训练的 nnU-Net,在检测治疗诱导的脑卒中体积显著减少方面存在不足。尽管它在常规分割指标上表现优异,但却得出了假阴性的研究结果。这意味着在实际评估治疗效果时,该模型可能会遗漏重要信息,影响对治疗方案有效性的判断。
不同标签对 nnU-Net 训练的影响
研究人员进一步探究不同的 GT 标签对 nnU-Net 训练的影响。他们用 GMM 衍生的 GT 标签训练 nnU-Net,并与使用手动标注 GT 训练的模型进行对比。结果发现,使用 GMM 衍生标签训练的 nnU-Net 能更准确地检测治疗反应。这表明不同的 GT 定义会显著影响模型在治疗评估中的性能,为后续优化模型训练提供了新的思路。
类不平衡对分割的影响
研究人员还研究了类不平衡对分割准确性的影响。脑卒中体积减少的治疗会改变目标分割标签的数量,进而影响模型性能。研究发现,在评估模型时,忽略类不平衡问题会导致对模型性能的误判。这提示在构建和评估脑卒中病变分割模型时,必须充分考虑类不平衡因素,以确保模型的可靠性。
综上所述,本研究系统评估了 GMM 和 nnU-Net 在脑卒中病变分割和治疗评估中的表现。研究结果强调,在全面评估模型性能时,检测治疗反应的能力至关重要,不能仅仅依赖分割精度。这一研究成果为后续的脑卒中研究、多中心试验以及临床工作流程中的模型选择和优化提供了重要依据,有助于提高对脑卒中治疗效果的准确评估,推动生物医学成像领域的发展,为临床决策提供更可靠的支持。