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本文聚焦细胞外囊泡(EVs),综述其在细胞生物学领域的研究进展。详细阐述了 EVs 的生物发生、分泌、靶向与命运等机制,对比了多种研究模型,探讨其应用前景,为深入理解 EVs 及挖掘其医学价值提供全面参考。
引言
细胞外囊泡(EVs)研究已突破传统界限,成为跨生物界的研究热点。其发现可追溯到 50 多年前,如今被证实广泛参与细胞间通讯、物质运输和细胞迁移等基本细胞功能。
EVs 种类繁多,起源和组成各异,在生理和病理状态下功能不同。目前,EVs 的命名体系已对多种具有不同生物起源的囊泡和颗粒进行了分类,如外泌体(exosomes)、微囊泡(microvesicles,也叫 ectosomes)、突起衍生囊泡(PD-EVs) ,还包括凋亡小体、分泌自噬体、迁移体(migrasomes)等。这些 EVs 携带脂质、核酸(DNA、mRNA、miRNA、lncRNA、piRNA 等)、蛋白质,甚至金属离子,在细胞间传递生物信息。
鉴于 EVs 在细胞间通讯中的重要作用及在医学领域的应用潜力(超 143 项临床试验正在开展) ,细胞生物学家致力于探究其 cargo 包装机制,以及环境对 EVs 产生和分泌的影响。优化 EVs 的分离和纯化方法,对解析其组成和功能至关重要。
细胞外囊泡的生物发生与货物选择:一个耦合过程
揭示 EVs 生物发生和分泌机制颇具挑战,原因在于细胞内分选和包装货物进入多囊泡内体(MVEs)的腔内囊泡(ILVs,分泌后成为外泌体)、ectosomes 或 PD-EVs 的途径存在冗余。总体而言,膜微结构域或支架形成、结合特定货物,然后出芽形成囊泡,这一过程可发生在 MVE 内,也可在质膜的随机或特定位点进行。
内体分选转运复合体(ESCRT)在货物分选中起关键作用,同时还有非 ESCRT 途径参与,如神经酰胺生成和四跨膜蛋白(如 CD63)介导的机制。蛋白质 syntenin 与 syndecans、Alix 相互作用,驱动具有外泌体特征的小 EVs 生成。PDZ 结构域蛋白与 syndecans、多种四跨膜蛋白(CD9、CD63、CD8)广泛作用,其形成的支架影响 EVs 生成、组成及被受体细胞摄取的过程。
多种 Rab GTPases 和脂质参与 EVs 生物发生。例如,Rab31 参与不依赖 ESCRT 的内化表皮生长因子受体向 MVEs 内 ILVs 的转运;Rab11 在营养应激细胞中促进 “Rab11 外泌体” 从细胞回收中心分泌。磷酸肌醇及其生成激酶在其中也意义重大,早期内体富含 PI3P,Rubicon 与 PI3 激酶的一种亚型(PIK3C3)相互作用,调控外泌体生物发生;PI3P 还参与 Arc 衣壳蛋白等货物的包装。
在货物选择方面,多数与 EVs 相关的跨膜蛋白特异性结合并募集参与 EVs 形成的机制,脂质可通过与蛋白(如胆固醇与 CD63)相互作用被选择性整合。遗传物质进入 EVs 依赖翻译后修饰、共有基序和结合蛋白等 “靶向信号”,细胞器间的相互作用也很关键,如 miR110 在 ER 膜接触位点分选至 MVEs,miR223 从线粒体转移至 MVEs 都需要这种接触,YBX1 则协助这些 miRNA 进入 ILVs,最终随外泌体分泌。
对于 ectosomes,近年来研究有所进展。钙蛋白酶 - 膜联蛋白途径在膜修复过程中清除质膜 “微痂”,这些 ectosomes 含膜联蛋白,参与质膜愈合;肿瘤来源细胞的大 ectosomes 可通过 ARF6 依赖的循环和 DNA 传感器 cGas 募集双链 DNA。迁移体的生物发生和分泌与 Rab35、磷酸肌醇有关,但功能研究较少。PD-EVs 的生物发生受肌动蛋白细胞骨架、含 I-BAR 结构域的蛋白和 CD133 调控,肌动蛋白细胞骨架塑造膜突起,I-BAR 蛋白协助形成膜曲率和断裂,CD133 是 PD-EV 生成和释放的关键标志物,PD-EVs 携带独特货物,在细胞间通讯中发挥重要作用。
细胞外囊泡的分泌
EVs 从细胞释放的方式有组成型和调节型,受与其他细胞或细胞外基质(ECM)相互作用的影响。外泌体释放需 MVE 运输、对接并与质膜融合,RabGTPases(如 Rab27、Rab25、Rab11 )和 SNAREs 在该过程中起关键调节作用,不同细胞系统中其作用存在差异。细胞内存在不同组成的 MVE 亚型,部分 MVE 可从与溶酶体融合的途径转向分泌途径,这涉及获取运输和对接所需的特定效应物,GTPase 级联反应(包括 Rab7 和 Arl8b)促进 MVB 向质膜移动,最终激活 Rab27a 实现 MVE 对接,同时 MVE 通过胆固醇结合蛋白 OPR1L 与 ER 相互作用,促进分泌性 MVE 成熟。
磷脂酰肌醇(PIs)参与外泌体分泌,PI4KIIa 引发的 PI 转换使分泌性 MVE 被 PI4P 修饰,招募外泌体复合体,促进 MVE 融合和外泌体分泌。阻断 HOPS 途径干扰内吞运输,也可促进外泌体分泌,表明早期内体的多种 EV 生物发生途径需维持微妙平衡,内吞和自噬途径的平衡也影响小 EVs / 外泌体分泌,Presinilins(PSENs)尤其是 PSEN1 在其中起关键调节作用。
ectosomes 和 PD-EVs 从质膜特定部位出芽和分泌受多种机制调控,因细胞类型而异。脂质、脂质微结构域和细胞骨架相关蛋白起主要作用。肿瘤细胞中,肌动球蛋白收缩在小 GTPase ADP - 核糖基化因子 6(ARF6)和肌动蛋白作用下,通过形成泡状突起促进 EV 释放;星形胶质细胞中,甘油磷酸二酯酶(GDE3)通过重塑肌动蛋白细胞骨架参与特定 ectosomes 分泌;在具有初级纤毛的细胞中,肌动蛋白调节蛋白 drebrin、肌球蛋白 6 和 PIP2 触发 PD-EV 分泌,肌动球蛋白收缩性对微绒毛和初级纤毛释放 PD-EVs 至关重要,但肌动蛋白丝束的程度需精细调节,过度束集会抑制 EV 分泌,CD133 也参与调节 PD-EV 从微绒毛和纤毛的分泌。
靶向与命运
无论何种亚型,EVs 的功能依赖于在靶位点的特异性摄取和加工。根据细胞模型和细胞环境,EVs 可与受体细胞表面结合或融合。多数 EVs 含整合素,参与通过特定受体结合受体细胞,如乳腺癌细胞释放的 EVs 中的 αvβ3整合素对其摄取和向非恶性癌细胞递送至关重要,可被去整合素化合物抑制。免疫突触处存在特殊的 EV 分泌和摄取过程,受体细胞上的半乳糖凝集素和半乳糖对吸收乳汁来源的 EVs 至关重要,而常见的 EV 相关分子(如四跨膜蛋白 CD9 和 CD63)可能不直接参与 EV 摄取和货物递送。
EVs 释放后会与细胞外蛋白(如血清蛋白)相互作用形成蛋白质冠,影响其生物分布、靶向和内化,还可通过掩盖表面标记调节 EVs 功能。为提升 EVs 治疗潜力,对其表面进行工程改造(添加靶向信号或修饰糖萼)和优化货物装载,有助于增强细胞特异性和摄取效率。
目前,EVs 货物(蛋白质、脂质、遗传物质)如何从 EV 膜或胞质部分释放并有效整合到受体细胞特定细胞器(如细胞核)的机制仍不明确,EVs 在从供体细胞到受体细胞、血液循环到远处靶器官过程中,如何维持完整性也有待研究。近期研究发现,EVs 膜上的离子通道和转运蛋白(如钙激活大电导钾通道 BKca )可能对其结构和功能完整性至关重要,深入了解不同 EV 亚型的分子组成(受分离方法影响),也有助于揭示货物递送和 EVs 稳定性的机制。
研究细胞外囊泡的多样模型:从细胞系到模式生物组织和类器官
分离和鉴定 EVs 是理解其生物发生、亚型多样性和功能的基础。不同 EV 亚型反映其来源的细胞和细胞外环境特征,分离方法显著影响 EVs 的产量、纯度和功能研究结果。
从培养细胞条件培养基中分离的 EVs 制备简便,有助于研究其生物发生和分泌机制,但生理相关性有限,因其并非来自生物体的复杂组织架构。3D 培养的细胞分泌的 EVs 在产量、标记物富集(如 CD63、CD81、CD9)和 microRNA 表达方面优于 2D 培养,如 3D 培养的间充质干细胞来源的 EVs(3D-MSC-EVs)在神经再生、心脏修复和伤口愈合中展现出疗效,其结构复杂性使分泌的 EVs 更接近体内情况。
组织来源的 EVs(Ti-EVs)虽分离困难,但能反映天然细胞和细胞外环境,具有更高生理相关性,其包裹的组织特异性成分有助于研究疾病和生理机制,如癌症组织的 Ti-EVs 对理解肿瘤进展和细胞间通讯意义重大,目前也有研究致力于分离不同脑区的 Ti-EVs 以探究其在神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)中的作用。
类器官来源的 EVs(OEVs)优势明显,类器官是模拟体内组织结构的多细胞自组织结构,OEVs 由其分泌,货物丰富,富含生物活性分子(如 microRNA),生理相关性和治疗效果更好,但通常需工程改造以提高靶向特异性和功能。模式生物如果蝇(Drosophila melanogaster)和斑马鱼(Danio rerio)为体内研究 EV 生物学和功能提供了重要模型,果蝇中 PD-EVs 参与 Hedgehog 蛋白运输,影响形态发生素梯度形成;斑马鱼透明幼虫便于实时观察 EVs 在发育和疾病过程中的动态变化,其肿瘤来源的 EVs 促进血管生成和转移的机制已得到广泛研究,这些模型在简单生物和复杂哺乳动物研究间架起桥梁,为理解 EVs 功能提供独特视角。
展望:光明前景
细胞外囊泡在细胞生物学领域已取得显著进展,但随着新发现不断涌现,整合复杂的研究成果仍是巨大挑战。未来,深入研究 EVs 生物发生、货物选择和分泌机制,有望开发靶向治疗策略,用于药物递送和免疫治疗。技术进步将提升 EVs 分离、纯化和表征水平,助力揭示不同 EV 亚型的基本特性、在各类细胞中的生成原理及功能。
值得关注的是,不仅动物细胞释放 EVs,细菌、植物和真菌也有此现象。细菌产生的 EVs 在微生物学领域备受关注,其在肠道 - 脑轴、肝轴等器官相关疾病中的作用逐渐被揭示;植物 EVs 运输 RNA、蛋白质和脂质,影响植物生长、应激反应和抗病毒防御等生理过程;真菌 EVs 与植物相互作用,携带信号分子影响植物生长发育,特别是在共生关系中。跨细胞生物学、工程学和临床医学等多学科协作,将充分挖掘 EVs 作为诊断工具和治疗药物的潜力,推动细胞生物学和医学领域的创新发展。