综述:不完美的隐藏代价:蛋白质聚集疾病中的转录错误

【字体: 时间:2025年05月07日 来源:Current Opinion in Genetics & Development 3.7

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  本文聚焦转录错误与蛋白质聚集疾病的关联。研究发现转录错误(TE)会产生具有淀粉样或朊病毒样特性的突变蛋白,引发聚集级联反应,导致疾病发生,还会破坏蛋白质稳态(proteostasis)。这为相关疾病研究提供新视角,值得深入阅读。

  

生命完美的错觉


乍看之下,生命仿佛是精准和谐的杰作,单细胞内分子过程紧密协作维持生存。但深入探究会发现,生命并非完美无瑕,而是充满混乱和错误。就像莫奈的画作,远看完美,近看则是杂乱的笔触。生命系统也在熵的边缘维持平衡,这种不完美引发了对生物保真度极限的思考。

生物保真度的极限


“生物保真度” 用于描述蛋白质或酶催化反应时的准确性。以 DNA 聚合酶为例,它在复制基因组时需准确配对碱基,任何偏差都是生物错误。尽管 DNA 聚合酶对生命延续至关重要,但它并不完美,人类细胞中主要复制性 DNA 聚合酶每 10 万个碱基就会掺入约 1 个错误核苷酸。为降低错误率,自然界进化出 3′→5′核酸外切酶 “校对” 结构域和错配修复途径,使错误率降至约十亿分之一。这表明生物保真度存在固有局限。

测量转录的保真度


生物系统普遍存在不完美性,转录过程也不例外。circ - seq 技术能检测转录过程中的错误(TE),即转录诱变(TM)。传统 cDNA 测序因逆转录酶(RT)错误率高,难以区分真实 TE 和 RT 诱导的错误。circ - seq 通过多次反转录同一 mRNA 分子,可有效去除 RT 诱导的错误。研究发现,转录并非无错过程,错误发生频率比 DNA 复制错误高约 1 万倍。不过,TFIIS 等保真因子和无义介导的 RNA 衰变等机制可提高转录的准确性。

从转录错误到蛋白质聚集体


转录错误可能影响人类生物学多个方面,尤其与神经退行性疾病相关。研究表明,转录错误可产生淀粉样前体蛋白和泛素 B 蛋白的淀粉样变体,这些突变蛋白存在于疾病相关的毒性聚集体中。蛋白质聚集体由错误折叠且具有淀粉样或朊病毒样特性的蛋白形成,能与野生型蛋白结合并使其错误折叠,引发聚集级联反应。实验证实,转录错误产生的突变 SOD1G142E蛋白可在细胞内形成聚集体,并将野生型 SOD1 蛋白转化为淀粉样状态。不同突变和蛋白的聚集阈值不同,如突变 TP53S149F诱导野生型 TP53 聚集的阈值可低至 0.5%。

转录错误与蛋白质稳态的破坏


转录错误产生的 “淀粉样或朊病毒样错误” 只是细胞错误的一小部分,多数随机错误虽与蛋白质聚集疾病无关,但仍可导致毒性淀粉样蛋白聚集。研究发现,转录错误较多的酵母细胞和人类细胞会出现蛋白质毒性应激,表现为热休克蛋白和自噬水平增加。随机转录错误导致蛋白质错误折叠,累积的错误折叠蛋白会超出细胞质量控制机制的处理能力,削弱其对原本就易聚集蛋白的处理能力。神经元对蛋白质聚集尤为敏感,海马体神经元转录错误率高,这为淀粉样斑块在该区域积累提供了解释。

看清全貌


转录错误为蛋白质聚集疾病的发展提供了统一框架,家族性和非家族性病例可能由相同突变蛋白引起,只是产生机制不同。转录错误还将衰老的多个特征联系起来,DNA 损伤可导致转录错误,产生易聚集蛋白,破坏蛋白质稳态。除转录和 DNA 复制外,其他生物过程也易出错并产生有毒副产物,可能引发疾病。我们应关注生物过程中的错误,深入探究生命的有序与无序,才能更好地理解生物学并寻找治疗疾病的方法。

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