综述:生成式人工智能在可持续毒理学中的应用、优势与挑战综述

【字体: 时间:2025年05月07日 来源:Current Research in Toxicology 2.9

编辑推荐:

  本文聚焦生成式人工智能(GenAI)在毒理学领域的应用。详细探讨其在数据生成、药物发现、毒性预测等多方面的应用,对比 GenAI 与非 GenAI 方法的优劣,分析面临的挑战与机遇,对推动可持续毒理学发展具有重要参考价值。

  

引言


可持续毒理学致力于开发安全的药物、疫苗、化学品和治疗方法,确保资源消耗最小化,减少有毒废物产生,保护生物和环境。人工智能应用领域发展迅速,生成式人工智能(GenAI)在其中可发挥重要作用。GenAI 能通过学习现有数据集的复杂模式和分布生成新数据,涵盖生成对抗网络(GANs)、变分自编码器(VAEs)、Transformer 和扩散模型等多种模型 。本文旨在探讨 GenAI 如何助力毒理学发展,主要贡献包括解释 GenAI 在毒理学中的应用、比较 GenAI 与非 GenAI 方法、呈现 GenAI 驱动的毒理学过程可视化等。文章遵循 PRISMA 指南,通过多数据库检索相关文献进行分析。

2. 生成式人工智能在毒理学中的应用


GenAI 在多个领域已广泛应用,在毒理学领域虽处于起步阶段,但潜力巨大。

  1. 数据生成:毒理学研究常面临数据稀缺、收集耗时复杂等问题。GenAI 可生成复杂的合成临床试验数据,加速药物和治疗开发,还能在数据共享时保护隐私。相比非 GenAI 方法,GenAI 能生成更具多样性和新颖性的数据,在处理少数类和不平衡数据集方面表现更优。
  2. 药物发现:药物发现包括靶点识别、化学物质筛选、临床试验和审批等环节。GenAI 有助于理解药物的复杂相互作用和毒性,在从头药物设计、体内试验、上市后药物监测(PMDS)和药物警戒等方面发挥作用。不过,GenAI 在药物发现中也面临数据稀缺、伦理等挑战,与非 GenAI 方法各有优劣,两者结合可推动药物发现进程。
  3. 预测毒性:预测化学物质的毒性对药物开发和环境保护至关重要,遵循 3R 原则(Replace、Reduce、Refine)可减少动物实验中的毒性影响。GenAI 在毒性预测方面有潜力,但目前应用较少,面临数据质量、可解释性、验证和泛化性等挑战,相比之下,非 GenAI 模型在这些方面具有一定优势。
  4. 理解毒性:深入理解毒理学对保护人类健康和环境至关重要。GenAI 可通过特征选择、潜在空间探索、反事实解释等方式,帮助确定生物标志物,简化毒性理解,提高预测准确性,增强可解释性。虽然 GenAI 存在一些挑战,但其在处理复杂关系和多模态数据方面优于非 GenAI 方法,两者融合将更有利于理解毒性。
  5. 环境毒理学:环境毒理学研究化学物质对环境和生物的不良影响。GenAI 可处理多模态数据,预测毒素途径,帮助制定环境保护决策。与非 GenAI 方法相比,GenAI 在数据增强和多模态数据集成方面有优势,但也存在对环境有负面影响等问题。
  6. 异常检测:毒理学数据集中的异常检测关乎人类生命和环境安全。GenAI 比传统机器学习方法更准确,能处理非线性问题,在检测罕见药物不良反应、监测环境毒素等方面有应用前景,但也面临专家短缺等挑战。
  7. 信息传播、教育和培训:对话式人工智能(Conversational-AI)可模拟人类对话,在毒理学领域虽应用较少,但在信息传播、教育和培训等方面有潜在价值,能帮助解答问题、提供决策支持。GenAI 在这方面优于非 GenAI,具有更强的上下文理解和内容生成能力。

3. MolGAN 和变体案例研究


识别有毒和无毒化合物对药物开发和化学安全意义重大。MolGAN 是一种基于 GenAI 的分子生成对抗网络,可创建新颖的图形分子结构,训练开发新的生物活性和安全的化学结构,节省时间和成本,避免动物实验。其方法包括准备分子、配置参数、训练模型和分析毒性,能生成低毒性分子,应用于早期药物发现、先导优化和预测毒理学等领域。不过,MolGAN 也存在分子大小限制、模式崩溃等问题,L-MolGAN 等变体可在一定程度上克服这些问题。

4. 风险评估和管理


风险评估和管理是毒理学中的重要环节。

  1. 风险评估:风险评估是研究药物和化学物质风险的过程,包括危害识别、剂量 - 反应评估、暴露评估和风险表征四个阶段。GenAI 在毒理学风险评估中的应用尚处于起步阶段,但可通过模拟现实风险、生成数据等方式,提高评估的准确性和适应性,不过目前仍主要依赖传统方法。
  2. 风险管理:风险评估后需采取措施降低风险。世界卫生组织(WHO)、美国食品药品监督管理局(FDA)等组织制定了相关程序和政策,以监测化学品的有害影响并规范 AI 在毒理学中的应用,同时也关注 AI 带来的潜在风险。
  3. 数据库和工具:毒理学和化学数据库为风险评估提供重要信息。AI 的发展影响了数据库的利用方式,GenAI 可增强数据处理能力,提高风险评估效率,但目前多数数据库缺乏实时更新。
  4. GenAI 模型的验证:模型验证在毒理学风险评估和管理中至关重要,可确保 GenAI 模型的可靠性和准确性。不过,验证 GenAI 模型存在输出难以量化和输出空间广泛等挑战,需要制定适合毒理学问题的验证基准。

5. 优势和挑战


GenAI 在毒理学领域有诸多优势,但也面临不少挑战。

  1. GenAI 在毒理学中的优势:GenAI 可进行预测建模,减少动物和人体试验;生成合成数据,加速研究进程;寻找安全的替代化学品;进行危害评估和风险分析等,为可持续毒理学发展提供支持。
  2. GenAI 在毒理学中面临的挑战:GenAI 在数据生成方面存在质量、多样性和体积等问题,且存在偏差;处理不确定性能力有限,缺乏透明度和可解释性;技术复杂,需要专业知识;还面临伦理、隐私和合规性等问题。

6. 用 GenAI 赋能对话式人工智能


用 GenAI 赋能对话式人工智能,可使对话式人工智能在毒理学领域发挥更大作用,帮助理解复杂的毒理学问题,实现个性化交互。但这也面临准确性评估、避免偏差、隐私保护和伦理等挑战。

7. 结论


毒理学对生物生存至关重要,传统毒理学方法存在诸多不足。GenAI 在毒理学领域应用前景广阔,涵盖药物发现、数据生成、毒性预测等多个方面。本文探讨了 GenAI 在毒理学中的应用、优势和挑战,为未来可持续毒理学研究提供了参考。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号