揭开 LDAO 激活细菌 F-ATP 酶分子机制的神秘面纱:探索能量代谢关键酶调控新奥秘

【字体: 时间:2025年05月08日 来源:Biochemistry (Moscow) 2.3

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  质子 FOF1 ATP 合酶在能量代谢中作用关键,其活性受多种机制调控。为探究 LDAO 激活该酶的机制,研究人员开展研究。他们发现 LDAO 或结合于催化位点,影响 β 亚基环区,且在硫酸盐存在时激活作用更强。这有助于深入理解酶调控机制。

  质子 FOF1 ATP 合酶(FOF1 ATP synthase)能利用质子动力势(protonmotive force,pmf),催化 ADP 和无机磷酸合成 ATP,同时进行跨膜质子转移。当 pmf 降低时,反应逆向进行,该酶利用 ATP 水解的能量转移质子,产生 pmf。该酶的 ATP 酶活性可被 ADP 以非竞争性方式抑制(ADP 抑制,ADP-inhibition),在许多细菌中,还会受 ε 亚基调节性 C 末端结构域构象变化的抑制。
月桂基二甲基氧化胺(Lauryldimethylamine oxide,LDAO)作为一种两性离子去污剂,能削弱上述两种抑制机制,显著提高该酶的 ATP 酶活性。因此,LDAO 有时被用于半定量评估该酶对这些调控机制的敏感性。然而,LDAO 在 ATP 合酶上的结合位点尚不明确,其抵消 ADP 抑制和 ε 亚基相关抑制的机制也不清楚。

研究人员进行分子对接,预测 LDAO 可能结合在 ATP 合酶的催化位点,无论该位点是空的还是结合了核苷酸。分子动力学模拟显示,LDAO 能影响催化位点附近 β 亚基环(大肠杆菌 ATP 合酶中 β404 - 415 残基)的流动性。对大肠杆菌酶中 β409 残基以及枯草芽孢杆菌 ATP 合酶中相应的 β419 残基进行突变分析,发现这些残基侧链的类型确实会影响 LDAO 对 ATP 酶活性的刺激作用。此外,研究人员还发现,与无硫酸盐培养基相比,在含有 100 mM 硫酸盐的环境中,LDAO 对该酶的激活作用更强。这一现象可能是由于硫酸盐增强了 ADP 对该酶的抑制作用。

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