探秘 PET 放射组学特征集:解析多重共线性,解锁冗余特征密码

【字体: 时间:2025年05月08日 来源:European Radiology 4.7

编辑推荐:

  在放射组学研究中,[1?F] FDG - PET 放射组学特征集存在多重共线性问题。研究人员分析 5 个不同肿瘤类型的独立 [1?F] FDG - PET 队列,发现至少三分之二的特征可因强多重共线性被省略,这有助于简化分析、降低统计负担。

  在医学影像学飞速发展的当下,放射组学(Radiomics)作为新兴领域备受瞩目。它旨在从医学影像中提取大量定量特征,挖掘潜在的影像生物标志物,以助力疾病的诊断、治疗和预后评估。然而,在实际应用中,放射组学特征集却面临着诸多挑战。
目前,放射组学特征大多是手工设计的,缺乏明确的生物学依据。许多特征从其他图像量化领域借鉴而来,虽然特征数量众多,约有 100 个左右,但它们之间的相关性却错综复杂。例如,有些早期研究提出的放射组学特征与肿瘤体积存在强关联,却未能充分考虑特征间的内在联系,导致模型解释性差,难以真正揭示疾病机制。而且,这些强相关的特征还会引发统计难题,如统计模型的过拟合现象,影响机器学习模型的交叉验证结果,使样本量计算变得困难重重。

为了解开这些谜团,来自荷兰莱顿大学医学中心(Leiden University Medical Center)、格罗宁根大学医学中心(University Medical Center Groningen)等多个机构的研究人员联合开展了一项研究。他们聚焦于 [1?F] 氟 - 2 - 脱氧 - D - 葡萄糖([1?F] FDG)正电子发射断层扫描(PET)放射组学特征集的多重共线性问题,试图找出可通用的非冗余特征,从而优化放射组学分析流程。这项研究成果发表在《European Radiology》杂志上,为该领域的发展带来了新的曙光。

研究人员主要运用了以下关键技术方法:

  1. 数据收集:回顾性分析 5 个已发表的 [1?F] FDG - PET 放射组学研究数据,涵盖非小细胞肺癌(NSCLC,35 例)、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤(PPGL,40 例)、头颈部鳞状细胞癌(HNSCC,54 例)、[1?F] FDG 阳性且细胞学不确定的甲状腺结节(84 例)以及胃癌(206 例)患者队列 。
  2. 定量图像分析:在不同队列中,采用自适应阈值或模糊局部自适应贝叶斯(FLAB)算法勾画感兴趣体积(VOI),并使用 PyRadiomics 软件提取 104 个放射组学特征,同时计算总病灶糖酵解(TLG) 。
  3. 统计分析:通过计算绝对 Spearman 秩相关系数矩阵评估特征间相关性;进行聚类分析,将强相关特征分组,筛选出代表性非冗余特征 。

下面来看具体的研究结果:

  1. 多重共线性广泛存在:在所有 5 个队列中均观察到放射组学特征集的多重共线性,且相关矩阵呈现相似模式。105 个特征中,72 个特征在所有 5 个队列中与其他特征存在极强相关性(ρ>0.9);90 个特征存在强相关性(ρ>0.7)。若考虑任意 4 个队列,相关特征数量更多。
  2. 聚类分析筛选非冗余特征:对 5 个队列的平均相关矩阵进行聚类分析,在 ρ>0.9 的阈值下,确定了 35 个聚类,每个聚类选择 1 个代表性非冗余特征,如扁平度(Flatness)、球形度(Sphericity)等;在 ρ>0.7 的阈值下,得到 15 个聚类和相应的非冗余特征 。这些非冗余特征分布在不同特征类别中,形状和邻域灰度差异矩阵(NGTDM)类别的非冗余特征相对较多 。

研究结论和讨论部分意义重大。研究表明,放射组学特征集中存在大量冗余特征,至少三分之二的特征可因强多重共线性被省略。采用更宽松的阈值,能识别出更多冗余特征。减少特征数量可大幅降低过拟合风险,简化放射组学特征签名的解释过程,使样本量计算更具可行性,为后续研究奠定坚实基础。

然而,研究也存在一定局限性。如回顾性分析导致各队列特征提取设置略有差异,虽不影响冗余特征的相似性结论,但统一设置会使结果更可靠;未考虑 Spearman 相关性的 p 值,且聚类分析基于平均相关矩阵,可能掩盖部分队列的真实情况;仅分析了 105 个符合图像生物标志物标准化倡议(IBSI)的特征,对于更多特征的情况未涉及;研究仅针对手工设计的放射组学,深度学习放射组学不在研究范围内。

尽管如此,这项研究仍为放射组学领域指明了方向。它提醒研究人员在后续研究中,应更加关注特征的选择和优化,进一步探究其他疾病、放射性药物和成像方式下放射组学特征集的多重共线性情况,同时评估仅使用非冗余特征的放射组学模型性能,为精准医学的发展贡献更多力量。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号