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酒精性肝病（ALD）及相关肝细胞癌（HCC）发病机制与肠道微生物群改变有关，但此前缺乏相关研究。研究人员运用 16S rRNA 测序和微生物培养组学，发现 Thomasclavelia ramosa 与 ALD 和 ALD-HCC 有关，为肝癌诊疗提供新思路。
在人体的微观世界里，肠道微生物群就像一个神秘的 “小宇宙”，对健康有着至关重要的影响。其中，酒精性肝病（ALD）和与之相关的肝细胞癌（HCC），近年来成为科学界重点关注的对象。已知 HCC 是最常见的肝癌类型，主要与慢性肝病相关，而 ALD 是其主要风险因素之一。虽然酒精、肝病和癌症之间的联系已被确认，但具体机制仍不明确，尤其是肠道微生物群在其中扮演的角色。
此前，多项基于 16S rRNA 扩增子测序或鸟枪法测序的宏基因组研究，对 ALD 患者的肠道菌群失调进行了探究，但均未从培养组学的角度展开研究。而且宏基因组组装基因组（MAGs）存在可靠性问题，因此在研究肠道病原体时，培养法依然不可或缺。正是在这样的背景下，来自法国 IHU Méditerranée Infection、Aix - Marseille Université 等机构的研究人员，开展了一项极具意义的研究，相关成果发表在《Gut Pathogens》杂志上。
为了深入探究肠道微生物群与 ALD 和 ALD-HCC 的关系，研究人员采用了多种技术方法。他们开展了一项病例对照研究，共纳入 59 名参与者，包括 35 例 ALD 患者（其中 19 例伴有 HCC）和 24 名对照者。研究人员收集了所有参与者的粪便样本，运用 v3 - v4 16S rRNA 扩增子测序进行分析；同时，从 ALD 患者中选取 11 份样本，从对照者中选取 10 份样本，进行微生物培养组学研究。微生物培养组学是一种基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI - TOF MS）和模拟自然微环境的高通量培养方法。
研究结果令人瞩目：
- ALD 相关细菌属的发现：通过微生物培养组学分析发现，ALD 组中 Thomasclavelia、Enterocloster、Clostridium 和 Peptoniphilus 这四个细菌属的物种多样性增加。
- T. ramosa 的显著差异：在培养的物种水平上，T. ramosa 在所有 ALD 患者中均被检测到，而在对照组中仅占 20%，其在病例组和对照组中的出现频率差异显著。
- Enterocloster 物种的富集：研究再次发现 Enterocloster bolteae 在酒精性肝病中富集，且这一关联仅通过培养组学发现，16S rRNA 测序未检测到。
- 两种方法均证实的富集物种：通过线性判别分析（LDA），发现 T. ramosa 和 Mediterraneibacter gnavus 是在 ALD 中通过培养组学和 16S rRNA 测序均被证实富集的物种。
- 与 HCC 相关的物种：综合分析表明，T. ramosa 是通过培养组学和测序鉴定出的与 ALD - HCC 相关的唯一物种。
在讨论部分，研究人员指出，T. ramosa 此前已被发现与多种严重感染以及癌症相关，本研究进一步表明它可能是与 ALD 和 ALD - HCC 相关的肠道致病共生菌的最佳候选者之一。虽然研究存在样本量小和缺乏实验证据等局限性，但 T. ramosa 与疾病的显著关联依然得到了有力支持。而且研究结果的可靠性得益于微生物培养组学，它能够准确鉴定出具有生物活性的微生物。未来研究可通过扩大样本量、运用深度测序和自动化微生物培养组学技术，进一步探究 T. ramosa 在肝癌发生中的作用。
总的来说，这项研究首次从微生物培养组学的角度，对 ALD 和 ALD - HCC 患者的肠道微生物群进行了特征分析，发现 T. ramosa 可能在酒精相关肝癌的发生发展中发挥重要作用。这一发现为深入理解肝癌的发病机制提供了新视角，也为未来肝癌的诊断和治疗开辟了新方向。
