解锁人类 CHD1 重塑核小体机制:结构解析开启染色质调控新篇

【字体: 时间:2025年05月08日 来源:Molecular Cell 14.5

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  染色质重塑剂在基因表达调控中作用关键,但相关机制不明。研究人员开展人染色质结构域解旋酶 DNA 结合蛋白 1(CHD1)与核小体结合的研究,通过冷冻电镜(cryo-EM)获 3 种结构,揭示关键元件,为理解染色质重塑机制提供框架。

  染色质重塑剂(Chromatin remodelers)通过控制核小体(nucleosome)定位来调控基因表达和基因组维持,但它们受调控的定向活动的结构基础仍不清楚。在这里,研究人员展示了人染色质结构域解旋酶 DNA 结合蛋白 1(CHD1)与核小体结合的三种冷冻电镜(cryo-EM)结构,揭示了此前未观察到的募集和调控状态。研究人员发现了一种称为 “锚定元件(anchor element)” 的结构元件,它将 CHD1 的 ATP 酶(ATPase)马达与核小体进入端的酸性补丁相连。该锚定元件与其他调控模块协同作用,其中包括门控元件(gating element),门控元件发生的构象变化对重塑过程至关重要。这些结构展示了 CHD1 的 DNA 结合区域在重塑过程中如何与进入端和退出端的 DNA 结合,以实现定向滑动。观察到的这些结构元件在染色质重塑剂中是保守的,这表明存在一种统一的核小体识别和重塑机制。研究结果揭示了染色质重塑剂如何将核小体募集与调控的 DNA 易位相偶联,为理解除 DNA 易位之外的染色质重塑剂机制提供了框架。
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