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靶向SHOC2-RAS相互作用:RAS突变癌症治疗的新策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月08日 来源:Nature 50
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本研究针对RAS突变癌症(尤其是NRASQ61*突变)缺乏有效靶向疗法的难题,通过全基因组筛选发现SHOC2是RASQ61*肿瘤的依赖性蛋白。研究人员解析了SHOC2-NRASQ61R复合物晶体结构,并通过高通量筛选获得小分子抑制剂,首次证实靶向SHOC2-RAS蛋白互作可抑制MAPK信号通路和肿瘤增殖。该研究为RAS突变癌症(特别是黑色素瘤)提供了全新治疗靶点,相关成果发表于《Nature》。
RAS基因突变是人类癌症中最常见的驱动突变,其中HRAS、NRAS和KRAS的激活突变约占所有肿瘤的30%。尽管近年来针对KRASG12C和KRASG12D的抑制剂取得突破,但NRASQ61*突变(黑色素瘤第二大驱动突变)仍缺乏有效靶向药物。这种突变导致RAS蛋白持续处于GTP结合的活化状态,但传统靶向策略难以干预,使得NRAS突变黑色素瘤患者面临治疗困境。
为破解这一难题,来自诺华生物医学研究所的Zachary J. Hauseman、Frédéric Stauffer等研究人员开展了一项系统性研究。他们首先构建了KRAS/NRAS不同突变位点(G12C/D和Q61R)的Ba/F3同基因细胞模型,通过全基因组CRISPR筛选发现SHOC2是RASQ61*的特异性依赖因子。进一步分析癌症依赖性图谱(DepMap)数据证实,SHOC2在NRASQ61*黑色素瘤中具有显著选择性。
研究团队通过多项关键技术揭示了SHOC2的作用机制:
研究结果可分为四个关键发现:
SHOC2是RASQ61*的关键依赖因子
在Ba/F3同基因模型中,SHOC2敲除对NRAS/KRASQ61R细胞表现出强致死性,而对G12C/D突变影响较小。临床相关模型分析显示,SHOC2敲低显著抑制NRASQ61*黑色素瘤细胞增殖(如IPC298和MUGMEL2异种移植模型肿瘤体积减少>80%),其效果与直接敲除NRAS相当。转录组分析证实SHOC2调控MAPK通路关键基因(DUSP5、SPRY4等)。
SHOC2与NRASQ61R形成稳定二元复合物
生物物理实验表明,SHOC2仅与GTP结合的RASQ61*突变体(NRASQ61R KD=11 μM;KRASQ61R KD=12 μM)相互作用,而与GDP结合形式或野生型RAS无结合。X射线结构显示,NRASQ61R通过Switch I/II区域与SHOC2的LRR1-9结构域结合,形成4个盐桥和6个氢键。特别值得注意的是,致癌突变R61直接与SHOC2 T264形成氢键,这解释了突变特异性结合的分子基础。
发现首个靶向SHOC2的小分子抑制剂
通过TR-FRET筛选获得先导化合物1(IC50=6.19 μM),经结构优化得到活性更高的化合物6(IC50=48 nM)。晶体结构显示化合物6结合于SHOC2的RAS互作界面,其羧酸基团与SHOC2 R223/Q269形成关键相互作用。特异性实验证实,SHOC2 G290A突变体完全抵抗化合物6的抑制作用,而保留NRAS结合能力。
化合物6选择性抑制RASQ61*信号通路
在NRASQ61R黑色素瘤细胞中,化合物6剂量依赖性地抑制MEK/ERK磷酸化(EC50=3-10 μM),增加CRAF S259抑制性磷酸化水平,但对BRAFV600E突变细胞无影响。3D培养实验显示,化合物6特异性抑制RAS突变肿瘤细胞增殖,尤其对Q61突变效果显著(优于G12C/D)。转录组分析揭示化合物6可下调MAPK通路相关基因表达。
这项研究具有多重重要意义:首先,它揭示了SHOC2-RAS互作是RASQ61*突变肿瘤的"阿喀琉斯之踵",为这类难治癌症提供了全新治疗靶点。其次,研究团队首次解析了SHOC2-RAS复合物结构,并开发出首个靶向该互作的小分子工具化合物,突破了LRR蛋白"不可成药"的传统认知。最后,该研究提出的"靶向RAS效应蛋白"策略,为克服直接靶向RAS的耐药问题提供了新思路。
特别值得注意的是,约25%的黑色素瘤携带NRASQ61*突变,每年仅欧美就有约5万新发病例。当前临床使用的泛RAF抑制剂(如belvarafenib)因毒性限制无法有效抑制这类肿瘤。相比之下,靶向SHOC2可能具有更好的安全性和特异性,因为SHOC2敲除小鼠可存活且表型温和。未来,SHOC2抑制剂与MEK抑制剂或KRASG12C抑制剂的联用策略值得探索,这可能为克服肿瘤耐药提供新方案。
这项发表于《Nature》的研究不仅为RAS突变癌症治疗开辟了新途径,其采用的"从遗传依赖到药物发现"的系统性研究范式,也为其他难成药靶点的开发提供了宝贵借鉴。随着后续化合物药代动力学性质的优化,SHOC2抑制剂有望成为首个针对NRASQ61*黑色素瘤的精准疗法。
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