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非小细胞肺癌(NSCLC)患者对新辅助化疗(NAC)反应差异大,缺乏有效治疗前评估手段。研究人员开发 DeepDrRVT 模型预测 NAC 病理反应,该模型预测性能佳、与病理评估相关性强且能评估预后,为临床治疗决策提供有力工具。
在肺癌的治疗领域,非小细胞肺癌(NSCLC)是 “重头戏”,它约占所有肺癌病例的 85%,也是全球癌症相关死亡的主要原因之一。新辅助化疗(NAC)作为可切除 NSCLC 患者的重要治疗策略,却面临着一个棘手的问题:患者对 NAC 的个体反应差异极大。这就好比同样的 “作战计划”,不同的 “士兵” 执行起来效果千差万别,使得 NAC 在临床应用中的有效性大打折扣。而且,与新辅助靶向治疗和免疫治疗不同,NAC 目前缺乏有效的治疗前组织学生物标志物,这让医生在制定治疗方案时常常 “摸不着头脑”,难以精准地为患者选择最合适的治疗方式。因此,找到可靠的治疗前评估方法,优化个体化治疗策略,成为了亟待解决的难题。
为了攻克这一难关,温州医科大学、首都医科大学附属北京朝阳医院、中国医学科学院肿瘤医院、北京大学肿瘤医院等多家机构的研究人员联合开展了一项研究。他们的研究成果发表在《npj Precision Oncology》上,为 NSCLC 患者的治疗带来了新的希望。
研究人员开发并验证了一种名为 DeepDrRVT 的弱监督深度学习模型,该模型整合了自监督特征提取和基于注意力的深度多实例学习,旨在利用治疗前活检图像改善 NAC 治疗决策。在研究过程中,有几个关键的技术方法起到了重要作用。首先,研究人员收集了来自中国医学科学院肿瘤医院(CHCAMS)和北京大学肿瘤医院(PUCH)的 331 例患者的临床病理数据和活检图像,这些数据和图像成为了模型训练和验证的 “原材料”。其次,在图像采集和处理方面,对福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)的治疗前活检样本进行苏木精 - 伊红(H&E)染色,并数字化成全切片图像(WSIs),经过一系列严格的质量控制和处理步骤,将其转化为可供模型分析的图像数据。然后,利用基于 Transformer 的对比学习模型 CtransPath 对预处理后的图像进行特征提取,为模型提供了丰富的特征信息。最后,使用基于注意力的深度多实例学习(attMIL)架构开发 DeepDrRVT 模型,并通过一系列优化和训练,让模型具备了强大的预测能力。
下面来看看具体的研究结果:
- 研究设计和患者特征:研究人员进行了一项发现和验证研究,从 385 名患者中筛选出 331 名符合条件的患者,并将其分为训练队列(n = 113)、内部测试队列(n = 76)和外部验证队列(n = 142)。这些患者的基线特征在不同队列之间具有可比性,且在达到主要病理反应(MPR)和未达到 MPR 的患者之间,基线特征也没有统计学上的显著差异。
- 深度学习模型对病理反应的预测:DeepDrRVT 模型展现出了强大的预测性能。在训练队列中,预测完全病理反应(CPR)和 MPR 的曲线下面积(AUC)分别达到了 0.954 和 0.968;在内部测试队列中,AUC 分别为 0.872 和 0.893;在外部验证队列中,AUC 分别为 0.848 和 0.831。这表明该模型在不同队列中都能较为准确地预测病理反应。此外,通过 Youden 指数确定数字截断值后,模型能够有效区分 MPR + 和 MPR - 患者,并且数字评估的残余存活肿瘤百分比(% RVT)与专业病理学家的视觉评估高度相关。
- DeepDrRVT 推断的数字 % RVT 与无病生存期的关系:通过无病生存期(DFS)分析评估 DeepDrRVT 在评估 NAC 临床疗效方面的预后价值,发现 Dig.MPR + 组的 DFS 明显长于 Dig.MPR - 组。多变量 Cox 回归分析证实,DeepDrRVT 是 DFS 的独立预后因素,且在不同组织学亚型和治疗周期数的亚组分析中,也验证了其强大的预后分层和 MPR 预测能力。
- DeepDrRVT 的解释:研究人员利用 attMIL 架构生成注意力热图,发现预测 % RVT 分数较高的患者,模型注意力更多集中在肿瘤纯度较高、核异型性和核多形性较高的肿瘤区域;而分数较低的患者,模型注意力则集中在肿瘤纯度较低的区域。此外,比较 Dig.MPR + 和 Dig.MPR - 组治疗后标本的组织病理学特征,发现两组在多核巨细胞、泡沫巨噬细胞、胆固醇裂隙、坏死、浆细胞、中性粒细胞和肿瘤周围淋巴细胞等方面存在显著差异。
在研究结论和讨论部分,DeepDrRVT 模型利用活检图像和基于注意力的多实例学习框架,能够准确预测 NSCLC 患者对 NAC 的病理反应,为临床医生在 NAC 治疗前提供了有价值的决策工具。通过概率分层 MPR 可能性,可实现风险适应性治疗框架,帮助医生为不同患者制定更合适的治疗方案。然而,该研究也存在一些局限性。比如,研究是回顾性的,可能存在潜在偏差,未来需要在更大规模的多中心队列中进行前瞻性验证;活检标本可能无法完全捕捉肿瘤微环境的空间异质性,未来模型可整合分子数据或影像组学特征来提高模型性能;基于 H&E 染色切片的 DeepDrRVT 模型可能不足以预测免疫治疗的反应。但总体而言,这项研究为 NSCLC 患者的治疗开辟了新的道路,为精准医疗提供了重要的技术支持,有望在未来进一步改善患者的治疗效果和预后。