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肺结核（TB）诊断面临难题，常规方法存在局限。研究人员开展广谱病原体特异性靶向二代测序（tNGS）诊断少菌型肺结核（PTB）的研究。结果显示 tNGS 敏感性高但特异性略低，在非 TB 患者中病原体检测率高。该研究为临床诊断提供参考。
肺结核，这个 “古老” 的传染病，近年来又重新成为全球公共卫生的一大挑战。2023 年，它一举成为单一感染源致死的 “头号杀手”，夺走了 125 万人的生命，死亡人数几乎是艾滋病的两倍 ，全球预估有 1080 万新发病例。虽说 TB 的发病率增长速度有所下降，但从 2015 年到现在，累积降幅仅有 8.3%，和 2025 年要实现发病率降低 50% 的目标相比，差距还很大。
在肺结核的诊疗过程中，精准诊断和鉴别诊断极为关键，这不仅关系到患者能否得到及时有效的治疗、改善预后，还影响着疾病传播链能否被成功切断。然而，传统的诊断方法却 “力不从心”。涂片显微镜检查敏感性不高，仅在 30 - 60% 之间，而且还无法区分结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）和非结核分枝杆菌（non - tuberculous mycobacteria，NTM）；细菌培养虽然是诊断的 “金标准”，可它需要 2 - 8 周的漫长孵育时间，这就导致患者无法及时确诊和治疗；免疫检测技术，比如结核菌素皮肤试验和干扰素 - γ 释放试验，只能作为辅助手段，因为它们没办法区分活动性 TB 和潜伏性 TB 感染（latent TB infection，LTBI）。2011 年问世的 Xpert MTB/RIF 检测，虽然操作简便、全自动化，对实验室要求也不高，但在涂片阴性的支气管肺泡灌洗液（bronchoalveolar lavage fluid，BALF）样本检测中，敏感性也只有 73.1%。
面对这些困境，靶向二代测序（targeted next - generation sequencing，tNGS）技术的出现，给肺结核的诊断带来了新希望。此前，针对 MTB 的 tNGS 在诊断、耐药基因检测以及 NTM 鉴别方面展现出了一定价值，但主要用于专科医院。而广谱病原体特异性 tNGS 在综合医院诊断肺部感染时更有优势，可它在综合医院诊断少菌型肺结核方面的应用价值，却一直没有研究。于是，重庆医科大学附属第一医院的研究人员挺身而出，开展了一项回顾性研究，试图填补这一空白，相关成果发表在《Diagnostic Microbiology and Infectious Disease》杂志上。
研究人员从 2024 年 1 月 1 日到 2024 年 10 月 31 日，收集了重庆医科大学附属第一医院 423 名患者的数据。这些患者都接受了 BALF 检测，检测项目包括抗酸染色、培养、Xpert MTB/RIF 以及 tNGS。不过，因为各种原因，有 47 名患者的数据被排除在外。
在研究中，关键技术方法主要有以下几种：首先是样本选取，研究人员选择了 BALF 样本，这种样本获取相对容易，对患者创伤小，而且在诊断肺部疾病方面很有价值；其次就是 tNGS 技术，它通过针对上百种与呼吸道感染相关的致病和耐药基因进行检测，利用超多重 PCR 文库制备系统或者探针捕获技术，实现对目标序列的富集，然后进行二代测序，从而精准检测病原体。
下面来看看研究结果：
- tNGS 对少菌型肺结核的诊断性能：在 83 例微生物学确诊的 PTB 病例中，tNGS 的敏感性高达 91.6%，远高于 Xpert 的 79.5% 和培养的 73.5%（p<0.001） 。不过，它的特异性为 95.6%，比 Xpert 的 98.6% 略低（p=0.01） 。这表明 tNGS 在检测少菌型肺结核时，虽然不容易漏诊，但可能会出现一些误诊的情况。
- tNGS 在非 TB 患者中的病原体检测情况：在 293 名非 TB 患者中，tNGS 在 86.7%（254/293）的 BAL 样本中检测到了病原体，一共识别出 300 种病原体，不过和临床诊断的符合率只有 47.3%（142/300） 。这说明 tNGS 虽然能检测出很多病原体，但这些结果和实际临床诊断的匹配度还有待提高。
从研究结论和讨论部分来看，这项研究意义重大。它系统评估了 tNGS 在少菌型 PTB 诊断和与其他肺部疾病鉴别诊断中的作用，让我们清楚地认识到了 tNGS 的优势和局限。tNGS 敏感性高，这意味着它有可能帮助医生更早地发现少菌型肺结核患者，避免病情延误；但特异性相对较低的问题也提醒医生，在解读 tNGS 检测结果时要格外谨慎，不能仅凭这一项结果就下诊断。另外，tNGS 在非 TB 肺部疾病中的高病原体检测率，虽然和临床诊断符合率不高，但也为临床医生提供了更多的诊断思路，说不定未来能通过进一步优化技术，提高检测结果的准确性和临床实用性。总的来说，这项研究为 tNGS 在临床的应用提供了宝贵的真实世界数据，为今后肺结核的精准诊断和治疗指明了方向，有望推动肺部感染性疾病诊疗水平的提升。
