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本文介绍了开源认知神经科学工具包 CalliCog,它专为自由活动的小型非人灵长类(NHPs)设计,能在笼内进行自动化认知实验,还可整合神经记录。该工具包为研究灵长类认知提供了新途径,有助于缩小临床前模型与人类认知研究的差距。
研究背景
非人灵长类(NHPs)在研究人类认知方面具有重要价值,其神经生物学、生理和遗传与人类相似。然而,传统的 NHPs 认知研究受限较多。一方面,研究多集中在少数配备先进设施的专业实验室,需要专业知识和大量资源,且样本量小、成本高。另一方面,传统认知行为测试方法存在缺陷。以往研究常将动物从家笼转移到测试环境,这种方式会给动物带来压力,影响数据有效性,还需要长时间的习惯化训练。而且传统方法多针对大型 NHPs,如猕猴,小型 NHPs 如普通狨猴(Callithrix jacchus)对约束更敏感,分离其社会住房进行测试会对其造成更大伤害。
近年来,家笼测试在 NHPs 研究中逐渐受到关注。这种测试方式能减少外部压力源,降低习惯化时间,还可实现自动化,提高实验通量。但目前家笼测试系统存在诸多问题,如不同系统接口和测试电池不同,难以比较结果;部分设备专利性强、价格昂贵,协议不灵活,缺乏可及性。为解决这些问题,研究团队开发了开源平台 CalliCog(Callithrix jacchus认知平台)。
CalliCog 系统介绍
CalliCog 采用模块化设计,主要由两部分组成:一是连接到家笼进行实验的操作室,二是用于监控和控制实验的计算机(执行 PC)。操作室由内部的微型计算机(代理 PC)控制,与执行 PC 通过有线网络实时通信。执行 PC 可向代理 PC 发送任务指令,并根据动物行为表现反馈调整指令,实现对多个操作室的监控和控制,支持高通量测试。
操作室设计注重成本效益和易用性,主要使用低成本、易获取的材料。其内部有多个防水隔间,包括测试室、用于放置代理 PC 和电子元件的上隔间、放置触摸屏的后隔间以及放置遥测接收器的下隔间。测试室内配备摄像头用于视频监控,还有触摸屏、奖励喷嘴和可调节高度的训练杆等装置。电子元件通过铜带屏蔽,减少电磁干扰。
CalliCog 软件基于自定义脚本和第三方开源 Python 包开发,核心部分使用 PsychoPy 工具包。软件功能分布在代理 PC 和执行 PC 上,用户可通过执行 PC 的网络应用设计实验协议。协议设计灵活,无需编程知识,用户可定义实验任务和动物进展标准,系统会根据动物行为表现自动推进实验。
实验验证
研究团队使用 CalliCog 对 8 只成年普通狨猴进行实验,这些狨猴来自两个不同的饲养设施,且均未参与过行为实验。
在触摸屏训练实验中,狨猴需完成 7 个阶段的训练任务,通过逐渐减少刺激大小、改变刺激位置等方式,让狨猴学会与视觉刺激互动以获取液体奖励。结果显示,所有狨猴平均在 44.1 次会话(标准差为 14.7)和 14 天(标准差为 8.0)内完成训练,不同设施的狨猴训练时间无显著差异。
在新颖辨别和反转学习实验中,狨猴先进行辨别训练,学会区分正确和错误刺激,然后进行新颖辨别测试和反转学习阶段。实验发现,刺激对 9 可能是影响动物表现的异常值,被排除在后续分析之外。在反转学习过程中,研究团队分析了动物的学习曲线、错误次数以及采用的策略等,发现动物在学习阶段使用正反馈和负反馈的能力相似。
在延迟匹配样本任务(DMTS)实验中,部分完成反转学习的狨猴参与训练和测试。实验通过设置不同的延迟时间,评估狨猴的工作记忆。结果显示,测试的狨猴平均零延迟表现为 83.69%(标准差 = 12.05%),平均性能半衰期为 5.73 秒(标准差 = 3.25 秒),不同狨猴的性能半衰期存在差异。
研究团队还将现成的体内神经记录系统与 CalliCog 集成,对部分完成 DMTS 测试的狨猴进行手术植入无线电遥测设备,记录其在执行任务时的 ECoG 数据。通过同步行为时间戳和神经数据,分析发现 ECoG 活动与任务事件相关,不同频率带的功率在任务的不同阶段存在显著变化,但与以往使用局部场电位(LFP)研究工作记忆的结果存在差异。
研究优势与局限
与其他认知实验系统相比,CalliCog 具有显著优势。它专为小型 NHPs 设计,考虑了小型 NHPs 的特点,如采用电容式触摸屏、设置训练杆、控制刺激颜色等。其自动化程度高,能根据动物单试次反应调整实验,且具有较高的可及性,提供了完整的蓝图,方便用户复制搭建系统。
然而,该研究也存在一定局限性。实验动物数量相对较少,可能无法充分考虑个体差异因素。无线神经记录方法易受电磁干扰,影响信号接收。网络时间协议(NTP)的精度可能因用户配置而异,不适用于某些需要高精度时间同步的技术。
研究意义与展望
CalliCog 为小型 NHPs 的认知行为实验提供了新方法,能在自然环境下对动物进行训练和测试,记录神经活动。通过使用 CalliCog,行为学上未经训练的普通狨猴能熟练完成认知任务,且实验结果可靠。这一工具包的开源特性,有望推动更多关于灵长类认知的研究,促进对灵长类特定神经回路和行为的理解,为人类健康和疾病相关研究提供有价值的参考,缩小临床前模型与人类认知研究之间的差距,助力揭示人类认知的奥秘。未来,随着技术的不断改进和研究的深入,CalliCog 有望在认知神经科学领域发挥更大的作用,为相关研究提供更有力的支持。