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为解决欧洲儿童癌症数据碎片化、研究受限等问题,研究人员开展 UNCAN.eu 平台相关研究。通过建立欧洲联邦癌症研究数据中心,整合多源数据。结果显示该平台有望加速儿童癌症研究,意义在于推动创新诊疗,促进国际合作。
在儿童癌症的研究领域,一直存在着诸多难题。欧洲虽有不少儿童癌症数据库,但数据分散、获取困难,尤其在获取真实世界数据时,复杂的流程让研究进展缓慢。不同机构间的数据各自为政,就像一座座孤岛,无法形成合力,严重阻碍了对儿童癌症的深入研究和创新治疗的探索。而且,儿童癌症种类繁多,其中不乏罕见和超罕见的类型,对这些病症的研究迫在眉睫,急需一个强大的平台来整合资源,推动研究的发展。
在这样的背景下,来自多个机构的研究人员,其中 SIOP Europe 和 CCI-Europe 等积极参与,共同致力于 UNCAN.eu 平台的研究与建设。他们的研究旨在打造一个欧洲联邦癌症研究数据中心(European Federated Cancer Research Data hub),整合各类癌症研究数据,促进研究人员之间的合作与数据共享。
研究最终得出结论,UNCAN.eu 平台具有巨大的潜力。它能够整合多组学(multi-omics)、成像、临床和真实世界等多源数据,为癌症研究提供全面而丰富的信息。特别是在儿童癌症研究方面,该平台有望汇聚超过 12000 例肿瘤样本的综合测序数据,极大地拓展研究规模。这不仅有助于深入了解儿童癌症的发病机制,还能加速创新诊断工具和治疗方法的开发。此外,通过建立与美国国家儿童癌症数据倡议(National Childhood Cancer Data Initiative)的合作,能够进一步提升研究的国际影响力,推动全球儿童癌症研究的进步。
此项研究成果意义重大。它为欧洲儿童癌症数据战略(European Childhood Cancer Data Strategy)的实施提供了有力支持,有望打破数据壁垒,促进各国研究人员的协作。同时,通过整合大量数据,能够更深入地研究罕见和超罕见儿童癌症,为这些病症的治疗带来新的希望。这一成果若广泛应用,将为全球儿童癌症患者及其家庭带来福音,推动儿童癌症诊疗水平迈向新的高度。该研究成果发表于《EJC Paediatric Oncology》。
研究人员开展研究时用到的主要关键技术方法:通过建立 UNCAN.eu 平台,整合来自多个欧洲和国际精准儿科肿瘤学项目的综合测序数据,包括全基因组测序(WGS)、全外显子组测序(WES)、RNA 测序(RNAseq)等。同时,收集多组学数据、空间成像数据、放射和病理成像数据以及临床记录和家族史数据等,从多维度为研究提供数据支持。样本队列来源包括德国的 INFORM、法国的 MAPPYACTS、荷兰的 ITHER/MaxM 等多个精准儿科肿瘤学项目中的儿科肿瘤样本。
研究结果
- 确定关键研究领域和用例:通过自下而上的过程,在预防、早期检测、治疗耐药性、癌症与衰老、儿童癌症和生存等 6 个领域确定了关键科学问题,并提出了具体的研究用例。在儿童癌症领域,优先绘制不同地区和人群中儿童癌症亚型的微环境特征,将肿瘤微环境的表征和治疗靶点研究作为用例。
- 数据整合与平台建设:UNCAN.eu 平台计划成为中央枢纽,实现对各国癌症数据节点的联邦访问,整合来自模式生物和患者队列的现有及新生成的研究数据集,包括多组学数据、图像、数字病理学数据、真实世界和临床试验数据、生活方式数据等。该平台还将与欧洲癌症图像联盟(EUCAIM)、欧洲癌症开放科学云(EOSC4cancer)等基础设施和项目相互连接,并遵守欧洲健康数据空间(Europe Health Data Space)的规则和规定。
- 促进研究合作与发展:UNCAN.eu 平台的建设预计分阶段进行,2026 年欧洲癌症研究数据中心预计投入使用,每年通过欧盟后续招标推出一系列研究用例,每个用例由一个联盟负责解决癌症研究中的关键挑战,并为平台提供数据支持。到 2030 年,该平台有望为欧洲虚拟癌症研究所奠定基础。
- 推动儿童癌症研究:在儿童癌症研究方面,UNCAN.eu 平台将整合多个欧洲和国际精准儿科肿瘤学项目的综合测序数据,扩大样本规模至超过 12000 例测序肿瘤样本,并计划生成和共享单细胞数据、空间转录组学和蛋白质组学数据,同时收集数字病理学、成像和电子健康记录数据,以支持创新诊断工具和治疗方法的开发。
研究结论和讨论
UNCAN.eu 平台的建设为欧洲儿童癌症研究带来了新的契机。通过整合多源数据,它能够解决当前数据碎片化和获取困难的问题,为研究人员提供更全面、更深入的研究资源。这不仅有助于深入了解儿童癌症的发生、发展机制,还能加速创新诊断和治疗方法的研发,对于改善儿童癌症患者的预后具有重要意义。同时,该平台促进了国际间的合作与交流,与美国相关项目的合作将进一步提升研究的广度和深度。然而,在平台建设和数据整合过程中,可能会面临数据隐私、安全以及不同国家和地区法规差异等问题,需要进一步探索有效的解决方案。总体而言,UNCAN.eu 平台的发展前景广阔,有望成为推动全球儿童癌症研究和治疗进步的重要力量。