mRNA 疫苗联合 NK 细胞:攻克 EB 病毒相关鼻咽癌的新希望

【字体: 时间:2025年05月08日 来源:Molecular Therapy Oncology 5.3

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  本文聚焦鼻咽癌(NPC)与爱泼斯坦 - 巴尔病毒(EBV)感染的关联。研究通过分析 EBV 基因组突变预测表位,构建多表位 mRNA 疫苗。发现疫苗联合自然杀伤细胞(NK)可协同抑制或根除人源化小鼠的 NPC 肿瘤,为治疗 EBV+NPC 提供了新策略。

  

引言


鼻咽癌(NPC)是鼻咽部的主要恶性肿瘤,其发病具有显著的地域差异。在世界大部分地区发病率较低,但在北非和东南亚等地呈地方性流行。传统治疗方法对局部区域疾病患者有效,但未分化的 NPC 具有高侵袭性和转移性,易导致初始治疗失败。目前,免疫疗法如免疫检查点抑制剂(ICIs)和过继细胞疗法(ACT)正处于积极研究阶段,为改善晚期 NPC 患者的治疗效果提供了新途径。

大多数未分化的 NPC 与爱泼斯坦 - 巴尔病毒(EBV)感染存在病因学关联。EBV 可在癌前病变中检测到,对 NPC 的发生发展至关重要,因此成为 NPC 靶向治疗的有吸引力的候选靶点。治疗性疫苗通过激发个体对病毒抗原的 T 细胞免疫,进而对抗 EBV 感染的癌细胞,已成为一种潜在的治疗选择。然而,早期临床试验表明,虽然治疗性 EBV 疫苗具有安全性和免疫原性,但仅部分患者表现出强烈的 T 细胞反应。

肿瘤疫苗的有效性受到肿瘤异质性、主要组织相容性复合体 I 类(MHC class I)下调和免疫抑制性肿瘤微环境(TMEs)的限制。目前,癌症疫苗常需与其他疗法联合使用,以克服免疫逃逸,提高治疗效果。自然杀伤细胞(NK)是一种专门针对新生异常转化细胞和病毒感染细胞的效应细胞群体,其介导的细胞毒性不依赖于人类白细胞抗原(HLA),可消除因 HLA 缺失而逃避免疫监视的癌细胞,如 EBV+NPC 细胞。研究表明,TME 中较高的 NK 细胞比例与 EBV+NPC 患者的预后改善相关。因此,肿瘤疫苗联合同种异体 NK 细胞有望通过激活肿瘤特异性适应性免疫和 MHC 非限制性细胞毒性发挥双重抗肿瘤作用,但二者联合治疗 EBV+NPC 的潜在协同效应尚未得到探索。

结果


  1. 预测具有广泛 HLA 覆盖的 EBV 表位:研究人员分析了 283 种与癌症相关的 EBV 菌株的基因组变异,以非癌起源的 B95 - 8 EBV 菌株为参考,预测由这些突变编码的免疫原性表位。结果发现 EBV 致癌基因中存在高频非同义单核苷酸变异(nsSNVs)和插入缺失(indels),并进一步预测出具有广泛 HLA 覆盖的免疫原性 EBV 表位。最终选择了 6 个预测具有广泛人群覆盖的表位用于后续的 mRNA 疫苗构建。
  2. mRNA 疫苗诱导抗原特异性 T 细胞反应:合成的多表位 EBV mRNA 疫苗(nEL 疫苗)在人源化小鼠 EBV+NPC 模型中进行测试。结果显示,接种 nEL 疫苗的小鼠在第 24 天和第 27 天肿瘤生长受到显著抑制,肿瘤组织重量明显减轻。此外,接种疫苗的小鼠对所有预测表位均产生了 T 细胞反应,且肿瘤病变中人类 CD4+和 CD8+T 细胞的浸润明显增加。然而,该疫苗在控制肿瘤生长方面的效果有限。
  3. 优化系统生产高质量人类 NK 细胞:为确保与 mRNA 疫苗联合治疗中合格人类 NK 细胞的持续生产,研究人员优化了 NK 细胞扩增方案。通过流式细胞术分析发现,优化后扩增的 NK 细胞中,超过 90% 的细胞表达 NK 细胞激活受体 NKG2D 和 NKp30,且大部分细胞(超过 90%)可表达颗粒酶 B 和穿孔素,表明其具有细胞毒性表型。该优化方法可稳定生产具有高活力和高纯度的细胞毒性 NK 细胞。
  4. 联合治疗促进 EBV+NPC 根除:在评估联合治疗的安全性后,研究人员在人源化小鼠 EBV+NPC 模型中评估了 nEL 疫苗与同种异体 NK 细胞联合治疗的效果。结果显示,联合治疗和单独 NK 细胞治疗均显著抑制了肿瘤生长,且联合治疗表现出更强的抗肿瘤效果,能够有效根除人源化小鼠中已建立的 NPC 肿瘤,50% 的联合治疗小鼠肿瘤完全消退。此外,联合治疗在不同遗传背景的人源化小鼠中均表现出良好的疗效,且安全性良好。
  5. 联合治疗引发的免疫反应特征:联合治疗的小鼠血清中人类肿瘤坏死因子 α(hTNF - α)和干扰素 γ(hIFN - γ)水平较高,表明联合治疗可协同诱导增强的抗肿瘤反应。通过细胞内细胞因子染色(ICS)和荧光激活细胞分选(FACS)分析发现,mRNA 疫苗的 6 种 EBV 抗原中,3 种诱导了 CD8+T 细胞反应,另外 3 种诱导了 CD8+和 CD4+T 细胞反应,表明诱导了平衡的适应性免疫反应。免疫组化(IHC)染色显示,联合治疗的肿瘤中效应细胞因子人类颗粒酶 B 和 IFN - γ 水平显著升高,且人类 NK 细胞和 T 细胞的浸润明显增加。

讨论


人源化小鼠模型在免疫肿瘤学研究中具有重要价值。在本研究中,使用 PBMC 人源化小鼠评估 mRNA 疫苗和联合治疗的有效性。虽然 PBMC 人源化 NOG 小鼠在引发抗原特异性体液反应方面能力有限,但能够恢复人类细胞免疫,有助于研究人类对癌症疫苗和过继细胞疗法的免疫反应。不过,该模型存在 GvHD 快速发展的局限性,本研究通过预筛选供体 PBMCs,尽量减少了 GvHD 对实验结果的影响。

从癌症相关 EBV 菌株中直接搜索表位是一种创新策略。研究人员通过分析病毒基因组中的非同义突变,预测出具有强 HLA 结合亲和力和广泛 HLA 覆盖的常见表位,并构建了 mRNA 疫苗。在疫苗免疫原性测定中,在不同 HLA 类型的人源化小鼠中检测到了针对每个表位的 T 细胞反应,但这些表位是否能被广泛的 HLA 等位基因呈递,还需进一步实验验证。

单独使用 mRNA 疫苗治疗效果不佳,可能是由于 mRNA 稳定性和翻译能力、疫苗接种时间和剂量、接种途径等因素影响,也可能与 PBMC 人源化小鼠中抗原呈递细胞(APCs)数量有限以及免疫抑制性 TME 有关。联合治疗策略具有重要意义,NK 细胞因其强大的抗肿瘤活性和良好的安全性,成为有吸引力的联合治疗选择。本研究中使用同种异体 NK 细胞,是因为其具有 “现成可用”、基线细胞毒性强、对 TME 驱动的抑制具有内在抗性等优势。

联合治疗比单一疗法具有更强的肿瘤控制或根除能力。其协同效应的机制可能包括 NK 细胞对 HLA 低表达或不表达的 NPC 细胞的识别和清除,以及 NK 细胞与抗肿瘤 T 细胞之间的复杂相互作用,如 NK 细胞通过 CD27 - CD70 相互作用促进保护性抗肿瘤 T 细胞免疫的发展,提供早期 IFN - γ 促进 Th1 细胞极化,进而促进 CD8+细胞毒性 T 细胞的增殖、激活和浸润。

材料和方法


  1. EBV 表位预测:收集 EBV 基因组测序数据,将序列读段映射到 EBV 参考基因组,调用基因组变异。对变异肽进行不同类 HLA 等位基因的结合亲和力预测,并计算群体覆盖率,最终选择 6 个表位用于 mRNA 疫苗构建。
  2. mRNA 疫苗构建和给药:基于先前报道的 DNA 骨架开发质粒模板,将编码表位的序列或 EGFP 亚克隆到质粒中,线性化后进行体外转录、纯化和加帽。将 nEL mRNA 与脂质体混合制备疫苗,每 3 - 4 天接种一次,共接种 3 次。
  3. 细胞系和细胞培养:购买 K562 和 HEK - 293T 细胞系,由香港大学的关新元教授提供 EBV+人 NPC 细胞系 CNE2 - EBV。所有细胞系经鉴定和支原体污染检测后,在含 10% FBS、青霉素和链霉素的 RPMI 1640 培养基中培养。
  4. 人源化小鼠模型:购买 NOD.Cg - PrkdcscidIl2rgtm1Sug/JicCrl(NOG)小鼠,在特定病原体 - free(SPF)环境下进行动物实验。通过 Ficoll - Hypaque 密度梯度离心纯化人 PBMCs,选择低同种异体反应性的供体 PBMCs 静脉注射到小鼠体内,建立人源化小鼠模型。随后,将 CNE2 - EBV 细胞皮下注射到小鼠右侧胁腹,建立人源化小鼠 EBV+NPC 模型。
  5. 体外 NK 细胞扩增和同种异体 NK 细胞输注:从健康供体的 PBMCs 中扩增 NK 细胞,使用优化的扩增方案,包括预包被培养瓶、添加特定细胞因子等。扩增后的 NK 细胞经计数和重悬后,静脉注射到小鼠体内,共注射 3 次。
  6. 流式细胞术:使用特定抗体对 NK 细胞进行表面染色和细胞内细胞因子染色,通过流式细胞仪分析 NK 细胞的表型和功能,以及抗原特异性 CD4+或 CD8+T 细胞反应。
  7. NK 细胞细胞毒性分析:将 NK 细胞与靶细胞(K562 或 CNE2 - EBV)按不同效应细胞 / 靶细胞比例共培养,通过 LDH 细胞毒性检测试剂盒分析培养上清,计算 NK 细胞的特异性杀伤率。
  8. ELISA:使用酶联免疫吸附测定(ELISA)试剂盒检测小鼠外周血中的人 IFN - γ 和 TNF - α 水平。
  9. 人 IFN - γ ELISpot 测定:使用细胞因子特异性酶联免疫斑点(ELISpot)试剂盒分析接种疫苗或对照小鼠的脾细胞中产生 hIFN - γ 的细胞。
  10. 免疫染色和组织学:对肿瘤和组织进行固定、脱水、石蜡包埋和切片。进行 H&E 染色和免疫染色,使用特定抗体检测相关蛋白的表达,通过显微镜观察并拍照。
  11. 统计分析:使用 GraphPad Prism 8.0 进行统计分析,根据不同实验数据选择合适的统计方法,如普通双向 ANOVA、非配对双尾 t 检验、普通单向 ANOVA 等,以确定数据的统计学意义。

本研究表明,EBV mRNA 疫苗与过继性 NK 细胞联合治疗是一种治疗 EBV+NPC 的潜在策略,但仍需进一步研究其协同机制和长期益处。

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