深度学习助力解析植物细胞板形成初期肌动蛋白微丝定位

【字体: 时间:2025年05月09日 来源:Plant Cell Reports 5.3

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  在植物细胞分裂研究中,为探究肌动蛋白微丝(AFs)在细胞板形成初期的定位与作用,研究人员利用深度学习图像恢复技术对烟草 BY-2 细胞进行 4D 成像。结果发现不同 AFs 探针标记的 AFs 定位不同,该研究为揭示细胞板形成机制提供了新视角。

  在植物的生长过程中,细胞分裂就像一场有序的 “生命之舞”,而细胞板的形成则是这场舞蹈中的关键环节。细胞板会在细胞分裂时出现,它就像一堵逐渐筑起的 “墙”,把一个细胞分成两个新的细胞。在这个过程里,有一群 “小帮手” 起着重要作用,那就是由微管(MTs)、肌动蛋白微丝(AFs)、膜以及相关蛋白组成的成膜体(phragmoplast)。不过,一直以来,AFs 在细胞板形成初期的具体位置和作用都充满了谜团,就像隐藏在迷雾中的宝藏,等待着科学家们去探索发现。为了揭开这些谜团,来自日本山口大学、熊本大学和东北大学等机构的研究人员开展了一项极具意义的研究。他们的研究成果发表在《Plant Cell Reports》上,为我们深入了解植物细胞分裂的奥秘提供了重要线索。
研究人员主要运用了以下关键技术方法:首先是利用不同的荧光蛋白标记技术,让烟草 BY-2 细胞中的 MTs 和 AFs 能够发出荧光,便于观察;其次,使用深度学习(deep learning) - 基于图像恢复技术,对获取的图像进行处理,提升图像质量;此外,通过显微镜对细胞进行三维时间推移(4D)成像观察,记录细胞变化过程。

研究结果


  1. 图像恢复模型的准确性:研究人员训练了基于深度学习的图像恢复模型。他们发现,训练图像的质量和数量对模型的准确性影响很大。质量越好、数量越多的训练图像,模型恢复图像的准确性就越高。例如,用 100 组训练图像训练的模型,对 50ms 曝光时间拍摄的低质量图像进行恢复后,得到的图像与 2000ms 长曝光拍摄的高质量图像很相似。这表明,这个模型可以在减少曝光时间的情况下,实现高分辨率的活细胞成像,降低对烟草 BY-2 细胞的损伤129
  2. 图像恢复对 3D 重建图像质量的影响:将图像恢复模型应用到观察 AFs 在细胞板形成初期(早期末期)的动态变化中,并对特定时间点的 Z 堆栈图像进行 3D 重建。结果显示,在早期末期,经过图像恢复后,Lifeact - RFP 标记的 AFs 荧光信号增强,信噪比提高,更适合进行 3D 结构分析;而在晚期末期,图像恢复对图像质量的提升相对较小34
  3. Lifeact - RFP 标记的 AFs 在细胞板形成初期的定位:通过对有丝分裂装置中平面的光学切片进行时间变化研究,发现经过图像恢复后,Lifeact - RFP 标记的 AFs 在细胞板形成部位清晰可见。而且,随着细胞板的扩展,在子核附近也能检测到它的信号。通过长曝光图像和 LatB 处理实验进一步验证,确认了在细胞板形成部位检测到的 Lifeact - RFP 标记的 AFs 信号确实来自 AFs56
  4. 不同探针标记的 AFs 在细胞板形成初期的定位差异:研究人员还用 RFP - ABD2 标记 AFs 进行分析,发现 RFP - ABD2 标记的 AFs 在细胞板形成早期很少定位在细胞板附近,而是在细胞板扩展时定位在子核附近。这和 Lifeact - RFP 标记的 AFs 定位模式不同,说明不同探针标记的 AFs 在细胞板形成初期的动态变化存在差异78

研究结论与讨论


这项研究意义重大。一方面,深度学习 - 基于图像恢复技术在烟草 BY-2 细胞活细胞成像中效果显著,能减少激光曝光的负面影响,提高时空分辨率。虽然该技术存在依赖训练数据等缺点,但通过合理选择训练图像,可以有效提升图像恢复的准确性。另一方面,研究揭示了不同探针标记的 AFs 在细胞板形成初期的动态差异,这表明特定类型的 AFs 可能参与了细胞板形成过程中的囊泡运输。未来对 Lifeact - RFP 和 RFP - ABD2 标记的 AFs 差异动态的研究,将帮助我们更深入地理解 AFs 在细胞板形成中的作用。总之,该研究不仅为植物细胞分裂机制的研究开辟了新方向,也为相关领域的进一步探索提供了重要的理论依据和技术参考。

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