多组学策略揭秘海湾扇贝（Argopecten irradians irradians）生长相关性状关键生物标志物及其在分子辅助育种中的意义

为推动贝类分子辅助选择育种发展，研究人员对以壳色为标记性状、生长性能为目标性状的选育和未选育海湾扇贝（Argopecten irradians irradians）鳃组织进行研究。通过多种技术，鉴定出相关候选 SNP、mRNA、miRNA 等，有助于海湾扇贝分子辅助育种技术发展。

　　在本研究中，为促进贝类分子辅助选择育种的发展，研究人员采集了经过选育（以壳色为标记性状、生长性能为目标性状）和未选育的海湾扇贝（Argopecten irradians irradians）的鳃组织样本。运用 2b 限制性位点相关 DNA 测序（2b-restriction site-associated DNA sequencing）、全基因组关联研究（genome-wide association study）、比较转录组分析、比较小 RNA 转录组分析、miRNA-mRNA 整合分析、实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（quantitative real-time reverse transcription-polymerase chain reaction）以及加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis）等技术，从基因组层面鉴定海湾扇贝中具有潜在选育价值的候选单核苷酸多态性（SNP）、信使核糖核酸（mRNA）、微小核糖核酸（miRNA）以及 miRNA/mRNA 对。结果显示，共有 6 个显著的 SNP 与至少两种检测的生长相关性状密切相关。此外，还鉴定出 10 个 mRNA 和 7 个 miRNA 与壳长、壳高、壳宽、总重和壳色呈正相关。这些候选 mRNA 和 miRNA 可能形成 11 对 miRNA-mRNA，对于开发海湾扇贝分子辅助选择育种的分子标记具有巨大潜力。本研究结果将有助于海湾扇贝养殖中分子辅助育种技术的发展。