中非共和国2011-2021年轮状病毒流行趋势与基因型分布:为疫苗引入提供关键基线数据

【字体: 时间:2025年05月09日 来源:BMC Infectious Diseases 3.4

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  为解决中非共和国(CAR)儿童轮状病毒(Group A Rotavirus, RVA)胃肠炎的高负担问题,Joel W. Dote团队开展了为期10年(2011-2021)的哨点监测研究。通过收集1855份<5岁腹泻患儿粪便样本,采用EIA检测和RT-PCR分型技术,发现RVA阳性率达46.0%,主导基因型为G1P8和G1P6。该研究首次系统揭示CAR轮状病毒基因型长期演变规律,为该国规划Rotarix?疫苗引入提供关键科学依据。

  

轮状病毒(Group A Rotavirus, RVA)是全球婴幼儿重症腹泻的头号病原体,每年导致约20万儿童死亡,其中撒哈拉以南非洲占最大比重。中非共和国(CAR)作为全球最不发达国家之一,长期面临医疗卫生资源匮乏和政局动荡的双重挑战,儿童腹泻病负担尤为沉重。尽管世界卫生组织(WHO)早在2009年就推荐各国将轮状病毒疫苗纳入常规免疫规划,但CAR至今尚未引入疫苗,部分原因在于缺乏本土流行病学数据支撑决策。

为填补这一关键空白,中非巴斯德研究所(Institut Pasteur de Bangui)联合美国疾控中心(CDC)等机构开展了长达10年的前瞻性研究。研究团队选择首都班吉的儿科教学医院作为哨点,按照WHO标准收集1855例<5岁腹泻患儿的粪便样本,采用酶联免疫吸附试验(EIA)筛查RVA抗原,阳性样本进一步通过半巢式逆转录PCR(RT-PCR)进行VP7(G型)和VP4(P型)基因分型。

主要技术方法包括:1)基于WHO标准的腹泻病例定义进行哨点监测;2)使用ProSpecT? EIA试剂盒检测RVA抗原;3)QIAamp病毒RNA提取试剂盒获取dsRNA;4)型特异性引物多重PCR进行G/P分型;5)10%样本送CDC和南非国家传染病研究所(NICD)进行质量复核。

研究结果
流行病学特征
在1855份样本中检出854例RVA阳性(46.0%),显著高于西非多国报告水平。发病高峰集中在11月至次年3月的旱季,2月达峰值(季节性分布图未展示)。6月龄以下婴儿感染率最高(52.2%),印证婴幼儿是RVA主要易感人群。

基因型分布
成功完成660份(77.3%)阳性样本分型,发现:

  • G型谱:G1(35.4%)>G2(26.6%)>G12(14.1%)
  • P型谱:P6>P8>P4
  • 优势组合:G1P8、G1P6、G2P6

时间动态
G1型持续流行(2012-2021),G12型2013年突然出现并持续至2018年,G9型2017年后消失,而G3型2016年起成为新流行株。值得注意的是,22.7%毒株未能分型,提示可能存在现有引物未覆盖的新变异株。

讨论与意义
该研究首次系统描绘了CAR轮状病毒基因型的十年变迁史:

  1. 疫苗匹配性:虽然主导株G1P[8]与Rotarix?(G1P[8])完全匹配,但P[6]型占比高达42.7%值得关注。不过坦桑尼亚和巴西研究显示Rotarix?对G12P[6]等异源毒株仍具交叉保护。
  2. 监测价值:发现G12等新兴毒株的输入性传播,证实非洲地区毒株交流活跃。非分型毒株的高比例呼吁建立基于全基因测序的强化监测。
  3. 政策支撑:为CAR计划2025年引入轮状病毒疫苗提供关键基线数据,并建立可评估疫苗效果的监测框架。

这项发表于《BMC Infectious Diseases》的研究不仅揭示了CAR独特的RVA流行谱,更凸显了在资源匮乏地区持续开展病原监测的科学价值。未来研究需关注疫苗引入后非疫苗型毒株(G12、P[6])的替代现象,以及如何通过分子流行病学网络加强非洲地区的联防联控。

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