AI 助力肾脏疾病诊断:精准量化肾小球形态学指标的新突破

【字体: 时间:2025年05月09日 来源:Computer Methods and Programs in Biomedicine

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  在肾脏疾病诊断中,测量肾小球基底膜(GBM)厚度和评估足细胞足突消失百分比(% PFPE)意义重大,但手动评估存在诸多问题。研究人员开发基于深度学习的流程开展研究,结果显示 DeepLabV3 + 模型表现更优。该研究为肾脏疾病诊断提供新方法。

  在医学领域,肾脏疾病的准确诊断一直是关键问题。肾小球基底膜(GBM)厚度以及足细胞足突消失百分比(% PFPE),对于诊断诸如糖尿病肾小球硬化症、狼疮性肾炎等非肿瘤性肾脏疾病有着至关重要的作用。GBM 作为肾脏肾小球过滤屏障的一部分,其厚度变化往往能反映出病理改变。而足细胞足突的状态,同样是判断肾脏健康状况的重要指标。
以往,肾病理学家主要依靠透射电子显微镜(EM)获取的高分辨率图像来手动测量 GBM 厚度和评估 PFPE。然而这种传统方法面临着重重困境。一方面,不同的肾病理学家由于经验和测量标准的差异,会导致测量结果出现显著的观察者间差异,严重影响了结果的可重复性和临床实用性。另一方面,肾脏组织中存在的各种超微结构变化,像电子致密沉积物(EDDs,通常代表免疫复合物沉积)以及 GBM 重塑(常表现为 GBM 增厚),会干扰 GBM 和足细胞足突的观察,使得评估工作变得更加复杂,甚至可能导致误诊或对疾病情况的低估。此外,不同实验室缺乏标准化的操作流程和校准方法,也为 GBM 等测量结果引入了更多的不确定性。

为了突破这些困境,来自国外(文中未明确具体研究机构名称,仅提及数据收集获 Cedars-Sinai 医学中心机构审查委员会批准)的研究人员开展了一项极具创新性的研究。他们开发了一种全新的基于深度学习(DL)的流程,旨在减少人为误差,提高 GBM 厚度和 % PFPE 量化的一致性与效率。

该研究具有重要意义。它为肾脏疾病的诊断提供了更精准、客观的量化指标,有助于提高诊断的准确性和可靠性,推动肾脏疾病诊断技术的发展,也为后续的临床治疗和疾病监测提供了更有力的支持。该研究成果发表在《Computer Methods and Programs in Biomedicine》上。

研究人员在这项研究中运用了多种关键技术方法。首先,他们收集了 83 名受试者的肾脏活检样本,这些样本涵盖了 21 种肾小球异常疾病以及部分非肾小球疾病。样本经过标准流程处理后用于 EM 成像。接着,研究人员使用了两种深度学习模型,即 DeepLabV3 + 和 U-Net。其中,DeepLabV3 + 采用在 ImageNet 数据集上预训练的 ResNet-18 作为骨干网络,U-Net 则是此前研究中常用的模型。研究人员利用这两种模型对 EM 图像进行语义分割,并通过算法对预测的 GBM 和足细胞掩模进行分析,从而自动测量 GBM 厚度的校正调和均值(cmGBM)和估计 % PFPE。最后,将自动测量结果与由 5 名临床医生确定的真值(GT)掩模以及资深肾病理学家手动测量的结果进行统计比较。

研究结果


  1. 模型评估结果:在 31 张测试集图像中,DeepLabV3 + 模型表现出色,其全局准确率(gACC)达到 92.8%,加权交并比(wIoU)为 0.869,优于 U-Net 模型(gACC 为 88.9%,wIoU 为 0.800)。这表明 DeepLabV3 + 在对 EM 图像中各类结构的识别和分割上更为准确。
  2. GBM 厚度测量结果:从 DeepLabV3 + 模型生成的掩模得出的 cmGBM 与基于 GT 掩模测量的结果一致性极佳,组内相关系数(ICC)达到 0.991(p < 0.001);U-Net 模型生成的 cmGBM 与 GT 掩模测量结果也有较好的一致性(ICC = 0.881,p < 0.001)。这说明两种模型在测量 GBM 厚度方面都有一定的可靠性,但 DeepLabV3 + 表现更为突出。
  3. % PFPE 估计结果:使用 DL 生成的足细胞掩模估计的 % PFPE 与基于 GT 的结果高度一致,DeepLabV3 + 和 U-Net 的 ICC 值分别为 0.926 和 0.928。这表明两种模型在评估足细胞足突消失情况方面都较为可靠。
  4. Bland-Altman 图分析结果:Bland-Altman 图显示,从 DeepLabV3 + 模型生成的掩模得到的 cmGBM 和 % PFPE 存在正偏差,而从 U-Net 模型生成的掩模得到的 cmGBM 和 % PFPE 存在负偏差。不过,在测量 cmGBM 时,DeepLabV3 + 模型生成的掩模提供的一致性界限(LoA)范围比 U-Net 模型更窄,这意味着 DeepLabV3 + 模型在测量 cmGBM 时更为精确。

研究结论与讨论


这项研究充分展示了人工智能在评估肾脏疾病 EM 图像方面的巨大潜力。通过精确的图像分割模型,研究人员开发的流程能够比现有方法更可靠地测量 GBM 厚度,更精准地量化 % PFPE。DeepLabV3 + 模型在整体性能上优于 U-Net 模型,为肾脏疾病的诊断提供了更准确、客观的量化依据。

然而,研究也存在一定的局限性。虽然该流程在测量方面表现出色,但在实际临床应用中,还需要进一步优化和验证,以确保其在不同临床环境下的稳定性和可靠性。此外,研究中使用的样本数量相对有限,未来需要更大规模的研究来进一步验证该方法的有效性。

尽管如此,该研究成果依然为肾脏病理学诊断的发展开辟了新的道路。随着技术的不断进步和完善,这种基于人工智能的方法有望广泛应用于临床实践,提高肾脏疾病的诊断效率和准确性,为患者的治疗和管理提供更有力的支持,推动肾脏病理学诊断向更精准、更高效的方向发展。

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