基于FDA批准药物库的尼帕病毒治疗药物计算筛选与分子机制研究

为解决尼帕病毒(NiV)缺乏有效治疗药物的难题，研究人员通过计算药物重定位策略，对4344种FDA批准药物进行分子对接和动力学模拟筛选，发现Guamecycline等5种药物与关键靶点Ephrin-B2具有显著结合活性，其中Guamecycline的稳定相互作用尤为突出。该研究为NiV的应急治疗提供了快速转化应用的候选药物。

　　

尼帕病毒(NiV)作为致死率高达90%的人畜共患病病原体，自1999年暴发以来持续威胁东南亚公共卫生安全。这种通过果蝙蝠传播的病毒能引发致命性脑炎，但全球至今未有批准的特效药或疫苗。传统药物研发周期长达10-15年，面对突发疫情显得缓不济急。在此背景下，维韦卡南达教育机构的研究团队另辟蹊径，采用"老药新用"策略，通过整合计算生物学手段，从现有药物库中挖掘抗NiV的潜在治疗方案，相关成果发表于《Computational Toxicology》。

研究团队运用分子对接技术评估4344种FDA批准药物与NiV入侵关键受体Ephrin-B2的结合能力，结合分子动力学(MD)模拟分析复合物稳定性，并采用网络药理学方法验证靶点通路相关性。通过构建包含141个节点、192条边的蛋白互作网络，确认Ephrin-B2在hsa04360通路中的核心地位。

重要发现显示：四环素类抗生素Guamecycline以-12.3 kcal/mol的对接评分脱颖而出，其结合能力优于麦角胺(-11.7 kcal/mol)等临床药物。MD模拟揭示Guamecycline能稳定占据Ephrin-B2的疏水口袋，关键残基Tyr¹²⁰和Glu⁵⁶形成持续氢键。结构优化发现其亚结构ZINC000169368545虽保持活性，但母核结构的结合稳定性更优。

网络药理学分析证实Ephrin-B2与EPHB1、PLXNB2等蛋白存在协同作用，涉及病毒内吞和免疫逃逸机制。特别值得注意的是，Guamecycline可同时干扰RAC1/CDC42信号轴，这可能是其广谱抗病毒潜力的结构基础。

该研究首次系统论证FDA批准药物抗NiV的应用前景，建立"计算筛选-动力学验证-网络机制"三位一体的药物重定位范式。Guamecycline作为优先候选药物，其已知的人体安全性将大幅缩短临床转化周期，为应对NiV疫情提供及时的战略储备。研究揭示的亚结构优化策略，也为后续抗病毒药物设计提供了可拓展的分子模板。