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为解决传统污水监测局限于人类病毒,难以检测动物及人畜共患病毒的问题,研究人员开展城市污水中动物及人畜共患病毒监测研究。结果在污水中检测到多种动物病毒,该研究为公共卫生监测提供新视角,助力 “同一健康”(One Health)理念实施。
在城市这个充满生机与奥秘的 “大容器” 里,人类与各种动物共同生活,彼此的联系千丝万缕。然而,在这看似平常的共处背后,却隐藏着一个关乎健康的重大危机 —— 动物病毒与人畜共患病毒的潜在威胁。
近年来,各类动物病毒引发的疫情频繁出现,像 H5N1 禽流感,不仅让大量家禽 “中招”,还跨物种传播到人类身上,搅得公共卫生领域不得安宁。传统的污水监测方法主要盯着人类病毒,就像戴着有色眼镜,只看到了一部分,却忽视了动物病毒和人畜共患病毒的踪迹。而且,以前的检测技术也有局限,像 qPCR 等方法,得提前知道要检测什么病毒,要是遇到新病毒或者不常见的病毒,就只能 “抓瞎” 了。在这样的情况下,为了打破监测的 “瓶颈”,拓展对病毒的认知边界,来自国外的研究人员开启了一项至关重要的研究。
这项研究成果发表在《Environment International》杂志上,研究人员把目光聚焦在城市污水,试图从中挖掘出动物及人畜共患病毒的 “秘密”。他们的研究就像是一场精心策划的 “病毒大搜索” 行动,为公共卫生安全筑牢防线。
研究人员用到了几个关键技术方法。在样本采集方面,他们从比利时的鲁汶(Leuven)和布鲁塞尔(Brussels)的污水处理厂收集了 6 份污水样本,采用自动化时间比例采样器,每 10 分钟收集 50mL 样本,最终得到一整天的混合污水样本。在实验室分析环节,样本经过预处理、核酸提取、cDNA 合成等步骤后,利用 TWIST 综合病毒捕获面板进行目标富集,最后在 AVITI 测序平台上测序。数据分析则借助 EsViritu 工具,通过一系列复杂的操作,筛选出符合条件的病毒序列进行深入研究。
下面来看看具体的研究结果:
- 目标富集法获取大量病毒基因组信息:研究人员总共记录了 2294 次病毒检测结果,44.8%(1030/2294)的一致性序列(完整基因组或片段)完整性超过 50%。在 6 个原始样本中,每个样本都包含 124 - 162 种病毒,主要来自 6 个病毒家族。进一步分析发现,虽然映射到动物病毒的读数较少,但依然鉴定出了 51 种动物病毒和 135 种人类相关病毒。这表明目标富集法能有效获取大量病毒基因组信息,即使动物病毒含量相对较少也能被检测到。
- 杂交捕获法检测多种感染人和动物的病毒:鲁汶和布鲁塞尔污水处理厂的污水样本中,病毒属的分布相似,且发现了多种仅感染动物的病毒属,以及能感染人和动物的病毒属。这说明杂交捕获法可以全面检测出感染人和动物的各种病毒,为了解病毒的宿主范围提供了重要依据。
- 城市环境中存在临床相关的动物感染病毒:研究人员鉴定出多种感染家畜、鸟类、啮齿动物和昆虫的病毒,其中一些病毒的基因组完整性超过 75%。像鸽子圆环病毒、猫博卡细小病毒 2、犬细小病毒等,这些病毒对动物健康有重要影响。而且,还发现了一些具有人畜共患潜力的病毒,如猪托罗病毒、戊型肝炎病毒(HEV)等。这提示城市环境中动物感染病毒的情况较为复杂,存在潜在的人畜共患风险。
- 检测到多种与动物相关的致病病毒:在污水样本中,研究人员检测到了多个动物相关的致病病毒。例如,细小病毒科(Parvoviridae)和圆环病毒科(Circoviridae)的病毒,这些病毒会对猫狗、幼猪和鸟类造成严重危害。此外,还检测到托罗病毒、罗萨病毒、心病毒等,并且通过分析发现这些病毒与已知病毒株有一定的相似性。这进一步证实了污水中存在多种动物相关致病病毒,需要引起重视。
- 人畜共患病原体在污水中持续被检测到:在所有样本中都检测到了戊型肝炎病毒(Paslahepevirus balayani,HEV)和大鼠肝炎病毒(Rocahepevirus ratti)。对 HEV 的分析发现,检测到的毒株为 HEV - 3c,与德国野猪株和法国人类株相似度较高,且在比利时污水中持续存在。Rocahepevirus ratti也在所有样本中被检测到,部分样本基因组完整性超过 50%,经迭代映射后完整性超过 90%。这表明这些人畜共患病原体在城市污水中广泛存在,需要加强监测。
综合研究结论和讨论部分,这项研究意义非凡。它首次证实了城市污水中蕴含着丰富的动物病毒信息,这为监测动物病毒和人畜共患病毒提供了一个全新的视角。通过污水监测,就像是给公共卫生安全安装了一个 “早期预警系统”,能够提前发现潜在的病毒威胁,及时制定防控策略。而且,研究人员还发现了一些病毒的潜在传播途径,比如 HEV 可能通过食物传播,这为预防和控制这些病毒的传播提供了重要线索。
不过,研究也存在一些不足。样本量比较小,只从两个城市收集了 6 份污水样本,可能无法全面反映所有动物病毒的情况。而且,检测策略依赖杂交捕获法,对于那些与已知序列相似度低的病毒可能会漏检。此外,分析主要集中在单个一致性基因组,不能完全展现污水中病毒群体的复杂性。但即便有这些局限,这项研究依然为后续的研究指明了方向。未来,可以扩大样本量,改进检测技术,更深入地研究污水中的病毒,为保障人类和动物的健康做出更大的贡献。