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为探究粪肥施用和四环素(TC)污染对土壤四环素抗性基因(TRGs)等的影响,研究人员开展种植小白菜的盆栽实验。结果表明,植被改变土壤微生物结构等,影响 TRGs 传播。该研究为管控农业活动中 ARG 风险提供依据。
在农业生产中,粪肥的使用越来越普遍,因其能为土壤提供丰富的养分,改善土壤结构和肥力。然而,这也带来了一系列令人担忧的问题。粪肥常常含有抗生素和抗生素抗性基因(ARGs),这些物质进入土壤后,可能会在土壤中持续存在,并通过各种途径传播,对生态环境和人类健康构成潜在威胁。四环素(TC)类抗生素在全球范围内使用广泛,在农业土壤中也检测到了高浓度的 TC 和大量的四环素抗性基因(TRGs)。尽管此前有不少研究关注抗生素污染或粪肥施用对土壤酶和 ARGs 的影响,但植被在其中所起的作用以及 TRGs 的响应变化仍不明确。在这样的背景下,河南大学的研究人员开展了一项研究,试图揭开这些谜团,该研究成果发表在《Environmental Technology 》上。
研究人员采用了多种关键技术方法。首先进行盆栽实验,设置不同粪肥施用量(0、1%、2%)和 TC 污染水平(0、5、10、15mg/kg),并分植被组和非植被组进行对比。实验结束后,从不同处理的土壤中采样,运用 UPLC-MS/MS 技术测定土壤中 TC 残留量;利用 DNA 提取试剂盒和实时荧光定量 PCR 系统检测 16S rDNA、TRGs(如 tetA、tetB/P 等 9 种)和 intI1 基因的丰度;使用土壤酶活性检测试剂盒和分光光度计测定土壤酶活性;通过扩增子测序分析细菌群落结构。同时,运用多种数据分析方法,如方差分析、Spearman 相关性分析、主成分分析(PCA)和网络分析等,深入探究各因素之间的关系。
研究结果
- 土壤中残留的 TCs:TCs 在土壤中易降解,但粪肥施用会增加其残留浓度。在低 TC 浓度下,植被促进 TCs 分解;而在高 TC 污染且高粪肥用量的条件下,植被对不同 TCs 的影响不同,降低了土霉素(OTC)和金霉素(CTC)浓度,却增加了四环素(TC)浓度。这表明小白菜的根际环境对不同类型 TCs 的消散有偏好。
- 土壤酶活性
- 土壤多酚氧化酶(S-PPO):TC 污染和大量粪肥施用均会影响 S-PPO 活性。在无植被的 S0 处理中,非植被土壤的 S-PPO 活性较高;而在高 TC - 粪肥条件下,植被土壤的 S-PPO 活性更优,这说明根际分泌物能缓解 TC 的毒性,维持土壤碳循环。
- 土壤脲酶(S-UE)和土壤脱氢酶(S-DHA):TC 污染和粪肥施用对 S-UE 活性影响不显著,但在 S0T0 处理中,植被和非植被组的 S-UE 活性存在显著差异。TC 污染会抑制 S-DHA 活性,粪肥施用也会降低其活性,不过植被能在无 TC 条件下降低土壤酶活性,且在 TC 压力下酶活性稳定性更高,避免影响土壤养分循环。
- 土壤中 16S rDNA、intI1 和 TRGs 的丰度
- 对 TC 污染的响应:TC 污染使土壤中 16S rDNA 的绝对丰度(AAs)下降,植被组中其 AAs 显著增加。intI1 的 AAs 在 TC 污染下无显著变化,非植被组中其相对丰度(RAs)随 TC 浓度增加而上升。不同 TRGs 对 TC 污染的响应各异,非植被组中多数 TRGs 的 RAs 增加,而植被组中则较低,这可能与植被促进土壤微生物对 TCs 的降解有关。
- 对粪肥施用的响应:粪肥施用增加了 16S rDNA 和 intI1 的 AAs,也改变了 TRGs 的丰度。不同 TRGs 对粪肥施用的响应不同,如 tetO、tetM 和 tetX 的丰度增加,而 tetC 的丰度下降。
- TC 污染和粪肥施用的联合效应:在非植被组中,高量粪肥与 TC 污染联合抑制土壤微生物,使 16S rDNA 的 AAs 显著下降;在植被组中,低 TC 污染下粪肥施用增加了 16S rDNA 的 AAs。同时,高量粪肥与植被的联合作用可能促进根际土壤中 TRG 的水平基因转移(HGT)。在植被组中,不同 TRGs 的 AAs 和 RAs 变化趋势不同,总体上植被土壤中 TRGs 的 AAs 较高,但 RAs 较低。
- PCA 分析:PCA 分析表明,不同处理对移动遗传元件(MGE)和 TRGs 有不同贡献。非植被组中,TC 污染或粪肥单独施用时,土壤倾向于不表达 tetC;而植被组中,随着 TC 浓度或粪肥含量增加,tetC 表达下降,且根际分泌物可能稳定根际生态并增强对 TCs 的消散作用。此外,高量粪肥处理下,tetO、tetM 和 tetX 与粪肥处理呈正相关,这表明微生物对 TCs 的抗性机制可能主要受粪肥施用或植被影响。
- 细菌群落与 TRGs 的相关性
- 土壤微生物组成的变化:植被改变了根际细菌群落,促进了放线菌(Actinobacteria)的富集,抑制了蓝细菌(Cyanobacteria)的生长。粪肥施用使变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidota)和厚壁菌门(Firmicutes)等优势菌群富集。不同处理下,土壤微生物群落结构差异显著,植被增强了 TC 降解细菌的丰度,降低了土壤中 TC 浓度,减轻了对土壤微生物的选择压力,这可能是植被组中 TRGs 相对丰度较低的原因之一。
- Spearman 相关性分析:Spearman 相关性分析显示,粪肥来源的细菌与本地细菌存在竞争关系,且与土壤中 TC 残留相关。同时,不同细菌门与土壤酶活性、TRGs 的相关性在不同处理下有所不同。植被促进了土壤微生物间的 HGT,在粪肥和植被共同作用下,更多微生物门与 TRGs 和 intI1 呈正相关,这表明植被可能通过 HGT 促进 TRGs 在土壤微生物间的传播,增加了 TRGs 传播风险。
- 网络分析:网络分析表明,在非植被组中,Xanthomonadaceae 与 intI1 和多种 TRGs 高度相关,对 TRGs 传播至关重要;在植被组中,Xanthomonadaceae 依然是 intI1 和 TRGs 的主要宿主之一。此外,植被和粪肥施用改变了优势 TRGs 和抗性机制,高量粪肥与 TC 污染会引入更多粪肥来源的细菌,通过抗性细菌(TRB)增殖传播 TRGs;而植被根际分泌物可稳定细菌群落,使 TRGs 传播方式转变为 HGT,且根际中更强的 HGT 可能导致更高的 TRB 多样性,增加了人类健康风险。
研究结论与讨论
该研究全面揭示了植被在 TC - 粪肥条件下对土壤生态的重要作用。植被在非 TC 条件下降低土壤酶活性,但增强了其稳定性,维持了土壤养分循环。植被提高了 16S rDNA 的 AAs,但在 TC - 粪肥处理下,联合抑制作用仍显著降低了其 AAs。同时,粪肥施用与植被共同作用导致 intI1 和多种 TRGs 的 AAs 和 RAs 升高。
研究还发现,粪肥施用和植被均改变了土壤微生物群落结构。在植被存在的情况下,TRG 的传播机制转变为根际中的 HGT,其中 Bacteroidota 和 Firmicutes 是参与 TRG 传播的核心类群,Xanthomonadaceae 可能是主要的 TRG 宿主之一。这些结果强调了关键类群在农业活动中对 ARG 风险管控的重要性,为后续研究提供了重要参考,有助于制定更合理的农业管理策略,减少 ARGs 对生态环境和人类健康的潜在威胁。