揭秘谷子品质差异:代谢组与转录组联合分析的新突破

【字体: 时间:2025年05月09日 来源:Food Chemistry: Molecular Sciences 4.2

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  消费者对优质谷子需求渐长,然而其品质相关代谢物及形成机制不明。研究人员对比优质 JG21 和普通 NMB 谷子品种,进行代谢组和转录组分析。发现 144 种差异代谢物,主要富集于黄酮和苯丙烷途径,明确 14 个关键调控基因。为谷子品质改良育种提供依据。

  在粮食的大舞台上,谷子(Setaria italica)凭借独特魅力占据重要位置。它起源于中国北方,适应干旱、土壤贫瘠和高盐等恶劣环境,积累了多种有益代谢物,对人体健康益处多多,如调节血糖、抗炎和促进消化等。而且,它不含麸质,营养丰富,是极具潜力的 C4 模式植物。但目前,人们对谷子生长发育过程中的代谢物及其调控基因了解有限。同时,谷子加工产品口感欠佳,市场销量不高。如何在保留其高营养价值的同时提升口感品质,成为亟待解决的问题。在此背景下,山西农业大学的研究人员挺身而出,开展了一项意义非凡的研究,相关成果发表在《Food Chemistry: Molecular Sciences》上。
研究人员为解决上述问题,采用了多种关键技术方法。首先,他们精心挑选了山西地区的两个代表性谷子品种,优质的 Jingu 21(JG21)和口感相对较差的 Niumaobai(NMB),在实验基地种植并采集两个关键灌浆期(早期 S2 和晚期 S4)的样本。接着,利用广泛靶向代谢组学技术,借助超高效液相色谱 - 串联质谱(UPLC - MS/MS)分析代谢物;通过构建 cDNA 文库和高通量测序进行转录组分析。运用多种统计方法筛选差异代谢物和基因,还用 qRT - PCR 技术验证转录组数据。

下面来看具体的研究结果:

  • 代谢物谱分析:研究人员在谷子灌浆期共鉴定出 552 种代谢物,涵盖 32 类,其中黄酮类及其衍生物是最丰富的次生代谢物。对比 JG21 和 NMB,发现 144 种差异代谢物,主要集中在黄酮类及其衍生物、羟基肉桂酰衍生物和脂质及其衍生物。聚类分析显示,不同品种和灌浆期的代谢物存在明显差异。在早期 S2 和晚期 S4 灌浆期,JG21 和 NMB 分别有 186 和 180 种代谢物变化显著,其中 108 种变化相似,且 JG21 和 NMB 分别有 78 和 72 种独特变化的代谢物。
  • 关键代谢途径分析
    • 黄酮类生物合成途径:在黄酮类生物合成途径中,发现 11 种与 JG21 和 NMB 品质差异相关的差异积累代谢物。以柚皮素查尔酮到毛地黄黄酮(chrysoeriol)的子途径为例,JG21 中柚皮素查尔酮积累是因为两个查尔酮合酶(CHS)基因(Seita.9G142900 和 Seita.9G216100)表达上调,随后查尔酮异构酶(CHI)基因(Seita.9G034700)高表达使柚皮素积累。柚皮素转化为木犀草素(luteolin)有多条途径,相关酶基因在 JG21 中高表达促进了木犀草素等物质积累。此外,三个黄酮类 3'-O - 甲基转移酶(F3'OMT)基因在 JG21 中高表达,促进了毛地黄黄酮积累。而 NMB 中木犀草素在灌浆期可能转化为下游代谢物,导致其含量与 JG21 差异明显。
    • 苯丙烷类生物合成途径:研究发现苯丙烷类生物合成途径中,5 种中间产物(芥子醛、松柏醇、对香豆醇、松柏醛和咖啡酸)在 JG21 中积累量显著高于 NMB,它们是木质素前体,影响谷物硬度和质地,而丁香苷在 JG21 中含量较低。多组学整合分析揭示了该途径的基因 - 代谢物调控网络,多个基因参与其中。同时,研究还发现 JG21 中木质素生物合成单体含量较高,但大多数与木质素形成相关的漆酶和过氧化物酶基因在 NMB 中表达更高,这或许解释了 JG21 木质素含量较低、口感不那么粗糙的原因。对 5 个相关基因进行 qRT - PCR 分析,结果验证了转录组数据的可靠性。


研究结论和讨论部分意义重大。研究表明,黄酮类化合物可能是影响谷子生长发育的关键代谢物,在调节谷物色泽、营养和口感方面发挥重要作用。例如,白杨素(eriodictyol)和毛地黄黄酮可减轻苦味,木犀草素有助于形成光滑质地和芳香风味;而 NMB 中含量较高的儿茶素和黄腐酚则与苦味、粗糙口感相关。苯丙烷类化合物在植物生长、防御和谷物品质方面也具有双重功能,其代谢途径中的木质素虽能增强作物抗逆性,但会影响口感。研究人员通过整合多组学方法,确定了 14 个核心调控基因,为理解谷子感官特性的代谢基础提供了初步分子依据。不过,目前研究尚未通过实验验证基因 - 代谢物调控网络的因果关系,未来还需利用功能基因组学方法进一步研究。这项研究为谷子品质改良育种指明了方向,有助于培育出营养丰富、口感更佳的谷子品种,让谷子在健康饮食领域绽放更耀眼的光芒。

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